КЛИК1

КЛИК1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1K0M, 1K0N, 1K0O, 1RK4, 3O3T, 3P8W, 3P90, 3QR6, 3SWL, 3TGZ, 3UVH, 4IQA, 4JZQ, 4K0G, 4K0N
Идентификаторы
Псевдонимы	CLIC1 , G6, NCC27, хлоридный внутриклеточный канал 1, CL1C1, CLCNL1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602872; МГИ : 2148924; гомологен : 20343; GeneCards : CLIC1; OMA :CLIC1 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 6 (человек)
Конец	31,739,763 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 17 (мышь)
Конец	35,277,725 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	гранулоцит; ; кровь; ; моноцит; ; слизистая оболочка поперечно-ободочной кишки; ; прямая кишка; ; желчный пузырь; ; островок Лангерганса; ; обонятельная зона слизистой оболочки носа; ; плацента; ; правое легкое;
	Верх выражен в
	строма роговицы; ; гранулоцит; ; верхняя поверхность языка; ; тимус; ; эндотелиальная клетка лимфатического сосуда; ; пилорический отдел желудка; ; губа; ; слизистая клетка желудка; ; дерма; ; шейка матки;
	Больше данных по справочным выражениям
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	активность потенциалзависимых ионных каналов; связывание белков; активность хлоридного канала; связывание кадгерина; активность глутатионтрансферазы;
Клеточный компонент	цитоплазма; неотъемлемый компонент мембраны; везикул; ядерная мембрана; микрочастица крови; ядерная оболочка; мембрана; плазматическая мембрана; комплекс хлоридных каналов; митохондрия; кисть границы; перинуклеарная область цитоплазмы; внеклеточная экзосома; ядро; внеклеточное пространство;
Биологический процесс	регуляция трансмембранного транспорта ионов; транспорт ионов; регуляция клеточного цикла; регуляция митохондриального мембранного потенциала; позитивная регуляция дифференциации остеобластов; транспорт хлорида; агрегация тромбоцитов; передача сигнала; хлорид трансмембранный транспорт; процесс метаболизма глутатиона; транспорт;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	1192
	114584
ENSG00000213719 ; ENSG00000223639 ; ENSG00000226248 ; ENSG00000226651 ; ENSG00000226417;
	ENSG00000230685 ; ENSG00000206394
	ENSMUSG00000007041
	О00299
	Q9Z1Q5
	НМ_001288 ; НМ_001287593 ; НМ_001287594
	NM_033444
	НП_001274522 ; НП_001274523 ; НП_001279
	NP_254279
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок внутриклеточного хлоридного канала 1 — это белок , который у людей кодируется геном CLIC1 . [ ^5]^[6]

Каналы хлорида представляют собой разнообразную группу белков, которые регулируют фундаментальные клеточные процессы, включая стабилизацию потенциала клеточной мембраны, трансэпителиальный транспорт, поддержание внутриклеточного pH и регуляцию объема клетки. Канал хлорида внутриклеточный 1 является членом семейства p64; белок локализуется в основном в ядре клетки и проявляет активность как ядерного, так и плазматического мембранного канала хлорида. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что CLIC1 взаимодействует с TRAPPC2 . ^[7]

Смотрите также

Хлоридный канал

Ссылки

^ abc ENSG00000223639, ENSG00000226248, ENSG00000226651, ENSG00000226417, ENSG00000230685, ENSG00000206394 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000213719, ENSG00000223639, ENSG00000226248, ENSG00000226651, ENSG00000226417, ENSG00000230685, ENSG00000206394 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000007041 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Valenzuela SM, Martin DK, Por SB, Robbins JM, Warton K, Bootcov MR, Schofield PR, Campbell TJ, Breit SN (июнь 1997 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия хлорид-ионного канала клеточных ядер». J Biol Chem . 272 (19): 12575– 82. doi : 10.1074/jbc.272.19.12575 . PMID 9139710.
^ ab "Ген Энтреза: CLIC1 внутриклеточный хлоридный канал 1".
^ Fan L, Yu Wei, Zhu Xueliang (апрель 2003 г.). «Взаимодействие Sedlin с белками внутриклеточных каналов хлорида». FEBS Lett . 540 ( 1– 3). Нидерланды: 77– 80. Bibcode : 2003FEBSL.540...77F. doi : 10.1016/S0014-5793(03)00228-X . ISSN 0014-5793. PMID 12681486. S2CID 8573651.

Дальнейшее чтение

Singh H (2010). «Два десятилетия с диморфными хлоридными внутриклеточными каналами (CLIC)». FEBS Letters . 584 (10): 2112– 21. Bibcode : 2010FEBSL.584.2112S. doi : 10.1016/j.febslet.2010.03.013. PMID 20226783. S2CID 21056278.
Окубо К, Хори Н, Матоба Р и др. (1994). «Крупномасштабное секвенирование ДНК для анализа количественных и качественных аспектов экспрессии генов». Nat. Genet . 2 (3): 173– 9. doi :10.1038/ng1192-173. PMID 1345164. S2CID 35309579.
Frigerio JM, Berthézène P, Garrido P и др. (1995). «Анализ 2166 клонов из библиотеки ДНК колоректального рака человека методом частичного секвенирования». Hum. Mol. Genet . 4 (1): 37– 43. doi :10.1093/hmg/4.1.37. PMID 7711732.
Singh H, Ashley RH (2006). «Регулирование окислительно-восстановительного потенциала CLIC1 остатками цистеина, связанными с предполагаемой порой канала». Biophys. J . 90 (5): 1628– 1638. Bibcode :2006BpJ....90.1628S. doi :10.1529/biophysj.105.072678. PMC 1367314 . PMID 16339885.
Liew CC, Hwang DM, Fung YW и др. (1994). «Каталог генов сердечно-сосудистой системы, идентифицированных по экспрессируемым последовательностям тегов». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 91 (22): 10645– 9. Bibcode :1994PNAS...9110645L. doi : 10.1073/pnas.91.22.10645 . PMC 45078 . PMID 7938007.
Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Heiss NS, Poustka A (1997). "Геномная структура нового гена хлоридного канала, CLIC2, в Xq28". Genomics . 45 (1): 224– 8. doi :10.1006/geno.1997.4922. PMID 9339381.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K и др. (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Tulk BM, Edwards JC (1998). "NCC27, гомолог внутриклеточного Cl-канала p64, экспрессируется в щеточной каемке проксимальных канальцев почек". Am. J. Physiol . 274 (6 Pt 2): F1140–9. doi : 10.1152/ajprenal.1998.274.6.F1140 . PMID 9841507. S2CID 39652235.
Chuang JZ, Milner TA, Zhu M, Sung CH (1999). «Внутриклеточный хлоридный канал p64H1 массой 29 кДа связан с крупными плотными везикулами в нейронах гиппокампа крысы». J. Neurosci . 19 (8): 2919– 28. doi : 10.1523/JNEUROSCI.19-08-02919.1999 . PMC 6782274 . PMID 10191309.
Ribas G, Neville M, Wixon JL и др. (1999). «Гены, кодирующие три новых члена суперсемейства лейкоцитарных антигенов 6 и нового члена суперсемейства Ig, вместе с генами, кодирующими регуляторный белок ядерного хлоридного иона (hRNCC) и гомолог N omega-N omega-диметиларгинин диметиламиногидролазы, обнаружены в сегменте размером 30 кб области MHC класса III». J. Immunol . 163 (1): 278– 87. doi :10.4049/jimmunol.163.1.278. PMID 10384126.
Берриман М., Бретшер А. (2000). «Идентификация нового члена семейства генов внутриклеточных каналов хлорида (CLIC5), который ассоциируется с актиновым цитоскелетом плацентарных микроворсинок». Mol. Biol. Cell . 11 (5): 1509– 21. doi : 10.1091 /mbc.11.5.1509. PMC 14863. PMID 10793131.
Тонини Р., Феррони А., Валенсуэла СМ. и др. (2000). «Функциональная характеристика ядерного белка NCC27 в стабильно трансфицированных клетках CHO-K1». FASEB J. 14 ( 9): 1171– 8. doi : 10.1096/fasebj.14.9.1171 . PMID 10834939. S2CID 30652670.
Valenzuela SM, Mazzanti M, Tonini R и др. (2001). «Ядерный хлоридный ионный канал NCC27 участвует в регуляции клеточного цикла». J. Physiol . 529 (3): 541– 52. doi :10.1111/j.1469-7793.2000.00541.x. PMC 2270212 . PMID 11195932.
Harrop SJ, DeMaere MZ, Fairlie WD и др. (2002). «Кристаллическая структура растворимой формы внутриклеточного хлоридного ионного канала CLIC1 (NCC27) при разрешении 1,4 А». J. Biol. Chem . 276 (48): 44993– 5000. doi : 10.1074/jbc.M107804200 . PMID 11551966.
Warton K, Tonini R, Fairlie WD и др. (2002). «Рекомбинантный CLIC1 (NCC27) собирается в липидных бислоях посредством pH-зависимого двухстадийного процесса с образованием каналов ионов хлора с идентичными характеристиками, наблюдаемыми в клетках яичников китайского хомячка, экспрессирующих CLIC1». J. Biol. Chem . 277 (29): 26003– 11. doi : 10.1074/jbc.M203666200 . PMID 11978800.
Shanks RA, Larocca MC, Berryman M и др. (2002). «AKAP350 в аппарате Гольджи. II. Ассоциация AKAP350 с новым членом семейства хлоридных внутриклеточных каналов (CLIC)». J. Biol. Chem . 277 (43): 40973– 80. doi : 10.1074/jbc.M112277200 . PMID 12163479.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Fan L, Yu W, Zhu X (2003). "Взаимодействие Sedlin с белками внутриклеточных каналов хлорида". FEBS Lett . 540 ( 1– 3): 77– 80. Bibcode :2003FEBSL.540...77F. doi : 10.1016/S0014-5793(03)00228-X . PMID 12681486. S2CID 8573651.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ человеческой хромосомы 6». Nature . 425 (6960): 805– 11. Bibcode :2003Natur.425..805M. doi : 10.1038/nature02055 . PMID 14574404.
Littler DR, Harrop SJ, Fairlie WD и др. (2004). «Внутриклеточный белок хлоридного ионного канала CLIC1 подвергается структурному переходу, контролируемому окислительно-восстановительным процессом». J. Biol. Chem . 279 (10): 9298– 305. doi : 10.1074/jbc.M308444200 . PMID 14613939.
Singh H, Cousin MA, Ashley RH (2007). «Функциональная реконструкция млекопитающих «хлоридных внутриклеточных каналов» CLIC1, CLIC4 и CLIC5 выявляет дифференциальную регуляцию цитоскелетным актином». FEBS J . 274 (24): 6306– 6316. doi :10.1111/j.1742-4658.2007.06145.x. PMID 18028448. S2CID 22494250.

Внешние ссылки

CLIC1+белок,+человек в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Расположение генома человека CLIC1 и страница с подробностями гена CLIC1 в браузере геномов UCSC .

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

Эта статья о мембранных белках является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000223639, ENSG00000226248, ENSG00000226651, ENSG00000226417, ENSG00000230685, ENSG00000206394 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000213719, ENSG00000223639, ENSG00000226248, ENSG00000226651, ENSG00000226417, ENSG00000230685, ENSG00000206394 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000007041 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9139710-5] Valenzuela SM, Martin DK, Por SB, Robbins JM, Warton K, Bootcov MR, Schofield PR, Campbell TJ, Breit SN (июнь 1997 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия хлорид-ионного канала клеточных ядер». J Biol Chem . 272 (19): 12575– 82. doi : 10.1074/jbc.272.19.12575 . PMID 9139710.

[entrez-6] "Ген Энтреза: CLIC1 внутриклеточный хлоридный канал 1".

[pmid12681486-7] Fan L, Yu Wei, Zhu Xueliang (апрель 2003 г.). «Взаимодействие Sedlin с белками внутриклеточных каналов хлорида». FEBS Lett . 540 ( 1– 3). Нидерланды: 77– 80. Bibcode : 2003FEBSL.540...77F. doi : 10.1016/S0014-5793(03)00228-X . ISSN 0014-5793. PMID 12681486. S2CID 8573651.