Альтернативный ядерный код дрожжей

Альтернативный генетический код, обнаруженный в ядерном геноме некоторых дрожжей

Альтернативный ядерный код дрожжей (таблица перевода 12 ) — это генетический код , обнаруженный у некоторых дрожжей. Однако другие дрожжи, включая Saccharomyces cerevisiae , Candida azyma , Candida diversa , Candida magnoliae , Candida rugopelliculosa , Yarrowia lipolytica и Zygoascus hellenicus , определенно используют стандартный (ядерный) код. ^[1]

Код

AAs = FFLLSSSSYY**CC*WLLLSPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSRRVVVVAAAADDEEGGGG

Starts = -------------------M---------------M----------------------------

Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG

Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG

Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

Основания: аденин (А), цитозин (С), гуанин (Г) и тимин (Т) или урацил (У).

Аминокислоты: аланин (Ala, A), аргинин (Arg, R), аспарагин (Asn, N), аспарагиновая кислота (Asp, D), цистеин (Cys, C), глутаминовая кислота (Glu, E), глутамин (Gln, Q), глицин (Gly, G), гистидин (His, H), изолейцин (Ile, I), лейцин (Leu, L), лизин (Lys, K), метионин (Met, M), фенилаланин (Phe, F), пролин (Pro, P), серин (Ser, S), треонин (Thr, T), триптофан (Trp, W), тирозин (Tyr, Y), валин (Val, V).

Отличия от стандартного кода


ДНК-кодоны	РНК-кодоны	Этот код (12)		Стандартный код (1)
`CTG`	`CUG`	`Ser` `(S)`		`Leu` `(L)`

Альтернативные инициирующие кодоны

CAG может быть использован при Candida albicans . ^[2]

Систематический диапазон

Эндомицеты (дрожжи): Candida albicans , Candida cylindracea , Candida melibiosica , Candida parapsilosis и Candida rugosa . ^[1]

Смотрите также

Список генетических кодов

Ссылки

В этой статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии . ^[3]

^ ab T. Ohama; T. Suzuki; M. Mori; S. Osawa; T. Ueda; K. Watanabe; T. Nakase (25 августа 1993 г.). «Неуниверсальное декодирование кодона лейцина CUG у нескольких видов Candida». Nucleic Acids Res . 21 (17): 4039– 45. doi :10.1093/nar/21.17.4039. PMC 309997. PMID 8371978 .
^ MA Santos; G. Keith; MF Tuite (февраль 1993 г.). «Нестандартные трансляционные события в Candida albicans, опосредованные необычной серил-тРНК с 5'-CAG-3' (лейцин) антикодоном». EMBO J . 12 (2): 607– 16. doi :10.1002/j.1460-2075.1993.tb05693.x. PMC 413244 . PMID 8440250.
^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. "The Genetic Codes". Таксономический браузер . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Получено 19 марта 2016 г.

Эта статья по генетике — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[Omaha-1] T. Ohama; T. Suzuki; M. Mori; S. Osawa; T. Ueda; K. Watanabe; T. Nakase (25 августа 1993 г.). «Неуниверсальное декодирование кодона лейцина CUG у нескольких видов Candida». Nucleic Acids Res . 21 (17): 4039– 45. doi :10.1093/nar/21.17.4039. PMC 309997. PMID 8371978 .

[Santos-2] MA Santos; G. Keith; MF Tuite (февраль 1993 г.). «Нестандартные трансляционные события в Candida albicans, опосредованные необычной серил-тРНК с 5'-CAG-3' (лейцин) антикодоном». EMBO J . 12 (2): 607– 16. doi :10.1002/j.1460-2075.1993.tb05693.x. PMC 413244 . PMID 8440250.

[NCBI-3] Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. "The Genetic Codes". Таксономический браузер . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Получено 19 марта 2016 г.