CACNA1B

CACNA1B
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2LCM
Идентификаторы
Псевдонимы	CACNA1B , BIII, CACNL1A5, CACNN, Cav2.2, DYT23, субъединица альфа1 B кальциевого потенциалзависимого канала, NEDNEH
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 601012; МГИ : 88296; гомологен : 20184; GeneCards : CACNA1B; OMA :CACNA1B — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 9 (человек)
Конец	138,124,624 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	24,653,164 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	средняя височная извилина; ; Район Бродмана 23; ; постцентральная извилина; ; эндотелиальная клетка; ; верхняя лобная извилина; ; энторинальная кора; ; правое полушарие мозжечка; ; первичная зрительная кора; ; Район Бродмана 46; ; червь мозжечка;
	Верх выражен в
	супраоптическое ядро; ; вентромедиальное ядро; ; дорсомедиальное гипоталамическое ядро; ; передняя миндалевидная область; ; тройничный ганглий; ; гаструла; ; подложка; ; дугообразное ядро; ; поясничный спинномозговой ганглий; ; сосцевидное тело;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание белка с С-концом; связывание ионов металлов; связывание нуклеотидов; связывание ионов кальция; активность потенциалзависимых кальциевых каналов; активность высоковольтного кальциевого канала; активность ионного канала; Связывание АТФ; активность потенциалзависимых ионных каналов; связывание белков; активность кальциевых каналов; связывание бета-амилоида;
Клеточный компонент	неотъемлемый компонент мембраны; пресинапс; мембрана; сома; дендрит; комплекс потенциалзависимых кальциевых каналов; плазматическая мембрана;
Биологический процесс	транспорт ионов кальция; химическая синаптическая передача; трансмембранный транспорт; деполяризация мембраны во время потенциала действия; локомоторное поведение; регуляция трансмембранного транспорта ионов; регуляция артериального давления; регуляция транспорта ионов кальция; транспорт ионов; регуляция сердечного сокращения; трансмембранный транспорт ионов кальция; реакция на боль; деполяризация мембраны; секреция нейромедиатора; импорт ионов кальция; модуляция химической синаптической передачи; ответ на бета-амилоид;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	774
	12287
	ENSG00000148408
	ENSMUSG00000004113
	Q00975
	О55017
	NM_000718 ; NM_001243812
	NM_001042528 ; NM_007579
	NP_000709 ; NP_001230741
	NP_001035993 ; NP_031605
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у человека

Субъединица альфа-1B потенциалзависимого кальциевого канала N-типа — это белок , который у людей кодируется геном CACNA1B . [ ^5]^[6]^[7] Белок α1B вместе с субъединицами β и α2δ образует кальциевый канал N-типа (канал Ca _v 2.2). ^[8] Это кальциевый канал R-типа . ^{[ требуется ссылка ]}

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000148408 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000004113 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтреза: кальциевый канал CACNA1B, потенциал-зависимый, N-тип, субъединица альфа 1B».
^ Diriong S, Lory P, Williams ME, Ellis SB, Harpold MM, Taviaux S (декабрь 1995 г.). «Хромосомная локализация человеческих генов для альфа 1A, альфа 1B и альфа 1E зависимых от напряжения субъединиц Ca2+-каналов». Genomics . 30 (3): 605– 609. doi :10.1006/geno.1995.1284. PMID 8825650.
^ Catterall WA, Perez-Reyes E, Snutch TP, Striessnig J (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. XLVIII. Номенклатура и структурно-функциональные связи потенциалзависимых кальциевых каналов». Pharmacological Reviews . 57 (4): 411– 425. doi :10.1124/pr.57.4.5. PMID 16382099. S2CID 10386627.
^ Heyes S, Pratt WS, Rees E, Dahimene S, Ferron L, Owen MJ и др. (ноябрь 2015 г.). «Генетическое нарушение потенциалзависимых кальциевых каналов при психиатрических и неврологических расстройствах». Progress in Neurobiology . 134 : 36–54 . doi :10.1016/j.pneurobio.2015.09.002. PMC 4658333. PMID 26386135 .

Дальнейшее чтение

Mould J, Yasuda T, Schroeder CI, Beedle AM, Doering CJ, Zamponi GW и др. (август 2004 г.). «Вспомогательная субъединица alpha2delta снижает сродство омега-конотоксинов к рекомбинантным кальциевым каналам N-типа (Cav2.2)». Журнал биологической химии . 279 (33): 34705– 34714. doi : 10.1074/jbc.M310848200 . PMID 15166237.
Park SY, Park YT, Kim KE, Rhee MC, Cho HJ, Kim DS (апрель 2002 г.). «Прямой повтор гена альфа1B канала N-типа Ca2+ функционирует как отрицательный регуляторный элемент в клетках HeLa». Molecules and Cells . 13 (2): 341– 346. doi : 10.1016/S1016-8478(23)15043-6 . PMID 12018859.
Calabrese B, Tabarean IV, Juranka P, Morris CE (ноябрь 2002 г.). «Механочувствительность токов кальциевых каналов N-типа». Biophysical Journal . 83 (5): 2560– 2574. Bibcode :2002BpJ....83.2560C. doi :10.1016/S0006-3495(02)75267-3. PMC 1302342 . PMID 12414690.
Москвина В., Крэддок Н., Холманс П., Николов И., Пахва Дж. С., Грин Э. и др. (март 2009 г.). «Геновый анализ наборов данных по всем геномам: доказательства множественных общих аллелей риска шизофрении и биполярного расстройства и перекрытия генетического риска». Молекулярная психиатрия . 14 (3): 252– 260. doi :10.1038/mp.2008.133. PMC 3970088. PMID 19065143 .
Castiglioni AJ, Raingo J, Lipscombe D (октябрь 2006 г.). «Альтернативный сплайсинг в C-конце CaV2.2 контролирует экспрессию и гейтирование кальциевых каналов N-типа». Журнал физиологии . 576 (Pt 1): 119– 134. doi :10.1113/jphysiol.2006.115030. PMC 1995641. PMID 16857708 .
Catterall WA, Perez-Reyes E, Snutch TP, Striessnig J (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. XLVIII. Номенклатура и структурно-функциональные связи потенциалзависимых кальциевых каналов». Pharmacological Reviews . 57 (4): 411– 425. doi :10.1124/pr.57.4.5. PMID 16382099. S2CID 10386627.
Yokoyama CT, Myers SJ, Fu J, Mockus SM, Scheuer T, Catterall WA (январь 2005 г.). «Механизм связывания белка SNARE и регуляция каналов Cav2 путем фосфорилирования сайта взаимодействия синаптических белков». Molecular and Cellular Neurosciences . 28 (1): 1– 17. doi :10.1016/j.mcn.2004.08.019. PMID 15607937. S2CID 38370138.
Maeno-Hikichi Y, Chang S, Matsumura K, Lai M, Lin H, Nakagawa N и др. (май 2003 г.). «Комплекс PKC epsilon-ENH-канала специфически модулирует каналы N-типа Ca2+». Nature Neuroscience . 6 (5): 468– 475. doi :10.1038/nn1041. PMID 12665800. S2CID 19964052.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P и др. (Ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635– 648. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.
Li D, Wang F, Lai M, Chen Y, Zhang JF (февраль 2005 г.). «Комплекс протеинфосфатазы 2calpha-Ca2+-канала для дефосфорилирования нейрональных Ca2+-каналов, фосфорилированных протеинкиназой C». The Journal of Neuroscience . 25 (8): 1914– 1923. doi :10.1523/JNEUROSCI.4790-04.2005. PMC 6726054. PMID 15728831 .
Butcher AJ, Leroy J, Richards MW, Pratt WS, Dolphin AC (июль 2006 г.). «Важность занятости, а не сродства субъединиц CaV(beta) для линкера кальциевого канала I-II в отношении функции кальциевого канала». Журнал физиологии . 574 (Pt 2): 387– 398. doi :10.1113/jphysiol.2006.109744. PMC 1817768. PMID 16627564 .
Stotz SC, Barr W, McRory JE, Chen L, Jarvis SE, Zamponi GW (январь 2004 г.). «Несколько структурных доменов способствуют регуляции инактивации кальциевых каналов N-типа субъединицей бета-3». Журнал биологической химии . 279 (5): 3793–3800 . doi : 10.1074/jbc.M308991200 . PMID 14602720.
Максимов А, Безпрозванный И (август 2002). "Синаптическое нацеливание кальциевых каналов N-типа в нейронах гиппокампа". The Journal of Neuroscience . 22 (16): 6939– 6952. doi :10.1523/JNEUROSCI.22-16-06939.2002. PMC 3307533. PMID 12177192 .
Peng S, Hajela RK, Atchison WD (декабрь 2002 г.). «Характеристики блока Pb2+ функции человеческих нейрональных каналов Ca2+ L-, N- и R-типа, временно экспрессируемых в клетках эмбриональной почки человека 293». Молекулярная фармакология . 62 (6): 1418– 1430. doi :10.1124/mol.62.6.1418. PMID 12435810.
Мураками М., Флейшманн Б., Де Фелипе К., Фрейхель М., Трост К., Людвиг А. и др. (октябрь 2002 г.). «Восприятие боли у мышей, лишенных субъединицы бета3 кальциевых каналов, активируемых напряжением». Журнал биологической химии . 277 (43): 40342– 40351. doi : 10.1074/jbc.M203425200 . hdl : 10261/310195 . PMID 12161429.
Vitko I, Shcheglovitov A, Baumgart JP, Arias-Olguín II, Murbartián J, Arias JM и др. (2008). Schwartz A (ред.). «Ориентация бета-кальциевого канала относительно субъединицы альфа(1)2.2 имеет решающее значение для его регуляции активности канала». PLOS ONE . 3 (10): e3560. Bibcode :2008PLoSO...3.3560V. doi : 10.1371/journal.pone.0003560 . PMC 2570331 . PMID 18958281.
Coppola T, Magnin-Luthi S, Perret-Menoud V, Gattesco S, Schiavo G, Regazzi R (август 2001 г.). «Прямое взаимодействие RIM эффектора Rab3 с каналами Ca2+, SNAP-25 и синаптотагмином». Журнал биологической химии . 276 (35): 32756– 32762. doi : 10.1074/jbc.M100929200 . PMID 11438518.
Johnson JM, Castle J, Garrett-Engele P, Kan Z, Loerch PM, Armour CD и др. (декабрь 2003 г.). «Обзор генома альтернативного сплайсинга пре-мРНК человека с использованием микроматриц экзонных соединений». Science . 302 (5653): 2141– 2144. Bibcode :2003Sci...302.2141J. doi :10.1126/science.1090100. PMID 14684825. S2CID 10007258.
Agler HL, Evans J, Tay LH, Anderson MJ, Colecraft HM, Yue DT (июнь 2005 г.). "G-белок-управляемый ингибирующий модуль каналов N-типа (ca(v)2.2) ca2+". Neuron . 46 (6): 891– 904. doi : 10.1016/j.neuron.2005.05.011 . PMID 15953418. S2CID 16963916.

Внешние ссылки

CACNA1B+белок,+человек в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000148408 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000004113 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтреза: кальциевый канал CACNA1B, потенциал-зависимый, N-тип, субъединица альфа 1B».

[pmid8825650-6] Diriong S, Lory P, Williams ME, Ellis SB, Harpold MM, Taviaux S (декабрь 1995 г.). «Хромосомная локализация человеческих генов для альфа 1A, альфа 1B и альфа 1E зависимых от напряжения субъединиц Ca2+-каналов». Genomics . 30 (3): 605– 609. doi :10.1006/geno.1995.1284. PMID 8825650.

[pmid16382099-7] Catterall WA, Perez-Reyes E, Snutch TP, Striessnig J (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологии. XLVIII. Номенклатура и структурно-функциональные связи потенциалзависимых кальциевых каналов». Pharmacological Reviews . 57 (4): 411– 425. doi :10.1124/pr.57.4.5. PMID 16382099. S2CID 10386627.

[8] Heyes S, Pratt WS, Rees E, Dahimene S, Ferron L, Owen MJ и др. (ноябрь 2015 г.). «Генетическое нарушение потенциалзависимых кальциевых каналов при психиатрических и неврологических расстройствах». Progress in Neurobiology . 134 : 36–54 . doi :10.1016/j.pneurobio.2015.09.002. PMC 4658333. PMID 26386135 .