Хлорофлексовые

Порядок бактерий

Хлорофлексовые
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Домен:Бактерии
Тип:Хлорофлексота
Сорт:Хлорофлексия
Заказ:Chloroflexales
Гупта и др. 2013
Семьи
  • Хлорофлексины
    • Хлорофлексовые
    • Осциллохлоридовые
  • Roseiflexineae
    • Roseiflexaceae

Chloroflexales — это отряд бактерий в классе Chloroflexia . [1] Клада также известна как нитчатые аноксигенные фототрофные бактерии (FAP), [2], поскольку отряд содержит фототрофы , которые не производят кислород. Эти бактерии являются факультативными аэробами. [3] Они обычно используют хемотрофию , когда присутствует кислород, и переключаются на световую энергию, когда его нет. Большинство видов являются гетеротрофами , но некоторые способны к фотоавтотрофии . [2]

Отряд можно разделить на два подотряда. Chloroflexineae («Зеленый FAP», «зеленые несерные бактерии») — наиболее известный из них. Этот подотряд использует хлоросомы , специализированный антенный комплекс, для передачи световой энергии в реакционный центр. Roseiflexineae («Красный FAP»), с другой стороны, не имеет такой способности. Названные цвета не являются абсолютными, поскольку условия роста, такие как концентрация кислорода, заставят зеленый FAP казаться зеленым, коричневым или красновато-оранжевым, вызывая изменения в составе пигмента. [2]

Классификация

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [4] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). [5]

Филогения

LTP на основе 16S рРНК _10_2024 [6] [7] [8]120 маркерных белков на основе GTDB 09-RS220 [9] [10] [11]
Каллотенуалес
Каллотеновые

Каллотенуэ

Герпетосифоналес
Герпетосифоновые

Герпетосифон

Хлорофлексовые
Roseiflexaceae

Розеифлексус

Хлорофлексовые

Гелиотрикс

Осциллохлорис

Хлорофлексус

Хлорофлексовые
Каллотеновые

Каллотенуэ

Герпетосифоновые

Герпетосифон

Roseiflexaceae

Розеифлексус

" Калифорния Рибейелла"

" Кулеотрикс "

Хлорофлексовые

Хлорофлексус

Осциллохлорис

" Калифорния Хлороплока"

" Ca. Viridilinea"

Таксономия

  • Подотряд Roseiflexineae Gupta et al. 2013 год
    • Семейство Roseiflexaceae Гупта и др. 2013 ["Kouleotrichaceae" Мехршад и др. 2018 ]
      • Род? Гелиотрикс Пирсон и др. 1986 г.
      • Род " Kouleothrix " Коно и др. 2002
      • Род « Candidatus Ribeiella» Petriglieri et al. 2023 год
      • Род Roseiflexus Hanada et al. 2002 г.
  • Подотряд Chloroflexineae Gupta et al. 2013 год
    • Семейство Chloroflexaceae Гупта и др. 2013
      • Род?" Candidatus Chloranaerofilum" Thiel et al. 2016 год
      • Род Chloroflexus Pierson & Castenholz 1974 [" Chlorocrinis " Ward et al. 1998 ]
    • Семейство Oscillochloridaceae Гупта и др. 2013
      • Род? ХлоронемаДубинина и Горленко 1975
      • Род « Candidatus Chloroploca» Горленко и др. 2014 год
      • Род Oscilloloris Горленко и Пивоварова 1989.
      • Род « Candidatus Viridilinea» Гроуздев и др. 2018 год

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Гаррити, Джордж М. (2001). Руководство Берджи по систематической бактериологии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer. С. 427–446. ISBN 978-0-387-21609-6.
  2. ^ abc Thweatt, Jennifer L.; Canniffe, Daniel P.; Bryant, Donald A. (2019). «Биосинтез хлорофиллов и бактериохлорофиллов в зеленых бактериях». Advances in Botanical Research . 90 : 35– 89. doi :10.1016/bs.abr.2019.03.002.
  3. ^ Gupta RS, Chander P, George S (2013). «Филогенетические рамки и молекулярные сигнатуры для класса Chloroflexia и его различных клад; предложение о разделении класса Chloroflexia class. nov. [исправлено] на подотряд Chloroflexineae subord. nov., состоящий из исправленного семейства Oscillochloridaceae и семейства Chloroflexaceae fam. nov., и подотряд Roseiflexineae subord. nov., содержащий семейство Roseiflexaceae fam. nov». Antonie van Leeuwenhoek . 103 (1): 99– 119. doi :10.1007/s10482-012-9790-3. PMID  22903492.
  4. ^ JP Euzéby. "Chloroflexales". Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре (LPSN) . Получено 20 июля 2022 г.
  5. ^ Sayers; et al. "Chloroflexales". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 20 июля 2022 г.
  6. ^ "The LTP" . Получено 10 декабря 2024 г. .
  7. ^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 10 декабря 2024 г. .
  8. ^ "LTP_10_2024 Release Notes" (PDF) . Получено 10 декабря 2024 г. .
  9. ^ "GTDB release 09-RS220". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
  10. ^ "bac120_r220.sp_labels". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
  11. ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Chloroflexales&oldid=1270299262"