Ген ACADVL содержит 20 экзонов [6] и имеет длину около 5,4 кб. [7] У человека VLCAD имеет интересную структуру гена, которая расположена в структуре голова к голове с геном DLG4 на хромосоме 17 , и что транскрибируемые области этих генов перекрываются. Было показано, что обработка DEHP приводит к повышению регуляции минимальным промотором. [8] Хотя DLG4 и VLCAD имеют общие регуляторные элементы, у каждого из них есть отдельные и различные тканеспецифичные элементы, которые обеспечивают их функцию. У мышей эти два гена находятся в ориентации голова к голове, но они не перекрываются. [7]
Функция
Фермент VLCAD катализирует большую часть бета-окисления жирных кислот путем образования C2-C3 транс - двойной связи в жирной кислоте. VLCAD специфичен для очень длинноцепочечных жирных кислот, обычно C16- ацил-КоА и длиннее. [9] У мышей с дефицитом VLCAD наблюдается незначительное или полное отсутствие гиперацетилирования белков в печени; это означает, что белок VLCAD также необходим для ацетилирования белков в этой биологической системе. [10]
Клиническое значение
ACADVL связан с дефицитом ацил-кофермента А дегидрогеназы с очень длинной цепью (VLCADD), который имеет много симптомов и обычно проявляется как один из трех фенотипов . Первый - тяжелый, с ранним детским началом и высоким уровнем смертности; наиболее распространенным симптомом этой формы является кардиомиопатия . Второй - поздняя детская форма с более легкими симптомами, которые чаще всего проявляются как гипокетотическая гипогликемия. Последняя форма проявляется во взрослом возрасте и проявляется как изолированное поражение скелетных мышц, рабдомиолиз и миоглобинурия , которая вызывается физическими упражнениями или голоданием. [11] Заболевание обычно диагностируется путем первого проведения тандемной масс-спектрометрии образца крови пациента в период стресса, а затем проведения молекулярно- генетического тестирования на наличие гена ACADVL. Дефицит лечится систематически, но определенные состояния, такие как голодание , раздражение миокарда, обезвоживание и диета с высоким содержанием жиров, избегаются в попытке предотвратить вторичные осложнения. [12]
Взаимодействия
Было показано, что ACADVL имеет 75 бинарных белок-белковых взаимодействий, включая 73 ко-комплексных взаимодействия. ACADVL, по-видимому, взаимодействует с RPSA и GPHN . [13]
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000072778 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000018574 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "ацил-КоА-дегидрогеназа, очень длинная цепь".
^ Strauss AW, Powell CK, Hale DE, Anderson MM, Ahuja A, Brackett JC, Sims HF (ноябрь 1995 г.). «Молекулярная основа дефицита митохондриальной ацил-КоА-дегидрогеназы с очень длинной цепью, вызывающего кардиомиопатию и внезапную смерть в детском возрасте». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (23): 10496– 500. Bibcode : 1995PNAS ...9210496S. doi : 10.1073/pnas.92.23.10496 . PMC 40638. PMID 7479827.
^ ab Zhou C, Blumberg B (февраль 2003 г.). "Перекрывающаяся структура генов человеческого VLCAD и DLG4". Gene . 305 (2): 161– 6. doi :10.1016/s0378-1119(02)01235-0. PMID 12609736.
^ Zhang LF, Ding JH, Yang BZ, He GC, Roe C (декабрь 2003 г.). «Характеристика двунаправленной области промотора между генами человека, кодирующими VLCAD и PSD-95». Genomics . 82 (6): 660– 8. doi :10.1016/s0888-7543(03)00211-8. PMID 14611808.
^ Aoyama T, Souri M, Ushikubo S, Kamijo T, Yamaguchi S, Kelley RI, Rhead WJ, Uetake K, Tanaka K, Hashimoto T (июнь 1995 г.). «Очистка человеческой очень длинноцепочечной ацил-коэнзим А дегидрогеназы и характеристика ее дефицита у семи пациентов». Журнал клинических исследований . 95 (6): 2465–73 . doi :10.1172/JCI117947. PMC 295925. PMID 7769092 .
^ Пуговкина О, Те Бринке Х, Офман Р, ван Крухтен А.Г., Кулик В., Вандерс Р.Дж., Хаутен С.М., де Бур В.К. (июль 2014 г.). «Ацетилирование митохондриального белка обусловлено ацетил-КоА в результате окисления жирных кислот». Молекулярная генетика человека . 23 (13): 3513–22 . doi : 10.1093/hmg/ddu059 . ПМИД 24516071.
^ Andresen BS, Olpin S, Poorthuis BJ, Scholte HR, Vianey-Saban C, Wanders R, Ijlst L, Morris A, Pourfarzam M, Bartlett K, Baumgartner ER, deKlerk JB, Schroeder LD, Corydon TJ, Lund H, Winter V, Bross P, Bolund L, Gregersen N (февраль 1999 г.). "Четкая корреляция генотипа с фенотипом заболевания при дефиците ацил-КоА-дегидрогеназы с очень длинной цепью". American Journal of Human Genetics . 64 (2): 479– 94. doi :10.1086/302261. PMC 1377757 . PMID 9973285.
^ Лесли, ND; Валенсия, CA; Штраус, AW; Чжан, K.; Адам, MP; Ардингер, HH; Пагон, RA; Уоллес, SE; Бин LJH; Стивенс, K.; Амемия, A. (1993). «Дефицит ацил-кофермента а-дегидрогеназы с очень длинной цепью». PMID 20301763.{{cite journal}}: Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
^ "Найдено 75 бинарных взаимодействий для поискового термина ACADVL". База данных молекулярных взаимодействий IntAct . EMBL-EBI . Получено 24.08.2018 .
Дальнейшее чтение
Costa CG, Dorland L, de Almeida IT, Jakobs C, Duran M, Poll-The BT (июнь 1998 г.). «Влияние голодания, нагрузки длинноцепочечными триглицеридами и нагрузки карнитином на уровни длинноцепочечного ацилкарнитина в плазме при дефиците митохондриальной очень длинноцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы». Журнал наследственных метаболических заболеваний . 21 (4): 391– 9. doi :10.1023/A:1005354624735. PMID 9700596. S2CID 2198523.
Внешние ссылки
Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW о дефиците ацил-кофермента А-дегидрогеназы с очень длинной цепью
Расположение генома человека ACADVL и страница с подробностями гена ACADVL в браузере геномов UCSC .
