5.8S рибосомальная РНК
| 5.8S рибосомальная РНК | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности рибосомальной РНК 5.8S | |
| Идентификаторы | |
| Символ | 5_8S_рРНК |
| Рфам | РФ00002 |
| Другие данные | |
| Тип РНК | Ген ; рРНК |
| Домены | Эукариоты ; Археи [ требуется ссылка ] |
| ИДТИ | GO:0003735 GO:0005840 |
| ТАК | SO:0000375 |
| Структуры PDB | ПДБе |
В молекулярной биологии рибосомальная РНК 5.8S ( 5.8S рРНК ) является некодирующим компонентом РНК большой субъединицы эукариотической рибосомы и поэтому играет важную роль в трансляции белка . Она транскрибируется РНК- полимеразой I как часть предшественника 45S , который также содержит 18S и 28S рРНК . Считается, что ее функция заключается в транслокации рибосомы. [1] Также известно, что она образует ковалентную связь с белком-супрессором опухолей p53 . [2] 5.8S рРНК можно использовать в качестве референтного гена для обнаружения miRNA . [3] Рибосомальная РНК 5.8S используется для лучшего понимания других процессов и путей рРНК в клетке. [4]
5.8S рРНК гомологична 5'-концу неэукариотической LSU рРНК . У эукариот вставка ITS2 разрывает LSU рРНК на 5.8S и 28S рРНК. [5] У некоторых мух 5.8 рРНК дополнительно расщепляется на две части. [6]
Структура
Структура рРНК L567.5 имеет размер приблизительно 150 нуклеотидов и состоит из большого количества свернутых нитей, некоторые из которых предположительно являются одноцепочечными. [7] Эта рибосомальная РНК вместе с 28S и 5S рРНК, а также 46 рибосомальными белками образует большую субъединицу рибосомы (LSU) . [7] 5.8S рРНК первоначально транскрибируется вместе с 18S и 28S рРНК в прерибосомальной РНК 45S вместе с ITS 1 и ITS 2 ( внутренний транскрибируемый спейсер ) и 5' и 3' ETS ( внешний транскрибируемый спейсер ). [8] 5.8S рРНК расположена между двумя областями ITS, при этом ITS1 отделяет ее от 18S рРНК в направлении 5', а ITS2 отделяет ее от 28S рРНК в направлении 3'. ITS и ETS расщепляются во время созревания рРНК. Это достигается посредством непрерывного пути расщепления, выполняемого как эндонуклеазными , так и экзонуклеазными ферментами, разрезающими спейсеры в определенных местах. [8]
Ссылки
- ^ Abou Elela S, Nazar RN (май 1997). «Роль 5.8S рРНК в транслокации рибосом». Nucleic Acids Research . 25 (9): 1788–1794. doi :10.1093/nar/25.9.1788. PMC 146658. PMID 9108162 .
- ^ Fontoura BM, Atienza CA, Sorokina EA, Morimoto T, Carroll RB (июнь 1997 г.). «Цитоплазматический полипептид p53 связан с рибосомами». Молекулярная и клеточная биология . 17 (6): 3146–3154. doi : 10.1128 /MCB.17.6.3146. PMC 232167. PMID 9154813.
- ^ Ши Р., Чианг В. Л. (октябрь 2005 г.). «Простые средства количественной оценки экспрессии микроРНК с помощью ПЦР в реальном времени». BioTechniques . 39 (4): 519–525. doi : 10.2144/000112010 . PMID 16235564.
- ^ Nazar RN (июнь 1984). «Рибосомальная РНК 5.8S: эукариотическая адаптация или вариант процессинга?». Canadian Journal of Biochemistry and Cell Biology . 62 (6): 311–320. doi :10.1139/o84-044. PMID 6380683.
- ^ Лафонтен, DLJ; Толлерви, Д. (2001). «Функция и синтез рибосом». Nature Reviews Molecular Cell Biology . 2 (7): 514–520. doi : 10.1038/35080045. hdl : 1842/729 . PMID 11433365. S2CID 2637106.
- ^ Шимада, Т. (август 1992 г.). «Распределение расщепленной рибосомальной РНК 5.8S у двукрылых». Молекулярная биология насекомых . 1 (1): 45–48. doi :10.1111/j.1365-2583.1993.tb00076.x. PMID 1343775. S2CID 46570307.
- ^ ab Walker TA, Pace NR (июнь 1983). "5.8S рибосомальная РНК". Cell . 33 (2): 320–322. doi :10.1016/0092-8674(83)90413-0. PMID 6861202.
- ^ ab Henras AK, Plisson-Chastang C, O'Donohue MF, Chakraborty A, Gleizes PE (27 октября 2014 г.). «Обзор обработки прерибосомной РНК у эукариот». Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA . 6 (2): 225–242. doi :10.1002/wrna.1269. PMC 4361047 . PMID 25346433.
Внешние ссылки
- Страница для рибосомальной РНК 5.8S в Rfam
- Последовательность рРНК Arabidopsis 5.8S
- Последовательность 5.8S рРНК риса
 | Эта статья по молекулярной или клеточной биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
