НОД2
Ген, кодирующий белок у человека

НОД2
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNOD2 , ACUG, BLAU, CARD15, CD, CLR16.3, IBD1, NLRC2, NOD2B, PSORAS1, домен олигомеризации связывания нуклеотидов, содержащий 2, BLAUS, YAOS
Внешние идентификаторыОМИМ : 605956; МГИ : 2429397; Гомологен : 11156; Генные карты : NOD2; OMA :NOD2 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

64127

257632

Ансамбль

ENSG00000167207

ENSMUSG00000055994

UniProt

Q9HC29

Q80SY9

РефСек (мРНК)

НМ_001293557
НМ_022162
НМ_001370466

NM_145857

RefSeq (белок)

НП_001280486
НП_071445
НП_001357395

NP_665856

Местоположение (UCSC)Хр 16: 50.69 – 50.73 МбХр 8: 89.37 – 89.42 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок 2, содержащий домен олигомеризации связывания нуклеотидов ( NOD2 ), также известный как белок 15, содержащий домен рекрутирования каспазы ( CARD15 ) или белок воспалительного заболевания кишечника 1 ( IBD1 ), представляет собой белок , который у людей кодируется геном NOD2, расположенным на хромосоме 16. [ 5] [6] NOD2 играет важную роль в иммунной системе . Он распознает бактериальные молекулы ( пептидогликаны ) и стимулирует иммунную реакцию. [7]

NOD2 — это внутриклеточный рецептор распознавания образов , который по своей структуре похож на резистентные белки растений и распознает молекулы, содержащие специфическую структуру, называемую мурамилдипептидом (МДП), которая встречается у некоторых бактерий . [8]

Структура

Модель белка NOD2, состоящая из двух N-концевых доменов CARD (красный), соединенных спиральным линкером (синий) с центральным доменом NOD (зеленый). На C-конце расположен домен LRR (голубой) [9]

C -концевая часть белка содержит богатый лейцином повторный домен, который, как известно, играет роль в белок-белковых взаимодействиях. Средняя часть белка характеризуется доменом NOD , участвующим в самоолигомеризации белка. N-концевая часть содержит два домена CARD, которые, как известно, играют роль в апоптозе и путях активации NF-κB . [10]

Функция

Этот ген является членом семейства NOD1 / Apaf-1 (также известного как семейство NOD-подобных рецепторов ) и кодирует белок с двумя доменами рекрутирования каспазы (CARD) и одиннадцатью богатыми лейцином повторами (LRR). Белок в основном экспрессируется в лейкоцитах периферической крови . Он играет роль в иммунном ответе, распознавая бактериальные молекулы, которые обладают фрагментом мурамилдипептида (MDP), и активируя белок NF-κB . [11]

Клиническое значение

Мутации в этом гене связаны с серьезными аутоиммунными заболеваниями, такими как болезнь Крона , [9] синдром Блау , саркоидоз легких [12] и реакция «трансплантат против хозяина» . [13] [14] [15]

Взаимодействия

Было показано, что NOD2 взаимодействует с NLRC4 . [16] [17]

Также было показано, что NOD2 связывается с MAVS в ответ на обработку ssRNA или вирусной РНК и активирует ответ IFN. Это первый отчет о NOD2, действующем как рецептор распознавания образов для вирусов. [18]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000167207 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000055994 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Gilberts EC, Greenstein AJ, Katsel P, Harpaz N, Greenstein RJ (декабрь 1994 г.). «Молекулярные доказательства двух форм болезни Крона». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (26): 12721– 4. Bibcode : 1994PNAS...9112721G. doi : 10.1073/pnas.91.26.12721 . PMC 45511. PMID  7809109 . 
  6. ^ Hugot JP, Laurent-Puig P, Gower-Rousseau C, Olson JM, Lee JC, Beaugerie L, Naom I, Dupas JL, Van Gossum A, Orholm M, Bonaiti-Pellie C, Weissenbach J, Mathew CG, Lennard-Jones JE, Cortot A, Colombel JF, Thomas G (февраль 1996 г.). «Картирование локуса восприимчивости к болезни Крона на хромосоме 16». Nature . 379 (6568): 821– 3. Bibcode :1996Natur.379..821H. doi :10.1038/379821a0. PMID  8587604. S2CID  4311407.
  7. ^ Mahla RS, Reddy MC, Prasad DV, Kumar H (сентябрь 2013 г.). «Подслащенные PAMP: роль сахарных комплексов PAMP во врожденном иммунитете и биологии вакцин». Frontiers in Immunology . 4 : 248. doi : 10.3389/fimmu.2013.00248 . PMC 3759294. PMID  24032031 . 
  8. ^ Kufer TA, Banks DJ, Philpott DJ (август 2006 г.). «Врожденное иммунное восприятие микробов белками Nod». Annals of the New York Academy of Sciences . 1072 (1): 19– 27. Bibcode : 2006NYASA1072...19K. doi : 10.1196/annals.1326.020. PMID  17057187. S2CID  20217610.
  9. ^ ab Nakagome S, Mano S, Kozlowski L, Bujnicki JM, Shibata H, Fukumaki Y, Kidd JR, Kidd KK, Kawamura S, Oota H (июнь 2012 г.). «Аллели риска болезни Крона в локусе NOD2 поддерживаются естественным отбором при постоянной изменчивости». Молекулярная биология и эволюция . 29 (6): 1569– 85. doi :10.1093/molbev/mss006. PMC 3697811. PMID  22319155 . 
  10. ^ Ogura Y, Inohara N, Benito A, Chen FF, Yamaoka S, Nunez G (февраль 2001 г.). «Nod2, член семейства Nod1/Apaf-1, который ограничен моноцитами и активирует NF-kappaB». Журнал биологической химии . 276 (7): 4812– 8. doi : 10.1074/jbc.M008072200 . PMID  11087742.
  11. ^ «Ген Entrez: домен олигомеризации, связывающий нуклеотиды NOD2, содержащий 2».
  12. ^ Sato H, Williams HR, Spagnolo P, Abdallah A, Ahmad T, Orchard TR, Copley SJ, Desai SR, Wells AU, du Bois RM, Welsh KI (февраль 2010 г.). «Полиморфизмы CARD15/NOD2 связаны с тяжелым легочным саркоидозом». Eur Respir J . 35 (2): 324– 30. doi : 10.1183/09031936.00010209 . PMID  19679608.
  13. ^ Zhao H, Jia M, Wang Z, Cheng Y, Luo Z, Chen Y, Xu X, Yang S, Tang Y (июнь 2015 г.). «Связь между полиморфизмами отдельных нуклеотидов NOD2 и острой реакцией «трансплантат против хозяина» III–IV степени: метаанализ». Гематология . 20 (5): 254–62 . doi : 10.1179/1607845414Y.0000000202 . PMID  25248089. S2CID  206850232.
  14. ^ Рэдфорд-Смит Г., Пандея Н. (ноябрь 2006 г.). «Связи между генотипом и фенотипом NOD2/CARD15 при болезни Крона — мы уже достигли цели?». World Journal of Gastroenterology . 12 (44): 7097– 103. doi : 10.3748 /wjg.v12.i44.7097 . PMC 4087769. PMID  17131470. 
  15. ^ Kim TH, Payne U, Zhang X, Iwanaga Y, Davey MP, Rosenbaum JT, Inman RD (январь 2007 г.). «Измененные взаимодействия хозяина и патогена, обусловленные мутацией NOD2 при синдроме Блау». Rheumatology International . 27 (3): 257– 62. doi :10.1007/s00296-006-0250-0. PMID  17096091. S2CID  23739992.
  16. ^ Дамиано Дж. С., Оливейра В., Уэлш К., Рид Дж. К. (июль 2004 г.). «Гетеротипические взаимодействия между доменами NACHT: последствия для регуляции врожденных иммунных реакций». Биохимический журнал . 381 (ч. 1): 213– 9. doi : 10.1042/BJ20031506. PMC 1133779. PMID  15107016 . 
  17. ^ Дамиано Дж. С., Стехлик К., Пио Ф., Годзик А., Рид Дж. С. (июль 2001 г.). «CLAN, новый ген, подобный человеческому CED-4». Геномика . 75 ( 1–3 ): 77–83 . doi :10.1006/geno.2001.6579. PMID  11472070.
  18. ^ Sabbah A, Chang TH, Harnack R, Frohlich V, Tominaga K, Dube PH, Xiang Y, Bose S (октябрь 2009 г.). «Активация врожденных иммунных противовирусных ответов Nod2». Nature Immunology . 10 (10): 1073– 80. doi :10.1038/ni.1782. PMC 2752345. PMID 19701189  . 

Дальнейшее чтение

  • Punchard NA (октябрь 2001 г.). «Обзор: Nod2, причина или фактор, способствующий болезни Крона». Current Opinion in Investigational Drugs . 2 (10): 1378–81 . PMID  11890351.
  • Satsangi J, Morecroft J, Shah NB, Nimmo E (февраль 2003 г.). «Генетика воспалительных заболеваний кишечника: научные и клинические аспекты». Best Practice & Research. Clinical Gastroenterology . 17 (1): 3– 18. doi :10.1053/bega.2002.0349. PMID  12617879.
  • Rosenbaum JT, Planck SR, Davey MP, Iwanaga Y, Kurz DE, Martin TM (октябрь 2003 г.). «С одним лишь кивком увеит вступает в новую эру». American Journal of Ophthalmology . 136 (4): 729– 32. doi :10.1016/S0002-9394(03)00569-5. PMID  14516815.
  • Курокава Т., Кикучи Т., Охта К., Имаи Х., Йошимура Н. (октябрь 2003 г.). «Глазные проявления при синдроме Блау, связанные с мутацией CARD15/Nod2». Офтальмология . 110 (10): 2040– 4. doi :10.1016/S0161-6420(03)00717-6. PMID  14522785.
  • Girardin SE, Hugot JP, Sansonetti PJ (декабрь 2003 г.). «Уроки исследований Nod2: на пути к связи между болезнью Крона и бактериальным восприятием». Trends in Immunology . 24 (12): 652– 8. doi :10.1016/j.it.2003.10.007. PMID  14644139.
  • Ньюман Б., Симинович К. (декабрь 2003 г.). «Воспалительное заболевание кишечника: болезнь Крона и успех генетики NODern». Клиническая и исследовательская медицина . 26 (6): 303–14 . PMID  14690304.
  • Остенбруг Л.Е., ван Даллемен Х.М., Те Меерман Г.Дж., Янсен П.Л. (2003). «ВЗК и генетика: новые разработки». Скандинавский журнал гастроэнтерологии. Добавка . 38 (239): 63–8 . doi : 10.1080/00855920310002717 (неактивно с 1 ноября 2024 г.). ПМИД  14743885.{{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на ноябрь 2024 г. ( ссылка )
  • Камбе Н., Нишикомори Р., Каназава Н. (август 2005 г.). «Цитозольный рецептор распознавания образов Nod2 и воспалительные гранулематозные расстройства». Журнал дерматологической науки . 39 (2): 71– 80. doi :10.1016/j.jdermsci.2005.04.001. PMID  15927452.
  • Newman B, Siminovitch KA (июль 2005 г.). «Последние достижения в генетике воспалительных заболеваний кишечника». Current Opinion in Gastroenterology . 21 (4): 401–7 . PMID  15930978.
  • Martinon F, Tschopp J (август 2005 г.). «NLRs присоединяются к TLRs как врожденные сенсоры патогенов». Trends in Immunology . 26 (8): 447–54 . doi :10.1016/j.it.2005.06.004. PMID  15967716.
  • Strober W, Murray PJ, Kitani A, Watanabe T (январь 2006 г.). «Сигнальные пути и молекулярные взаимодействия NOD1 и NOD2». Nature Reviews. Иммунология . 6 (1): 9– 20. doi :10.1038/nri1747. PMID  16493424. S2CID  33505741.
  • Cavanaugh J (июнь 2006 г.). «NOD2: этнические и географические различия». World Journal of Gastroenterology . 12 (23): 3673– 7. doi : 10.3748/wjg.v12.i23.3673 . PMC  4087459. PMID  16773683 .
  • Hugot JP (август 2006 г.). «Мутации CARD15/NOD2 при болезни Крона». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1072 (1): 9– 18. Bibcode : 2006NYASA1072....9H. doi : 10.1196/annals.1326.011. PMID  17057186. S2CID  24150549.
  • Виньяль С., Зингер Э., Пейрен-Бируле Л., Дерёмо П., Шамайяр М. (апрель 2007 г.). «Как мутации NOD2 предрасполагают к болезни Крона?». Микробы и инфекция / Институт Пастера . 9 (5): 658–63 . doi : 10.1016/j.micinf.2007.01.016 . ПМИД  17379562.
  • Quaglietta L, te Velde A, Staiano A, Troncone R, Hommes DW (май 2007 г.). «Функциональные последствия мутаций NOD2/CARD15 при болезни Крона». Журнал детской гастроэнтерологии и питания . 44 (5): 529–39 . doi : 10.1097/MPG.0b013e31803815ee . PMID  17460484. S2CID  37476303.
  • ван дер Линде К., Боор П.П., Хаувинг-Дуистермаат Дж.Дж., Крузиус Б.Дж., Уилсон П.Дж., Койперс Э.Дж., де Рой Ф.В. (июнь 2007 г.). «Мутации CARD15 при голландских семейных и спорадических воспалительных заболеваниях кишечника и обзор европейских исследований». Европейский журнал гастроэнтерологии и гепатологии . 19 (6): 449–59 . doi :10.1097/01.meg.0000236887.44214.6a. PMID  17489054. S2CID  17766170.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=NOD2&oldid=1254942939"