C2CD4D , или белок 4D, содержащий кальций-зависимый домен C2, является белковым продуктом человеческого генома . Ген, который кодирует этот белок, находится на хромосоме 1, от 150 076 963 до 150 079 657. Ген содержит 2 экзона и кодирует 353 аминокислоты . Синонимы C2CD4D — «FAM148D» [5] и NP_001129475. C2CD4D содержит консервативный домен связывания металла, который известен как консервативная область 2 протеинкиназы C, подгруппа 1. Известно, что этот мотив является членом суперсемейства C2, которое присутствует в фосфолипазах , протеинкиназах C и синаптотагминах . [6] Аминокислотная последовательность C2CD4D доступна по адресу [1] До любой посттрансляционной модификации молекулярная масса C2CD4D составляет 37,6 кдал. [7] Хотя ученые еще не определили, где C2CD4D функционирует внутри клетки, C2CD4D имеет предсказанную изоэлектрическую точку 11,636, что серьезно ограничивает места, в которых он может быть эффективен. Кроме того, C2CD4D не содержит никаких предсказанных трансмембранных доменов или каких-либо предсказанных сигнальных пептидов.
Выражение
По данным Национального центра биотехнологической информации , экспрессия C2CD4D была обнаружена только у взрослых людей с некоторыми формами рака . [8] C2CD4D не экспрессируется повсеместно, и до сих пор ученые обнаружили экспрессию C2CD4D только в тканях мозга, кишечника и молочной железы.
Эволюционная консервация
Существует 52 известных ортолога млекопитающих для C2CD4D, [9] обнаруженных по крайней мере у 10 видов, включая Pan troglodytes , Ornithorhynchus anatinus и Sus scrofa . Всего имеется 38 полностью сохранившихся остатков в этих 10 видах, что соответствует 10,76% сохранения. Среди позвоночных сохранение остается высоким и составляет 33 остатка, что соответствует 9,3%. Однако за пределами позвоночных сохранение падает до максимума в 1,98% или 3 остатка. [10]
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000225556 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000091648 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Национальный центр биотехнологической информации
^ "NCBI Blast". blast.ncbi.nlm.nih.gov .
^ данные выравнивания, определенные с помощью инструмента ClustalW, доступного по адресу http://workbench.sdsc.edu, и соответствующие результаты ортологов, полученные в результате поиска blast с использованием инструмента, доступного по адресу http://blast.ncbi.nlm.nih.gov
