Аполипопротеин C-II

Доступные структуры белков:
Пфам	структуры / ECOD
ПДБ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	резюме структуры

Апо-CII
Апо-CII
	структура ямр человеческого аполипопротеина c-ii в присутствии sds
Идентификаторы
Символ	Апо-CII
Пфам	ПФ05355
ИнтерПро	IPR008019
СКОП2	1by6 / SCOPe / SUPFAM
Пфам
Доступные структуры белков:
Пфам	структуры / ECOD
ПДБ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	резюме структуры

APOC2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1SOH, 1BY6, 1I5J, 1O8T
Идентификаторы
Псевдонимы	APOC2 , APO-CII, APOC-II, аполипопротеин C2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 608083; МГИ : 88054; гомологен : 47928; GeneCards : APOC2; OMA :APOC2 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 19 (человек)
Конец	44,949,565 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 7 (мышь)
Конец	19,411,866 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	правая доля печени; ; черная субстанция; ; Сегмент С1; ; двенадцатиперстная кишка; ; хвостатое ядро; ; путамен; ; Миндалевидное тело; ; яичко; ; прилежащее ядро; ; Гипоталамус;
	Верх выражен в
	желточный мешок; ; двенадцатиперстная кишка; ; печень; ; тощая кишка; ; подвздошная кишка; ; сперматоцит; ; толстая кишка; ; гранулоцит; ; легочная альвеола; ; стенка легочной альвеолы;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	активность ингибитора липазы; связывание фосфолипазы; активность гомодимеризации белка; активность активатора липопротеинлипазы; активность активатора фосфолипазы; активность активатора фермента; связывание липидов;
Клеточный компонент	хиломикроны; частица липопротеина очень низкой плотности; сферическая частица липопротеина высокой плотности; внеклеточная область; ранняя эндосома; частица липопротеина низкой плотности; липопротеин высокой плотности частица; частица липопротеина промежуточной плотности; внеклеточное пространство;
Биологический процесс	очистка от частиц липопротеинов высокой плотности; транспорт липидов; позитивная регуляция процесса катаболизма триглицеридов; клиренс остатков хиломикронов; липидный обмен веществ; отток фосфолипидов; положительная регуляция активности липопротеинлипазы; позитивная регуляция процесса биосинтеза жирных кислот; негативная регуляция клиренса липопротеиновых частиц очень низкой плотности; метаболический процесс ретиноида; отрицательная регуляция рецепторно-опосредованного эндоцитоза; липидный катаболический процесс; положительная регуляция активности фосфолипазы; позитивная регуляция процесса катаболизма фосфолипидов; отток холестерина; ремоделирование частиц липопротеинов очень низкой плотности; негативная регуляция транспорта холестерина; гомеостаз холестерина; позитивная регуляция ремоделирования частиц липопротеинов очень низкой плотности; ремоделирование липопротеиновых частиц, богатых триглицеридами; гомеостаз триглицеридов; негативная регуляция липидного обменного процесса; обратный транспорт холестерина; отрицательная регуляция каталитической активности; транспорт липопротеинов; ремоделирование хиломикронов; ремоделирование частиц липопротеинов высокой плотности; сборка хиломикронов; позитивная регуляция каталитической активности;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	344
	11813
	ENSG00000234906
	ENSMUSG00000002992
	Р02655
	Q05020
	NM_000483
	NM_001277944 ; NM_001309795
	NP_000474 ; NP_000474.2
	НП_001296728 ; НП_001264873 ; НП_001296724
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Семейство белков

Аполипопротеин C-II ( Apo-CII, или Apoc-II ), или аполипопротеин C2 — это белок , который у человека кодируется геном APOC2 .

Белок, кодируемый этим геном, секретируется в плазму, где он является компонентом липопротеинов очень низкой плотности и хиломикронов . Этот белок активирует фермент липопротеинлипазу в капиллярах, ^[5] который гидролизует триглицериды и, таким образом, обеспечивает свободные жирные кислоты и глицерины для клеток. Мутации в этом гене вызывают гиперлипопротеинемию типа IB , характеризующуюся ксантомами , панкреатитом и гепатоспленомегалией , но не повышенным риском атеросклероза . Лабораторные анализы покажут повышенный уровень триглицеридов, холестерина и хиломикронов в крови ^[6]

Интерактивная карта маршрутов

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьям. ^{[§ 1]}

^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «Statin_Pathway_WP430».

Смотрите также

Аполипопротеин С

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000234906 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000002992 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ким SY, Пак SM, Ли ST (2006). «Аполипопротеин C-II — новый субстрат для матриксных металлопротеиназ». Biochem. Biophys. Res. Commun . 339 (1): 47– 54. doi :10.1016/j.bbrc.2005.10.182. PMID 16314153.
^ "Ген Энтреза: аполипопротеин C-II APOC2".

Джексон Р.Л., Бейкер Х.Н., Гиллиам Э.Б., Готто А.М. (1977). «Первичная структура аполипопротеина C-II очень низкой плотности человеческой плазмы». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 74 (5): 1942– 5. Bibcode :1977PNAS...74.1942J. doi : 10.1073/pnas.74.5.1942 . PMC 431048 . PMID 194244.
Lycksell PO, Ohman A, Bengtsson-Olivecrona G и др. (1992). "Последовательно-специфические 1H-ЯМР-распределения и вторичная структура карбокси-концевого функционального фрагмента аполипопротеина CII". Eur. J. Biochem . 205 (1): 223– 31. doi : 10.1111/j.1432-1033.1992.tb16772.x . PMID 1555583.
Hegele RA, Connelly PW, Maguire GF и др. (1992). «Мутация аполипопротеина CII, CIILys19----Thr', выявленная у пациентов с гиперлипидемией». Dis. Markers . 9 (2): 73– 80. PMID 1782747.
Crecchio C, Capurso A, Pepe G (1990). «Идентификация мутации, ответственной за случай дефицита плазматического аполипопротеина CII (Apo CII-Bari)». Biochem. Biophys. Res. Commun . 168 (3): 1118– 27. doi :10.1016/0006-291X(90)91145-I. PMID 1971748.
Bengtsson-Olivecrona G, Sletten K (1990). «Первичная структура бычьих аналогов человеческих аполипопротеинов CII и CIII. Исследования изоформ и доказательства протеолитической обработки». Eur. J. Biochem . 192 (2): 515–21 . doi : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb19255.x . PMID 2209608.
Wei CF, Tsao YK, Robberson DL и др. (1986). «Структура гена человеческого аполипопротеина C-II. Электронно-микроскопический анализ гибридов РНК:ДНК, полная нуклеотидная последовательность и идентификация 5'-гомологичных последовательностей среди генов аполипопротеина». J. Biol. Chem . 260 (28): 15211– 21. doi : 10.1016/S0021-9258(18)95724-8 . PMID 2415514.
Fojo SS, Lohse P, Parrott C и др. (1989). «Ненсенс-мутация в гене аполипопротеина C-IIPadova у пациента с дефицитом аполипопротеина C-II». J. Clin. Invest . 84 (4): 1215– 9. doi :10.1172/JCI114287. PMC 329780. PMID 2477392 .
Jackson CL, Bruns GA, Breslow JL (1986). "Изоляция кДНК и геномных клонов для аполипопротеина C-II" . В Segrest JP, Albers JA (ред.). Плазменные липопротеины Часть A: Подготовка, структура и молекулярная биология . Методы в энзимологии. Т. 128. Elsevier. С. 788–800. doi :10.1016/0076-6879(86)28106-9. ISBN 9780121820282. PMID 3014272.
Fojo SS, Law SW, Brewer HB (1987). "Ген человеческого препроаполипопротеина C-II. Полная последовательность нуклеиновой кислоты и геномная организация". FEBS Lett . 213 (1): 221– 6. Bibcode : 1987FEBSL.213..221F. doi : 10.1016/0014-5793(87)81495-3 . PMID 3030808. S2CID 42223577.
Fojo SS, Stalenhoef AF, Marr K, et al. (1989). «Делеционная мутация в гене ApoC-II (ApoC-II Nijmegen) у пациента с дефицитом аполипопротеина C-II». J. Biol. Chem . 263 (34): 17913– 6. doi : 10.1016/S0021-9258(19)81302-9 . PMID 3192518.
Фойо С.С., Бейзигель У., Бейл У. и др. (1988). «Мутация донорского сайта сплайсинга в гене аполипопротеина (Apo) C-II (Apo C-IIHamburg) пациента с дефицитом Apo C-II». Дж. Клин. Инвестируйте . 82 (5): 1489–94 . doi : 10.1172/JCI113756. ПМЦ 442713 . ПМИД 3263393.
Connelly PW, Maguire GF, Hofmann T, Little JA (1987). "Структура аполипопротеина C-IIToronto, нефункционального человеческого аполипопротеина". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 84 (1): 270– 3. Bibcode :1987PNAS...84..270C. doi : 10.1073/pnas.84.1.270 . PMC 304185 . PMID 3467353.
Fairwell T, Hospattankar AV, Brewer HB, Khan SA (1987). "Аполипопротеин C-II плазмы человека: полный твердофазный синтез и химическая и биологическая характеристика". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 84 (14): 4796– 800. Bibcode :1987PNAS...84.4796F. doi : 10.1073/pnas.84.14.4796 . PMC 305192 . PMID 3474626.
Fojo SS, Taam L, Fairwell T и др. (1986). "Человеческий препроаполипопротеин C-II. Анализ основных плазменных изоформ". J. Biol. Chem . 261 (21): 9591– 4. doi : 10.1016/S0021-9258(18)67554-4 . PMID 3525527.
Das HK, Jackson CL, Miller DA и др. (1987). «Последовательность гена человеческого аполипопротеина C-II содержит новый специфичный для хромосомы 19 минисателлит в третьем интроне». J. Biol. Chem . 262 (10): 4787– 93. doi : 10.1016/S0021-9258(18)61264-5 . PMID 3558370.
Connelly PW, Maguire GF, Little JA (1988). «Аполипопротеин CIISt. Michael. Семейный дефицит аполипопротеина CII, связанный с преждевременным сосудистым заболеванием». J. Clin. Invest . 80 (6): 1597– 606. doi :10.1172/JCI113246. PMC 442428. PMID 3680515 .
Baggio G, Manzato E, Gabelli C и др. (1986). «Синдром дефицита аполипопротеина C-II. Клинические особенности, характеристика липопротеина, активность липазы и коррекция гипертриглицеридемии после введения аполипопротеина C-II двум затронутым пациентам». J. Clin. Invest . 77 (2): 520– 7. doi :10.1172/JCI112332. PMC 423374. PMID 3944267 .
Menzel HJ, Kane JP, Malloy MJ, Havel RJ (1986). «Вариант первичной структуры аполипопротеина C-II у лиц африканского происхождения». J. Clin. Invest . 77 (2): 595– 601. doi :10.1172/JCI112342. PMC 423392. PMID 3944271 .
Sharpe CR, Sidoli A, Shelley CS и др. (1984). «Человеческие аполипопротеины AI, AII, CII и CIII. Последовательности кДНК и распространенность мРНК». Nucleic Acids Res . 12 (9): 3917– 32. doi : 10.1093 /nar/12.9.3917. PMC 318799. PMID 6328445.
Jackson CL, Bruns GA, Breslow JL (1984). "Выделение и последовательность клона ДНК человеческого аполипопротеина CII и его использование для выделения и картирования гена аполипопротеина CII на хромосоме 19 человека". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 81 (10): 2945– 9. Bibcode :1984PNAS...81.2945J. doi : 10.1073/pnas.81.10.2945 . PMC 345197 . PMID 6328478.

Внешние ссылки

Расположение генома человека APOC2 и страница с подробностями гена APOC2 в браузере геномов UCSC .

[WikiPathways-7] Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «Statin_Pathway_WP430».

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000234906 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000002992 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid16314153-5] Ким SY, Пак SM, Ли ST (2006). «Аполипопротеин C-II — новый субстрат для матриксных металлопротеиназ». Biochem. Biophys. Res. Commun . 339 (1): 47– 54. doi :10.1016/j.bbrc.2005.10.182. PMID 16314153.

[entrez-6] "Ген Энтреза: аполипопротеин C-II APOC2".