Белок-переносчик ацила
| Белок-переносчик ацил/пептидилов | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ACP-like_sf | ||||||||
| Пфам | ПФ00550 | ||||||||
| Клан ПФАМ | CL0314 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR036736 | ||||||||
| ПРОСИТ | PDOC00012 | ||||||||
| КАТ | 1nq4 | ||||||||
| СКОП2 | 1nq4 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Белок -переносчик ацила ( ACP ) является кофактором как жирнокислотного , так и поликетидного биосинтезного аппарата. Это один из наиболее распространенных белков в клетках E. coli. [1] В обоих случаях растущая цепь связана с ACP через тиоэфир, полученный из дистального тиола 4'- фосфопантетеинового фрагмента.
Структура
ACP — это небольшие отрицательно заряженные α-спиральные пучковые белки с высокой степенью структурного и аминокислотного сходства. Структуры ряда ацилпереносящих белков были решены с использованием различных методов ЯМР и кристаллографии. ACP связаны по структуре и механизму с пептидилпереносящими белками (PCP) из нерибосомальных пептидсинтаз. [2] [3] [4] [5]
Биосинтез
После экспрессии неактивного апо АЦП фрагмент 4'-фосфопантетеина присоединяется к остатку серина. Это соединение опосредовано ацилпереносящей протеинсинтазой (ACPS), 4'-фосфопантетеинилтрансферазой . 4'- Фосфопантетеин является простетической группой нескольких ацилпереносящих протеинов, включая ацилпереносящие протеины (ACP) синтазы жирных кислот , ACP поликетидсинтаз , пептидилпереносящие протеины (PCP), а также арильные переносящие протеины (ArCP) нерибосомальных пептидсинтетаз (NRPS).
Ссылки
- ^ Кронан, Джон Э. (2014). «Механизм переворачивания цепи ферментов, зависимых от ACP (Acyl Carrier Protein), кажется универсальным». Biochemical Journal . 460 (2): 157– 163. doi : 10.1042/BJ20140239. PMID 24825445.
- ^ Roujeinikova A, Baldock C, Simon WJ, Gilroy J, Baker PJ, Stuitje AR, Rice DW, Slabas AR, Rafferty JB (июнь 2002 г.). "Рентгеновские кристаллографические исследования бутирил-АЦП выявляют гибкость структуры вокруг предполагаемого места связывания ацильной цепи". Structure . 10 (6). London, England: 825–35 . doi : 10.1016/s0969-2126(02)00775-x . PMID 12057197.
- ^ Crawford JM, Vagstad AL, Ehrlich KC, Udwary DW, Townsend CA (июль 2008 г.). «Партнерства ацил-переносящего белка и фосфопантетеинилтрансферазы в грибковых синтазах жирных кислот». ChemBioChem . 9 (10): 1559– 63. doi :10.1002/cbic.200700659. PMC 3189688 . PMID 18551496.
- ^ Volkman BF, Zhang Q, Debabov DV, Rivera E, Kresheck GC, Neuhaus FC (июль 2001 г.). «Биосинтез D-аланил-липотейхоевой кислоты: третичная структура белка-переносчика апо-D-аланила». Биохимия . 40 (27): 7964– 72. doi :10.1021/bi010355a. PMID 11434765.
- ^ Вебер Т., Баумгартнер Р., Реннер С., Марахиэль МА., Холак ТА. (апрель 2000 г.). «Структура раствора PCP, прототипа доменов-переносчиков пептидилов модульных пептидсинтетаз». Структура . 8 (4): 407–18 . doi : 10.1016/s0969-2126(00)00120-9 . PMID 10801488.
Внешние ссылки
- Белок-переносчик ацилов в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
