Асгард (Археи)
Предложенный супертип архей

Асгард
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Домен:Археи
Королевство:Протеоархеоты
Супертип:Асгард
Катажина Заремба-Недзведска  [Викиданные] и др. 2017 год
Фила

см. текст

Синонимы
  • «Асгардархеота» Виолетта Да Кунья и др. 2017 год
  • «Асгардеота» Уитмен 2018
  • «Eukaryomorpha» Фурнье и Пул 2018 [1]
  • Прометеархеати Имачи и др. 2024 год
  • Прометеархеота Имачи и др. 2024 год

Asgard или Asgardarchaeota [2] — это предложенный суперфилюм, принадлежащий к домену Archaea , который содержит эукариотические сигнатурные белки. [3] Похоже, что эукариоты , домен , включающий животных , растения и грибы , возникли в Asgard , [4] в ветви, содержащей Heimdallarchaeota . [5] Это подтверждает двухдоменную систему классификации по сравнению с трехдоменной системой . [6] [7]

После включения категории царства в ICNP единственным валидно опубликованным названием этой группы является царство Promethearchaeati , содержащее только один тип Promethearchaeota . Все ранее предложенные «филы» будут понижены до классов в этой структуре. [8]

Открытие и номенклатура

Летом 2010 года были проанализированы осадки из гравитационного керна , взятого в рифтовой долине на хребте Книповича в Северном Ледовитом океане, недалеко от гидротермального источника Локи-Касл . Определенные горизонты осадочных пород, ранее содержавшие высокую концентрацию новых архейных линий, были подвергнуты метагеномному анализу . [9] [10] В 2015 году группа под руководством Уппсальского университета предложила тип Lokiarchaeota на основе филогенетического анализа с использованием набора высококонсервативных генов, кодирующих белки. [11] Группа была названа в честь меняющего форму скандинавского бога Локи , в намеке на комплекс гидротермальных источников, из которого произошел первый образец генома. [12] Локи в мифологии описывается как «невероятно сложная, запутанная и противоречивая фигура, которая стала катализатором бесчисленных неразрешенных научных споров», [13] аналогично роли локиархеот в дебатах о происхождении эукариот. [11] [14]

В 2016 году группа под руководством Техасского университета обнаружила Thorarchaeota из образцов, взятых из реки Уайт-Оук в Северной Каролине, названной в честь Тора , другого скандинавского бога. [15] Образцы из замка Локи, Йеллоустонского национального парка , залива Орхус , водоносного слоя около реки Колорадо , новозеландского бассейна Radiata , гидротермальных источников около острова Такетоми , Япония, и эстуария реки Уайт-Оук в Соединенных Штатах содержали Odinarchaeota и Heimdallarchaeota; [3] следуя норвежской традиции именования божеств, эти группы были названы в честь Одина и Хеймдалля соответственно. Поэтому исследователи назвали суперфилюм, содержащий этих микробов, « Асгард », в честь дома богов в скандинавской мифологии. [3] Были культивированы два образца Lokiarchaeota, что позволило получить подробное представление об их морфологии. [16]

Описание

Белки

Члены Asgard кодируют множество эукариотических сигнатурных белков, включая новые ГТФазы , белки ремоделирования мембран, такие как ESCRT и SNF7 , систему модификаторов убиквитина и гомологи пути N-гликозилирования . [3]

Археоны Асгарда имеют регулируемый актиновый цитоскелет , а профилины и гельзолины, которые они используют, могут взаимодействовать с эукариотическими актинами. [17] [18] Кроме того, тубулин архей Асгарда из гидротермально живущих Odinarchaeota ( OdinTubulin ) был идентифицирован как настоящий тубулин. OdinTubulin образует протомеры и протофиламенты, наиболее похожие на эукариотические микротрубочки, но при этом собирается в кольцевые системы, более похожие на FtsZ , что указывает на то, что OdinTubulin может представлять собой промежуточное звено эволюции между FtsZ и тубулинами, образующими микротрубочки . [19] Они также, по-видимому, образуют везикулы под криогенной электронной микроскопией . Некоторые из них могут иметь S-слой домена PKD . [20] Они также разделяют трехстороннее расширение ES39 в LSU рРНК с эукариотами. [21] Кластеры генов или опероны, кодирующие рибосомальные белки, часто менее консервативны в своей организации в группе Asgard, чем в других археях, что позволяет предположить, что порядок генов, кодирующих рибосомальные белки, может следовать филогении. [22]

Метаболизм

  • Метаболические пути архей Асгарда, различающиеся по типам[23]
    Метаболические пути архей Асгарда, различающиеся в зависимости от типа [23]
  • Метаболические пути архей Асгарда, различающиеся в зависимости от окружающей среды[23]
    Метаболические пути архей Асгарда, различающиеся в зависимости от окружающей среды [23]

Археи Асгарда, как правило, являются облигатными анаэробами , хотя Kariarchaeota, Gerdarchaeota и Hodarchaeota могут быть факультативными аэробами . [24] У них есть путь Вуда-Льюнгдаля , и они выполняют гликолиз . Члены могут быть автотрофами , гетеротрофами или фототрофами , использующими гелиородопсин . [23] Один член, Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum , является синтрофным с серовосстанавливающими протеобактериями и метаногенными археями. [20]

Имеющийся у них RuBisCO не фиксирует углерод, но, вероятно, используется для утилизации нуклеозидов. [23]

Экология

Asgard широко распространены по всему миру, как географически, так и по среде обитания. Многие из известных клад ограничены отложениями, тогда как Lokiarchaeota, Thorarchaeota и другие клады занимают множество различных местообитаний. Соленость и глубина являются важными экологическими факторами для большинства архей Asgard. Другие среды обитания включают тела животных, ризосферу растений, несоленые отложения и почвы, морскую поверхность и пресную воду. Кроме того, Asgard связаны с несколькими другими микроорганизмами. [25]

Эукариотоподобные признаки в подразделениях

В 2017 году было обнаружено, что тип Heimdallarchaeota имеет N-концевые хвосты гистонов ядра , что ранее считалось исключительно эукариотическим признаком. В 2018 году было обнаружено, что два других типа архей, оба за пределами Асгарда, также имеют хвосты. [26]

В январе 2020 года ученые обнаружили Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum , представителя Lokiarcheota, участвующего в перекрестном питании с двумя видами бактерий. Проводя аналогию с симбиогенезом , они считают эти отношения возможной связью между простыми прокариотическими микроорганизмами и сложными эукариотическими микроорганизмами, возникшими примерно два миллиарда лет назад. [27] [20]

Филогения

Филогенетические связи архей Асгарда изучались несколькими группами в 21 веке. [5] [4] [28] [24] Были получены различные результаты, например, с использованием 53 маркерных белков из базы данных таксономии генома . [29] [30] [31] В 2023 году Эме, Тамарит, Касерес и коллеги сообщили, что эукариоты находятся глубоко в Асгарде, как сестры Hodarchaeales в пределах Heimdallarchaeota. [32]


Эме и др. 2023 [32]09-RS220 (24 апреля 2024 г.) [29] [30] [31]
Протеоархеоты

ТАК

Асгард

Джордархея

Одинархея

Балдрахейя

Локиархеевые

Гелархеевые

Торархея

Гермоархеи

Сифархея

Вуконархея

Heimdallarchaeota

Ньордарховые

Gerdarchaeales

Heimdallarchaeales

Heimdallarchaeaceae

Кариархеевые

Термопротеати

Термопротеота ( TACK )

Прометеархеаты:

" Торархея " (МБГ-Б)

"Ньордархея"

" Одинархея "

"Иордархея"
"Иордарховые"

"Freyrarchaeaceae"

"Иордарховые"

"Бальдрахея"

«Гермоархея»

Прометеархея

"Гелархеи"

Прометеархеевые

"Сигинархеевые"

Прометеарховые
["Локиарховые"]

"Сифархея"

"Сифархеалес"

"Борраховые"

"Вуконархея"

" Хеймдаллархея "

"Ходархеевые"

"Гердархеевые" (JABLTI01)

"Кариархеевые"

"Хеймдаллархеевые"

Прометеархеоты

Таксономия

В теории симбиогенеза слияние архей и аэробных бактерий создало эукариот с аэробными митохондриями ; второе слияние добавило хлоропласты , создав зеленые растения. [33]

В изображенном сценарии эукариоты находятся глубоко в древе Асгарда. Предпочтительным сценарием является синтрофия, где один организм зависит от питания другого. α-протеобактерия была включена, чтобы стать митохондрией . [34] В культуре существующие археи Асгарда образуют различные синтрофные зависимости. [35] Грегори Фурнье и Энтони Пул предположили, что Асгард является частью «древа эукариот», образуя суперфилюм, который они называют «Eukaryomorpha», определяемый «общими производными признаками» (сигнатурными белками эукариот). [36]

Таксономия неопределенна, и поэтому названия типов несколько спекулятивны. Список типов основан на Списке прокариотических названий со стоянием в номенклатуре (LPSN) [37] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). [38]

  • Тип «Асгардархеота» Виолетта Да Кунья и др. 2017 год
  • Тип «Balderarchaeota» Xie et al. 2022 год
  • Тип "Baldrarchaeota" Касерес 2019 г.
  • Тип «Borrarchaeota» Liu et al. 2021 год
  • Тип "Freyrarchaeota" исправлено. Касерес 2019
  • Тип "Friggarchaeota" Касерес 2019
  • Тип «Гефионархеота» Касерес 2019 г.
  • Тип «Гердархеота» Cai et al. 2020 год
  • Тип « Heimdallarchaeota » Zaremba-Niedzwiedzka et al. 2017 год
  • Тип «Helarchaeota» Seitz et al. 2019 год
  • Тип «Hermodarchaeota» Liu et al. 2021 год
  • Тип «Hodarchaeota» Liu et al. 2021 год
  • Тип "Idunnarchaeota" Касерес 2019 г.
  • Тип «Кариархеота» Лю и др. 2021 год
  • Тип «Njordarchaeota» Xie et al. 2022 год
  • Тип « Одинархеота » Заремба-Недзведска и др. 2017 год
  • Тип Promethearchaeota Imachi et al. 2024 ["Локиархеота" Спанг и др. 2015 ]
  • Тип «Сифархеота» Фараг и др. 2020 год
  • Тип «Sigynarchaeota» Xie et al. 2022 год
  • Тип « Торархеота » Бейкер 2015 г.
  • Тип «Tyrarchaeota» Xie et al. 2022 год
  • Тип «Wukongarchaeota» Лю и др. 2021 год

Геномные элементы

Вирусы

С помощью метагеномики было обнаружено несколько групп вирусов на уровне семейств, связанных с археями Асгарда. [39] [40] [41] Вирусы были отнесены к хозяевам Lokiarchaeia, Thorarchaeia, Odinarchaeia и Helarchaeia с использованием спейсера CRISPR, соответствующего соответствующим протоспейсерам в вирусных геномах. Две группы вирусов (называемые «вердандивирусами») связаны с архейными и бактериальными вирусами класса Caudoviricetes , т. е. вирусами с икосаэдрическими капсидами и спиральными хвостами; [39] [41] две другие отдельные группы (называемые «скулдвирусами») отдаленно связаны с бесхвостыми архейными и бактериальными вирусами с икосаэдрическими капсидами области Varidnaviria ; [39] [40] и третья группа вирусов (называемых вирдвирусами ) связана с археспецифичными вирусами с вирусными частицами в форме лимона (семейство Halspiviridae ). [39] [40] Вирусы были обнаружены в глубоководных отложениях [39] [41] и в наземном горячем источнике Йеллоустонского национального парка. [40] Все эти вирусы демонстрируют очень низкое сходство последовательностей с другими известными вирусами, но в целом связаны с ранее описанными прокариотическими вирусами, [42] без значимого сродства к вирусам эукариот. [43] [39]

Мобильные генетические элементы

Помимо вирусов, с помощью сопоставления спейсеров CRISPR было обнаружено несколько групп криптических мобильных генетических элементов , которые связаны с археями Asgard из линий Lokiarchaeia, Thorarchaeia и Heimdallarchaeota. [39] [44] Эти мобильные элементы не кодируют узнаваемые вирусные отличительные белки и могут представлять собой либо новые типы вирусов, либо плазмиды.

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Фурнье, ГП; Пул, А.М. (2018). «Кратко аргументированное утверждение о том, что археи Асгарда являются частью дерева эукариот». Frontiers in Microbiology . 9 : 1896. doi : 10.3389 /fmicb.2018.01896 . PMC  6104171. PMID  30158917.
  2. ^ Da Cunha, Violette; Gaia, Morgan; Gadelle, Daniele; et al. (июнь 2017 г.). «Lokiarchaea — близкие родственники Euryarchaeota, но не мост между прокариотами и эукариотами». PLOS Genetics . 13 (6): e1006810. doi : 10.1371/journal.pgen.1006810 . PMC 5484517. PMID  28604769 . 
  3. ^ abcd Заремба-Недзведска, Катажина; Касерес, Ева Ф.; Пила, Джимми Х.; и др. (январь 2017 г.). «Асгардские археи освещают происхождение сложности эукариотических клеток». Природа . 541 (7637): 353–358 . Бибкод : 2017Natur.541..353Z. дои : 10.1038/nature21031. OSTI  1580084. PMID  28077874. S2CID  4458094.
  4. ^ ab Eme, Laura; Spang, Anja; Lombard, Jonathan; Stairs, Courtney W.; Ettema, Thijs JG (ноябрь 2017 г.). «Археи и происхождение эукариот». Nature Reviews. Microbiology . 15 (12): 711– 723. doi :10.1038/nrmicro.2017.133. PMID  29123225. S2CID  8666687.
  5. ^ ab Williams, Tom A.; Cox, Cymon J.; Foster, Peter G.; Szöllősi, Gergely J.; Embley, T. Martin (январь 2020 г.). «Филогеномика обеспечивает надежную поддержку двухдоменного древа жизни». Nature Ecology & Evolution . 4 (1): 138– 147. doi :10.1038/s41559-019-1040-x. PMC 6942926 . PMID  31819234. 
  6. ^ Нобс, Стефани-Джейн; Маклеод, Фрейзер И.; Вонг, Хон Лун; Бернс, Брендан П. (май 2022 г.). «Эукария — химера: эукариоты, вторичное новшество двух доменов жизни?». Тенденции в микробиологии . 30 (5): 421– 431. doi :10.1016/j.tim.2021.11.003. PMID  34863611. S2CID  244823103.
  7. ^ Дулиттл, У. Форд (февраль 2020 г.). «Эволюция: две области жизни или три?». Current Biology . 30 (4): R177 – R179 . Bibcode : 2020CBio...30.R177D. doi : 10.1016/j.cub.2020.01.010 . PMID  32097647.
  8. ^ Имачи, Хироюки; Нобу, Масару К.; Като, Синго; Такаки, ​​Ёсихиро; Миядзаки, Масаюки; Мията, Макото; Огавара, Миюки; Сайто, Юми; Сакаи, Санаэ; Тахара, Юхей О.; Такано, Ёсинори; Тасуми, Эйдзи; Уэмацу, Кацуюки; Ёсимура, Тошихиро; Ито, Такаши; Окума, Мория; Такай, Кен (5 июля 2024 г.). "Promethearchaeum syntrophicum gen. nov., sp. nov., анаэробная, облигатно синтрофная архея, первый изолят линии архей 'Asgard' и предложение нового архейного типа Promethearchaeota phyl. nov. и царства Promethearchaeati regn. nov" . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 74 (7). doi :10.1099/ijsem.0.006435.
  9. ^ Йоргенсен, Штеффен Лет; Ханнисдал, Бьярте; Ланцен, Андерс; и др. (октябрь 2012 г.). «Корреляция профилей микробных сообществ с геохимическими данными в сильно стратифицированных отложениях Арктического срединно-океанического хребта». PNAS . 109 (42): E2846 – E2855 . doi : 10.1073/pnas.1207574109 . PMC 3479504 . PMID  23027979.  
  10. ^ Йоргенсен, Штеффен Лет; Торсет, Ингунн Х.; Педерсен, Рольф Б.; и др. (4 октября 2013 г.). «Количественное и филогенетическое исследование группы глубоководных архей в осадках Арктического срединно-океанического спредингового хребта». Frontiers in Microbiology . 4 : 299. doi : 10.3389/fmicb.2013.00299 . PMC 3790079. PMID  24109477. 
  11. ^ ab Spang, Anja; Saw, Jimmy H.; Jørgensen, Steffen L.; et al. (май 2015 г.). «Сложные археи, которые заполняют пробел между прокариотами и эукариотами». Nature . 521 (7551): 173– 179. Bibcode :2015Natur.521..173S. doi :10.1038/nature14447. PMC 4444528 . PMID  25945739. 
  12. ^ Йонг, Эд. «Прорыв в поисках происхождения сложной жизни». The Atlantic . Получено 21.03.2018 .
  13. ^ фон Шнурбейн, Стефани (ноябрь 2000 г.). «Функция Локи в «Эдде» Снорри Стурлусона.". История религий . 40 (2): 109– 124. doi :10.1086/463618.
  14. ^ Спанг, Аня; Эме, Лора; Со, Джимми Х.; и др. (март 2018 г.). «Археи Асгарда — ближайшие прокариотические родственники эукариот». PLOS Genetics . 14 (3): e1007080. doi : 10.1371/journal.pgen.1007080 . PMC 5875740. PMID  29596421 . 
  15. ^ Seitz, Kiley W.; Lazar, Cassandre S.; Hinrichs, Kai-Uwe; et al. (Июль 2016 г.). «Геномная реконструкция нового, глубоко разветвленного осадочного архейного типа с путями ацетогенеза и восстановления серы». Журнал ISME . 10 (7): 1696–1705 . Bibcode : 2016ISMEJ..10.1696S. doi : 10.1038/ismej.2015.233. PMC 4918440. PMID  26824177. 
  16. ^ Родригес-Оливейра, Тиаго; Воллвебер, Флориан; Понсе-Толедо, Рафаэль И.; и др. (2023-01-12). «Актиновый цитоскелет и сложная клеточная архитектура в архее Асгарда». Nature . 613 (7943): 332– 339. Bibcode :2023Natur.613..332R. doi :10.1038/s41586-022-05550-y. ISSN  0028-0836. PMC 9834061 . PMID  36544020. 
  17. ^ Акыл, Канер; Робинсон, Роберт К. (октябрь 2018 г.). «Геномы архей Асгарда кодируют профилины, которые регулируют актин». Nature . 562 (7727): 439– 443. Bibcode :2018Natur.562..439A. doi :10.1038/s41586-018-0548-6. PMID  30283132. S2CID  52917038.
  18. ^ Акыл, Канер; Тран, Линь Т.; Орхант-Приу, Магали; Баскаран, Йохендран; Мансер, Эдвард; Бланшуан, Лоран; Робинсон, Роберт К. (август 2020 г.). «Взгляд на эволюцию регулируемой динамики актина с помощью характеристики примитивных белков гельзолина/кофилина из архей Асгарда». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (33): 19904– 19913. Bibcode : 2020PNAS..11719904A. bioRxiv 10.1101/768580 . doi : 10.1073/pnas.2009167117 . PMC 7444086. PMID  32747565 .  
  19. ^ Акыл, Канер; Али, Самсон; Тран, Линь Т.; и др. (март 2022 г.). «Структура и динамика тубулина Odinarchaeota и ее значение для эволюции микротрубочек эукариот». Science Advances . 8 (12): eabm2225. Bibcode :2022SciA....8M2225A. doi :10.1126/sciadv.abm2225. PMC 8956254 . PMID  35333570. 
  20. ^ abc Имачи, Хироюки; Нобу, Масару К.; Накахара, Нозоми; и др. (январь 2020 г.). «Изоляция археи на границе прокариот-эукариот». Природа . 577 (7791): 519–525 . Бибкод : 2020Natur.577..519I. дои : 10.1038/s41586-019-1916-6. ПМК 7015854 . ПМИД  31942073. 
  21. ^ Пенев, Петар И.; Фахретаха-Авал, Сара; Патель, Вайшнави Дж.; и др. (октябрь 2020 г.). «Сегменты расширения суперразмерной рибосомальной РНК в археях Асгарда». Genome Biology and Evolution . 12 (10): 1694–1710 . doi : 10.1093/gbe/evaa170 . PMC 7594248. PMID  32785681. 
  22. ^ Тирумалай, Мадхан Р.; Рагхаван, Шивараман В.; Катти, Лейла А.; Сонг, Эрик Л.; Фокс, Джордж Э. (октябрь 2023 г.). «Организация кластера рибосомальных белков у асгардских архей». Архея . 2023 : 16. дои : 10.1155/2023/5512414 . ПМЦ 10833476 . ПМИД  38314098. 
  23. ^ abcd Маклеод, Фрейзер; Киндлер, Гарет С.; Вонг, Хон Лун; Чен, Рэй; Бернс, Брендан П. (2019). «Археи Асгарда: разнообразие, функции и эволюционные последствия в ряде микробиомов». AIMS Microbiology . 5 (1): 48– 61. doi :10.3934/microbiol.2019.1.48. PMC 6646929 . PMID  31384702. 
  24. ^ ab Лю, Ян; Макарова, Кира С.; Хуан, Вэнь-Конг; и др. (2020). «Расширяющееся разнообразие архей Асгарда и неуловимая родословная эукариот». bioRxiv . doi :10.1101/2020.10.19.343400. S2CID  225056970.
  25. ^ Цай, Минвэй; Рихтер-Хайтманн, Тим; Инь, Сюран; и др. (2021). «Экологические особенности и глобальное распространение архей Асгарда». Наука об общей окружающей среде . 758 : 143581. Бибкод : 2021ScTEn.75843581C. doi : 10.1016/j.scitotenv.2020.143581. ISSN  0048-9697. PMID  33223169. S2CID  227134171.
  26. ^ Хеннеман, Брэм; ван Эммерик, Клара; ван Инген, Хьюго; Дама, Ремус Т. (сентябрь 2018 г.). «Структура и функции гистонов архей». ПЛОС Генетика . 14 (9): e1007582. Бибкод : 2018BpJ...114..446H. дои : 10.1371/journal.pgen.1007582 . ПМК 6136690 . ПМИД  30212449. 
  27. ^ Циммер, Карл (15 января 2020 г.). «Этот странный микроб может стать одним из великих скачков жизни — организм, живущий в океанском иле, дает ключ к разгадке происхождения сложных клеток всех животных и растений». The New York Times . Получено 16 января 2020 г.
  28. ^ Лю, Ян; Макарова, Кира С.; Хуан, Вэнь-Цун; Вольф, Юрий И.; Никольская, Анастасия; Чжан, Синьсюй; и др. (май 2021 г.). «Расширенное разнообразие архей Асгарда и их связи с эукариотами». Nature . 593 (7860): 553– 557. Bibcode :2021Natur.593..553L. doi :10.1038/s41586-021-03494-3. PMC 11165668 . PMID  33911286. S2CID  233447651. 
  29. ^ ab "GTDB release 09-RS220". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
  30. ^ ab "ar53_r220.sp_label". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
  31. ^ ab "Taxon History". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2024 г.
  32. ^ ab Eme, Laura; Tamarit, Daniel; Caceres, Eva F.; et al. (2023-06-14). «Вывод и реконструкция heimdallarchaeial ancestry of eukaryotes». Nature . 618 (7967): 992– 999. Bibcode :2023Natur.618..992E. doi :10.1038/s41586-023-06186-2. PMC 10307638 . PMID  37316666. 
  33. ^ Latorre, A.; Durban, A.; Moya, A.; Pereto, J. (2011). «Роль симбиоза в эволюции эукариот». В Gargaud, M.; López-Garcìa, P.; Martin H. (ред.). Происхождение и эволюция жизни: астробиологическая перспектива . Кембридж: Cambridge University Press . стр.  326–339 . ISBN 978-0-521-76131-4. Архивировано из оригинала 24 марта 2019 . Получено 27 августа 2017 .
  34. ^ Лопес-Гарсия, Очищение; Морейра, Дэвид (июль 2019 г.). «Эукариогенез, дело синтрофии». Природная микробиология . 4 (7): 1068–1070 . doi : 10.1038/s41564-019-0495-5. ПМК 6684364 . ПМИД  31222170. 
  35. ^ Родригес-Оливейра, Тиаго; Воллвебер, Флориан; Понсе-Толедо, Рафаэль И.; Сюй, Цзинвэй; Риттманн, Саймон К.-МР; Клингль, Андреас; Пилхофер, Мартин; Шлепер, Криста (январь 2023 г.). «Актиновый цитоскелет и сложная клеточная архитектура архея Асгарда». Nature . 613 (7943): 332– 339. Bibcode :2023Natur.613..332R. doi :10.1038/s41586-022-05550-y. ISSN  1476-4687. PMC 9834061 . PMID  36544020. 
  36. ^ Фурнье, Грегори П.; Пул, Энтони М. (15.08.2018). «Кратко аргументированное утверждение о том, что археи Асгарда являются частью дерева эукариот». Frontiers in Microbiology . 9 : 1896. doi : 10.3389/fmicb.2018.01896 . ISSN  1664-302X. PMC 6104171. PMID 30158917  . 
  37. ^ Euzéby, JP "Superphylum "Asgardarchaeota"". Список названий прокариот со стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 27.06.2021 .
  38. ^ "Asgard group". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 2021-03-20 .
  39. ^ abcdefg Медведева, С.; Сан, Дж.; Ютин, Н.; Кунин, Евгений В .; Нуноура, Т.; Ринке, К.; Крупович, М. (июль 2022 г.). «Три семейства архейных вирусов Асгарда, идентифицированные в собранных метагеном геномах». Nature Microbiology . 7 (7): 962– 973. doi :10.1038/s41564-022-01144-6. PMC 11165672 . PMID  35760839. S2CID  250091635. 
  40. ^ abcd Тамарит, Д.; Касерес, EF; Крупович, М.; Нийланд, Р.; Эме, Л.; Робинсон, Северная Каролина; Эттема, TJG (июль 2022 г.). «Закрытая хромосома Candidatus Odinarchaeum обнажает вирусы архей Асгарда». Природная микробиология . 7 (7): 948–952 . doi : 10.1038/s41564-022-01122-y. ПМЦ 9246712 . PMID  35760836. S2CID  250090798. 
  41. ^ abc Rambo, IM; Langwig, MV; Leão, P.; De Anda, V.; Baker, BJ (июль 2022 г.). «Геномы шести вирусов, которые заражают археи Асгарда из глубоководных отложений». Nature Microbiology . 7 (7): 953–961 . doi : 10.1038/s41564-022-01150-8 . PMID  35760837.
  42. ^ Prangishvili, D.; Bamford, DH; Forterre, P.; Iranzo, J.; Koonin, Eugene V.; Krupovic, M. (ноябрь 2017 г.). «Загадочная архейная виросфера». Nature Reviews. Microbiology . 15 (12): 724– 739. doi :10.1038/nrmicro.2017.125. PMID  29123227. S2CID  21789564.
  43. ^ Аларкон-Шумахер, Т.; Эрдманн, С. (июль 2022 г.). «Кладбище архейных вирусов Асгарда». Nature Microbiology . 7 (7): 931– 932. doi :10.1038/s41564-022-01148-2. PMID  35760838. S2CID  250091028.
  44. ^ Wu, F.; Speth, DR; Philosof, A.; et al. (февраль 2022 г.). «Уникальные мобильные элементы и масштабируемый поток генов на границе прокариот и эукариот, выявленные с помощью кольцевых геномов архей Asgard». Nature Microbiology . 7 (2): 200– 212. doi :10.1038/s41564-021-01039-y. PMC 8813620 . PMID  35027677. 
  • Трейси Уотсон: Микробы-обманщики, которые сотрясают древо жизни, в: Nature , 14 мая 2019 г.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Асгард_(Археи)&oldid=1267602683"