БОП1
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

БОП1
Идентификаторы
ПсевдонимыBOP1 , блок пролиферации 1, фактор рибосомального биогенеза BOP1
Внешние идентификаторыОМИМ : 610596; МГИ : 1334460; Гомологен : 6612; GeneCards : BOP1; OMA :BOP1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

23246

12181

Ансамбль

ENSG00000261236
ENSG00000285301

ENSMUSG00000022557

UniProt

Q14137

Р97452

РефСек (мРНК)

NM_015201

NM_013481

RefSeq (белок)

NP_056016

NP_038509

Местоположение (UCSC)Хр 8: 144.26 – 144.29 МбХр 15: 76.34 – 76.36 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок биогенеза рибосом BOP1 — это белок , который у людей кодируется геном BOP1 . [ 5] [6] Это ядрышковый белок, содержащий повтор WD40 , который участвует в процессинге рРНК, тем самым контролируя клеточный цикл. [7] Он необходим для созревания рибосомных РНК 25S и 5.8S. Он может служить существенным фактором в формировании рибосом , который координирует процессинг спейсерных областей в пре-рРНК.

Функция

Комплекс Pes1-Bop1 состоит из нескольких компонентов: BOP1, GRWD1 , PES1 , ORC6L и RPL3 и участвует в биогенезе рибосом и измененной сегрегации хромосом . Сверхэкспрессия BOP1 увеличивает процент многополярных веретен в клетках человека . Дерегуляция пути BOP1 может способствовать колоректальному опухолеобразованию у людей . [8] Повышенные уровни Bop1 индуцируют подкомплексы Bop1/WDR12 и Bop1/Pes1, а сборка и целостность комплекса PeBoW очень чувствительны к изменениям уровней белка Bop1. [9]

Nop7p -Erb1p -Ytm1p, обнаруженный в дрожжах, потенциально является гомологичным комплексом Pes1-Bop1-WDR12, поскольку он участвует в контроле биогенеза рибосом и вступлении в S-фазу . Целостность комплекса PeBoW необходима для биогенеза рибосом и пролиферации клеток в клетках млекопитающих . [10] У Giardia специфический для вида белок цитоскелета , бета-гиардин, взаимодействует с Bop1. [7]

Структура

БОП1НТ
Идентификаторы
СимволБОП1НТ
ПфамПФ08145
ИнтерПроIPR012953
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры

BOP1 содержит консервативный N-концевой домен, BOP1NT.

Ссылки

  1. ^ abc ENSG00000285301 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000261236, ENSG00000285301 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022557 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikawa K, Nomura N (март 1996). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». DNA Res . 2 (4): 167–74, 199–210. CiteSeerX 10.1.1.333.6945 . doi : 10.1093/dnares/2.4.167 . PMID  8590280. 
  6. ^ "Ген Энтреза: блок пролиферации 1 BOP1".
  7. ^ ab Kim J, Goo SY, Chung HJ, Yang HW, Yong TS, Lee KH, Park SJ (январь 2006 г.). «Взаимодействие бета-гиардина с белком Bop1 в Giardia lamblia». Parasitol. Res . 98 (2): 138–44. doi :10.1007/s00436-005-0040-8. PMID  16362343. S2CID  24519868.
  8. ^ Киллиан А, Сарафан-Вассер Н, Сесбуэ Р, Ле Пессо Ф, Бланшар Ф, Лами А, Лоран М, Фламан ЖМ, Фребур Т (сентябрь 2006 г.). «Вклад гена BOP1, расположенного на 8q24, в колоректальный туморогенез». Гены Хромосомы Рак . 45 (9): 874–81. doi :10.1002/gcc.20351. PMID  16804918. S2CID  38299400.
  9. ^ Rohrmoser M, Hölzel M, Grimm T, Malamoussi A, Harasim T, Orban M, Pfisterer I, Gruber-Eber A, Kremmer E, Eick D (май 2007 г.). «Взаимозависимость Pes1, Bop1 и WDR12 контролирует ядрышковую локализацию и сборку комплекса PeBoW, необходимого для созревания 60S рибосомальной субъединицы». Mol. Cell. Biol . 27 (10): 3682–94. doi :10.1128/MCB.00172-07. PMC 1899993. PMID  17353269 . 
  10. ^ Hölzel M, Rohrmoser M, Schlee M, Grimm T, Harasim T, Malamoussi A, Gruber-Eber A, Kremmer E, Hiddemann W, Bornkamm GW, Eick D (август 2005 г.). «WDR12 млекопитающих является новым членом комплекса Pes1-Bop1 и необходим для биогенеза рибосом и пролиферации клеток». J. Cell Biol . 170 (3): 367–78. doi :10.1083/jcb.200501141. PMC 2171466. PMID  16043514 . 

Дальнейшее чтение

  • Zhang Y, Koushik S, Dai R, Mivechi NF (1999). «Структурная организация и анализ промотора гена фактора транскрипции теплового шока-1 у мышей». J. Biol. Chem . 273 (49): 32514–21. doi : 10.1074/jbc.273.49.32514 . PMID  9829985.
  • Nakatsura T, Senju S, Yamada K, Jotsuka T, Ogawa M, Nishimura Y (2001). «Клонирование генов иммуногенных антигенов, сверхэкспрессируемых при раке поджелудочной железы». Biochem. Biophys. Res. Commun . 281 (4): 936–44. doi :10.1006/bbrc.2001.4377. PMID  11237751.
  • Пестов Д.Г., Стрезоска З., Лау Л.Ф. (2001). «Доказательства p53-зависимого перекрестного взаимодействия между биогенезом рибосомы и клеточным циклом: эффекты ядрышкового белка Bop1 на переход G(1)/S». Mol. Cell. Biol . 21 (13): 4246–55. doi :10.1128/MCB.21.13.4246-4255.2001. PMC  87085. PMID  11390653 .
  • Пестов Д.Г., Штоккельман МГ, Стрезоска З., Лау Л.Ф. (2001). "ERB1, дрожжевой гомолог млекопитающего Bop1, является важным геном, необходимым для созревания 25S и 5.8S рибосомальных РНК". Nucleic Acids Res . 29 (17): 3621–30. doi :10.1093/nar/29.17.3621. PMC  55883. PMID  11522832 .
  • Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Biol . 12 (1): 1–11. Bibcode : 2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID  11790298. S2CID  14132033.
  • Стрезоска З., Пестов Д.Г., Лау Л.Ф. (2002). «Функциональная инактивация белка ядрышка мыши Bop1 ингибирует множественные этапы процессинга пре-рРНК и блокирует прогрессию клеточного цикла». J. Biol. Chem . 277 (33): 29617–25. doi : 10.1074/jbc.M204381200 . PMID  12048210.
  • Шерл А., Куте И., Деон С., Калле А., Киндбайтер К., Санчес Х.К., Греко А., Хохштрассер Д., Диас Дж.Дж. (2003). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека». Мол. Биол. Клетка . 13 (11): 4100–9. doi :10.1091/mbc.E02-05-0271. ПМК  133617 . ПМИД  12429849.
  • Lapik YR, Fernandes CJ, Lau LF, Pestov DG (2004). "Физическое и функциональное взаимодействие между Pes1 и Bop1 в биогенезе рибосом млекопитающих". Mol. Cell . 15 (1): 17–29. doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.020 . PMID  15225545.
  • Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Nature . 433 (7021): 77–83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
  • Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (2006). "Анализ фосфопротеома митотического веретена человека". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 103 (14): 5391–6. Bibcode : 2006PNAS..103.5391N. doi : 10.1073/pnas.0507066103 . PMC  1459365. PMID  16565220 .
  • Босолей СА, Виллен ДЖ, Гербер СА, Раш ДЖ, Гиги СП (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. doi :10.1038/nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573.
  • Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC  1847948. PMID  17353931 .
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR012953


Значок заглушки

Эта статья о гене на 8-й хромосоме человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=BOP1&oldid=1214478828"