Addgene
Некоммерческая организация по хранению плазмид
Addgene
Основан2004
ОсновательБенджи Чен
Кеннет Фан
Мелина Фан
ТипНекоммерческая организация , центр биологических ресурсов
Расположение
УслугиРепозиторий плазмид
Ключевые люди
Чоннеттиа Джонс , исполнительный директор

Addgene — некоммерческий репозиторий плазмид . Addgene облегчает обмен генетическим материалом между лабораториями, предлагая плазмиды и связанные с ними данные клонирования некоммерческим и академическим лабораториям по всему миру. Addgene предоставляет бесплатную онлайн-базу данных и ссылок на клонирование плазмид, включая списки часто используемых векторных остовов, популярных лентивирусных плазмид и протоколов молекулярного клонирования .

История

Addgene был основан в 2004 году Мелиной Фан, Кеннетом Фан и Бенджи Ченом. [1] [2] [3] Репозиторий был основан в знак признания необходимости в сервисе для поддержки доступа и обмена материалами исследований на основе ДНК среди научного сообщества. [3]

Операции

Штаб-квартира Addgene находится в Уотертауне, штат Массачусетс .

Addgene принимает плазмиды от исследователей для распространения и архивирования.

Организация покрывает эксплуатационные расходы на поддержание и улучшение коллекции, взимая номинальную плату с ученых, запрашивающих плазмиды. [4] [5]

Репозиторий плазмид

По состоянию на 2014 год репозиторий Addgene включал 30 000 плазмид, депонированных 1700 лабораториями. [6] По состоянию на 2024 год коллекция выросла до размера более 147 000 плазмид и предоставила услуги более чем 2 миллионам векторов в более чем 110 различных странах. [3] Его коллекция плазмид содержит плазмиды, используемые для таких функций, как генная инженерия (включая CRISPRS), экспрессия генов , нокдаун shRNA , вирусно-опосредованная доставка генов, обнаружение miRNA и активности промотора. Коллекция плазмид включает:

Инструменты и руководства

Инструменты молекулярной биологии

База данных векторов — тщательно отобранный список из более чем 4000 векторных остовов, включая соответствующую информацию о клонировании и условиях роста бактерий.

Sequence Analyzer — программный инструмент Addgene для создания плазмидных карт из последовательностей с аннотированными характеристиками и сайтами рестрикции.

Справочник по молекулярной биологии — сборник справочников по реагентам молекулярной биологии, таким как праймеры, рестрикционные ферменты и концентрации антибиотиков.

Руководства по клонированию плазмид

Руководства по молекулярному клонированию — справочные материалы, помогающие ученым разрабатывать эксперименты по клонированию плазмид, включая руководства по расщеплению рестриктазами и клонированию на основе ПЦР.

Протоколы молекулярного клонирования — специальные протоколы для различных методов клонирования плазмид, таких как выделение бактериальных колоний, очистка ДНК с помощью гель-электрофореза и бактериальная трансформация.

Сотрудничества

Addgene сотрудничает с институтами и консорциумами для курирования коллекций плазмид для определенных целей. Примерами такого сотрудничества являются специальные коллекции от Structural Genomics Consortium , Zinc Finger Consortium, Cell Migration Consortium, коллекции KLF и The Michael J. Fox Foundation . [7] Плазмиды доступны как для академических, так и для промышленных лабораторий.

В 2020 году Addgene получила финансирование от Fast Grants для субсидирования стоимости реагентов для исследования COVID-19 . [8]

Вкладчики

Среди заслуживающих внимания вкладчиков: [ необходима ссылка ]

Соглашения о передаче электронных материалов

Addgene требует Соглашения о передаче материалов (MTA) для всех материалов, передаваемых через Addgene, чтобы защитить интеллектуальную собственность депозиторов плазмид. Addgene разработала одну из первых электронных систем для обработки MTA. [9] Используя стандартное Универсальное соглашение о передаче биологических материалов (UBMTA) и внедряя электронные подписи, электронная система MTA (eMTA) Addgene ускоряет процесс утверждения заказов на плазмиды.

Награды

Addgene завоевала награды за инновации и исследования, включая премию Mass Nonprofit Network Award за выдающиеся достижения в области инноваций [10] [11], премию Cambridge award program 2014 Award for Research & Development Laboratories [12], финалист премии Mass Technology Leadership Award 2012. [13]

Ссылки

  1. ^ Скуделлари, Меган (2012). «Обмен стал проще». The Scientist . Получено 21 ноября 2012 г.
  2. ^ Фань, М; Цай, Дж; Чен, Б; Фань, К; ЛаБэр, Дж (25 марта 2005 г.). «Центральный репозиторий опубликованных плазмид». Science . 307 (5717): 1877. doi :10.1126/science.307.5717.1877a. PMID  15790830.
  3. ^ abc Реммель, Ариана (2024-09-30). «Двадцать лет Addgene». Nature . 634 (8032): 254–256. doi :10.1038/d41586-024-03152-4.
  4. ^ Каменс, Дж. (2012). «Есть ли плазмиды?» (PDF) . Lab Times . стр. 58–59 . Получено 21 ноября 2012 г. .
  5. ^ Бейкер, Монья (2014-01-01). «Репозитории делятся ключевыми исследовательскими инструментами». Nature . 505 (7483): 272–272. doi : 10.1038/505272a . ISSN  1476-4687.
  6. ^ Бейкер, Монья. «Репозитории делятся ключевыми исследовательскими инструментами». Nature.com . Получено 8 мая 2014 г.
  7. ^ Резенде, Патрисия (3 октября 2012 г.). «Addgene partners with Michael J. Fox Foundation». Mass High Tech . Архивировано из оригинала 9 октября 2012 г. Получено 21 ноября 2012 г.
  8. ^ "Быстрые гранты". Быстрые гранты . Архивировано из оригинала 2021-12-23 . Получено 2023-05-21 .
  9. ^ Херскович, Мелани; Перкинс, Эрик; Балтус, Энди; Фэн, Мелина (10 апреля 2012 г.). «Addgene предоставляет открытый форум для обмена плазмидами». Nature Biotechnology . 30 (4): 316–317. doi :10.1038/nbt.2177. PMID  22491276.
  10. ^ "массовая некоммерческая сеть номинирует addgene на премию за выдающиеся достижения" (PDF) . Получено 9 мая 2014 г.
  11. ^ "массовая некоммерческая организация, финалисты премии некоммерческой организации 2013 года за выдающиеся достижения в области инноваций". Архивировано из оригинала 2013-09-02 . Получено 9 мая 2014 .
  12. ^ "Cambridge recognize awarding" . Получено 9 мая 2014 г. .
  13. ^ "Mass Tech объявляет финалиста". Архивировано из оригинала 17 апреля 2014 года . Получено 9 мая 2014 года .
  • Официальный сайт

Другие репозитории плазмид

  • BCCM /LMBP
  • Набор инструментов BIOSS
  • PSI ДНКСУ
  • Гарвардский PlasmID
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Addgene&oldid=1250225129"