АТП5ПФ

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
АТП5ПФ
Идентификаторы
ПсевдонимыATP5PF , ATP5, ATP5A, ATPM, CF6, F6, АТФ-синтаза, транспортировка H+, митохондриальная субъединица комплекса Fo F6, периферическая субъединица стебля АТФ-синтазы F6, ATP5J
Внешние идентификаторыОМИМ : 603152; МГИ : 107777; Гомологен : 1272; GeneCards : ATP5PF; ОМА :ATP5PF – ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (белок)
Местоположение (UCSC)Хр 21: 25.72 – 25.74 МбХр 16: 84,62 – 84,63 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши
Семейство белков
Фактор связи митохондриальной АТФ-синтазы 6 (F6)
структура раствора субъединицы f6 из периферической области стебля АТФ-синтазы из митохондрий бычьего сердца
Идентификаторы
СимволАТФ-синтез_F6
ПфамПФ05511
ИнтерПроIPR008387
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры

Фактор сопряжения АТФ-синтазы 6, митохондриальный, представляет собой ферментную субъединицу , которая у человека кодируется геном ATP5PF . [ 5] [6] [7]

Функция

Митохондриальная АТФ-синтаза катализирует синтез АТФ, используя электрохимический градиент протонов через внутреннюю мембрану во время окислительного фосфорилирования. Она состоит из двух связанных многосубъединичных комплексов: растворимого каталитического ядра, F 1 , и мембранного компонента, F O , который включает протонный канал. Комплекс F 1 состоит из 5 различных субъединиц (альфа, бета, гамма, дельта и эпсилон), собранных в соотношении 3 альфа, 3 бета и одного представителя остальных 3. F O , по-видимому, имеет девять субъединиц (a, b, c, d, e, f, g, F6 и 8). Этот ген кодирует субъединицу F6 комплекса F O , необходимую для взаимодействий F 1 и F O . Для этого гена были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы. [7]

Субъединица F6 является частью периферического стебля, который связывает комплексы F1 и FO вместе , и который действует как статор, предотвращая вращение определенных субъединиц с центральным вращающимся элементом. Периферический стебель отличается по составу субъединиц между митохондриальными , хлоропластными и бактериальными F-АТФазами . В митохондриях периферический стебель состоит из одной копии каждой из субъединиц OSCP ( белок, придающий чувствительность к олигомицину ), F6, b и d. [8] Гомолога субъединицы F6 нет в бактериальной или хлоропластной F-АТФазе, периферические стебли которой состоят из одной копии дельта-субъединицы (гомологичной OSCP) и двух копий субъединицы b в бактериях или одной копии каждой из субъединиц b и b' в хлоропластах и ​​фотосинтезирующих бактериях .

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000154723 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022890 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Хигути Т, Цуруми С, Кавамура Ю, Цудзита Х, Осака Ф, Ёшихара Ю, Тани I, Танака К, Итихара А (июль 1991 г.). «Молекулярное клонирование кДНК для импортного предшественника человеческого фактора сопряжения 6 H (+)-АТФ-синтазы в митохондриях». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 178 (2): 793–9 . doi :10.1016/0006-291X(91)90178-A. ПМИД  1830479.
  6. ^ Javed AA, Ogata K, Sanadi DR (январь 1991). "Митохондриальная АТФ-синтаза человека: клонирование кДНК для кодируемого в ядре предшественника фактора сопряжения 6". Gene . 97 (2): 307– 10. doi :10.1016/0378-1119(91)90068-M. PMID  1825642.
  7. ^ ab "Ген Entrez: ATP5PF АТФ-синтаза периферическая стебельная субъединица F6".
  8. ^ Carbajo RJ, Kellas FA, Runswick MJ, Montgomery MG, Walker JE, Neuhaus D (август 2005 г.). «Структура домена связывания F1 статора бычьей F1Fo-АТФазы и как она связывает альфа-субъединицу». Журнал молекулярной биологии . 351 (4): 824–38 . doi :10.1016/j.jmb.2005.06.012. PMID  16045926.

Дальнейшее чтение

  • Киносита К, Ясуда Р, Ноджи Х (2003). «F1-АТФаза: высокоэффективная роторная машина АТФ». Очерки по биохимии . 35 : 3–18 . doi :10.1042/bse0350003. PMID  12471886.
  • Остер Г., Ван Х. (март 2003 г.). «Вращающиеся белковые моторы». Тенденции в клеточной биологии . 13 (3): 114– 21. doi :10.1016/S0962-8924(03)00004-7. PMID  12628343.
  • Leyva JA, Bianchet MA, Amzel LM (2003). «Понимание синтеза АТФ: структура и механизм F1-АТФазы (обзор)». Молекулярная мембранная биология . 20 (1): 27– 33. doi : 10.1080/0968768031000066532 . PMID  12745923. S2CID  218895820.
  • Hochstrasser DF, Frutiger S, Paquet N, Bairoch A, Ravier F, Pasquali C, Sanchez JC, Tissot JD, Bjellqvist B, Vargas R (декабрь 1992 г.). «Карта белков печени человека: справочная база данных, созданная с помощью микросеквенирования и сравнения гелей». Электрофорез . 13 (12): 992– 1001. doi :10.1002/elps.11501301201. PMID  1286669. S2CID  23518983.
  • Yan WL, Lerner TJ, Haines JL, Gusella JF (ноябрь 1994 г.). "Анализ последовательности и картирование новой человеческой митохондриальной субъединицы АТФ-синтазы 9 кДНК (ATP5G3)". Genomics . 24 (2): 375– 7. doi :10.1006/geno.1994.1631. PMID  7698763.
  • Elston T, Wang H, Oster G (январь 1998). «Трансдукция энергии в АТФ-синтазе». Nature . 391 (6666): 510– 3. Bibcode :1998Natur.391..510E. doi :10.1038/35185. PMID  9461222. S2CID  4406161.
  • Вебстер КА, Оливер НА, Уоллес ДК (март 1982). «Присвоение локуса устойчивости к олигомицину хромосоме 10 человека». Somatic Cell Genetics . 8 (2): 223– 44. doi :10.1007/BF01538679. PMID  9732751. S2CID  12445064.
  • Wang H, Oster G (ноябрь 1998). «Трансдукция энергии в моторе F1 синтазы АТФ». Nature . 396 (6708): 279– 82. Bibcode :1998Natur.396..279W. doi :10.1038/24409. PMID  9834036. S2CID  4424498.
  • Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р., Гассенхубер Дж., Глассль С., Ансорж В., Бёхер М., Блёкер Х., Бауэрсакс С., Блюм Х., Лаубер Дж., Дюстерхёфт А., Бейер А., Кёрер К., Штрак Н., Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б. , Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. ПМК  311072 . PMID  11230166.
  • Осанаи Т., Накамура М., Сасаки С., Томита Х., Сайто М., Осава Х., Ямабе Х., Мураками С., Магота К., Окумура К. (декабрь 2003 г.). «Концентрация фактора связи 6 в плазме и сердечно-сосудистые события у пациентов с терминальной стадией заболевания почек». Почки Интернешнл . 64 (6): 2291–7 . doi : 10.1046/j.1523-1755.2003.00334.x . ПМИД  14633154.
  • Cross RL (январь 2004). «Молекулярные моторы: вращение мотора АТФ». Nature . 427 (6973): 407– 8. Bibcode :2004Natur.427..407C. doi : 10.1038/427407b . PMID  14749816. S2CID  52819856.
  • Джейкобс Л.Дж., де Ку ИФ, Найланд Дж.Г., Галяард Р.Дж., Лос Ф.Дж., Шондервурд К., Нирмейер М.Ф., Герадтс Дж.П., Шольте Х.Р., Смитс Х.Дж. (март 2005 г.). «Передача и пренатальная диагностика мутации митохондриальной ДНК T9176C». Молекулярная репродукция человека . 11 (3): 223–8 . CiteSeerX  10.1.1.603.8165 . дои : 10.1093/моль/гах152. ПМИД  15709156.
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR008387


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=ATP5PF&oldid=1136127382"