ZZ цинковый палец
| ЗЗ | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ЗЗ | ||||||||
| Пфам | ПФ00569 | ||||||||
| Клан ПФАМ | CL0006 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000433 | ||||||||
| CDD | cd02249 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии домен цинкового пальца типа ZZ представляет собой тип белкового домена , который был назван из-за его способности связывать два иона z inc . [1] Эти домены содержат 4-6 остатков Cys , которые участвуют в связывании цинка (плюс дополнительные остатки Ser/His), включая мотив Cys-X2-Cys, обнаруженный в других доменах цинкового пальца. Считается, что эти цинковые пальцы участвуют в белок-белковых взаимодействиях . Структура домена ZZ показывает, что он принадлежит к семейству мотивов цинковых пальцев с перекрестными скобками, которые включают домены PHD , RING и FYVE . [2] Домены цинковых пальцев типа ZZ встречаются в:
- Факторы транскрипции P300 и CBP.
- Растительные белки, участвующие в реакциях на свет , такие как Hrb1.
- Убиквитинлигазы E3 MEX и MIB2 (EC).
- Дистрофин и его гомологи
Отдельные копии цинкового пальца ZZ встречаются в транскрипционных адаптерных/коактиваторных белках P300, в связывающем белке элемента ответа цАМФ (CREB)-связывающем белке (CBP) и ADA2. CBP обеспечивает несколько сайтов связывания для транскрипционных коактиваторов . Место взаимодействия с белком- супрессором опухолей p53 и онкобелком E1A с CBP/P300 представляет собой богатую Cys область, которая включает два мотива связывания цинка: ZZ-типа и TAZ2-типа. Цинковый палец ZZ-типа CBP содержит два скрученных антипараллельных бета-слоя и короткую альфа-спираль и связывает два иона цинка . [2] Один ион цинка координируется четырьмя остатками цистеина через 2 мотива Cys-X2-Cys, а третий ион цинка через третий мотив Cys-X-Cys и мотив His-X-His. Первый цинковый кластер строго консервативен, тогда как второй цинковый кластер демонстрирует изменчивость в положении двух остатков His.
У Arabidopsis thaliana (кресс-салат) белок гиперчувствительности к красному и синему 1 (Hrb1), регулирующий реакцию как на красный, так и на синий свет, содержит домен цинкового пальца типа ZZ. [3]
Домены цинковых пальцев ZZ-типа также были идентифицированы в специфической для яичек убиквитинлигазе E3 MEX , которая способствует апоптозу, вызванному рецептором смерти . [4] MEX имеет четыре предполагаемых домена цинковых пальцев: один ZZ-типа, один SWIM-типа и два RING-типа. Область, содержащая цинковые пальцы ZZ-типа и RING-типа, необходима для взаимодействия с UbcH5a и самоассоциации MEX, тогда как домен SWIM имеет решающее значение для убиквитинирования MEX .
Кроме того, богатые цистеином домены дистрофина, атрофина и постсинаптического белка 87kDa содержат цинковый палец типа ZZ с высокой идентичностью последовательности с цинковыми пальцами типа P300/CBP ZZ. В дистрофине и атрофине цинковый палец типа ZZ находится между доменом WW (окруженным и EF hand) и доменом C-концевой спиральной спирали . Считается, что дистрофин действует как связующее звено между актиновым цитоскелетом и внеклеточным матриксом, а нарушения комплекса, связанного с дистрофином, например, между дистрофином и трансмембранным гликопротеином бета-дистрогликаном, могут приводить к мышечной дистрофии. Дистрофин и его аутосомный гомолог атрофин взаимодействуют с бета-дистрогликаном через свои C-концевые области, которые состоят из домена WW, домена EF hand и домена цинкового пальца типа ZZ. [5] Домен WW является основным местом взаимодействия между дистрофином или атрофином и дистрогликаном, в то время как домены EF-руки и цинкового пальца типа ZZ стабилизируют и усиливают это взаимодействие.
Ссылки
- ^ Ponting CP, Blake DJ, Davies KE, Kendrick-Jones J, Winder SJ (январь 1996 г.). «ZZ и TAZ: новые предполагаемые цинковые пальцы в дистрофине и других белках». Trends Biochem. Sci . 21 (1): 11– 13. doi :10.1016/s0968-0004(06)80020-4. PMID 8848831.
- ^ ab Legge GB, Martinez-Yamout MA, Hambly DM, Trinh T, Lee BM, Dyson HJ , Wright PE (октябрь 2004 г.). "ZZ-домен CBP: необычная складка цинкового пальца в модуле взаимодействия белков". J. Mol. Biol . 343 (4): 1081– 93. doi :10.1016/j.jmb.2004.08.087. PMID 15476823.
- ^ Kang X, Chong J, Ni M (март 2005 г.). «ГИПЕРЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ К КРАСНОМУ И СИНЕМУ 1, белок цинкового пальца типа ZZ, регулирует опосредованные фитохромом B реакции на красный и опосредованный криптохромом синий свет». Plant Cell . 17 (3): 822– 35. doi :10.1105/tpc.104.029165. PMC 1069701 . PMID 15705950.
- ^ Nishito Y, Hasegawa M, Inohara N, Núñez G (июнь 2006 г.). «MEX — это специфичная для яичек убиквитинлигаза E3, которая способствует апоптозу, вызванному рецептором смерти». Biochem. J . 396 (3): 411– 7. doi :10.1042/BJ20051814. PMC 1482824 . PMID 16522193.
- ↑ Хния К., Зуитен Д., Кантель С., Шазалетт Д., Хьюгон Г., Ференц Дж. А., Масмуди А., Димент А., Брэмх Дж., Морне Д., Уиндер С. Дж. (февраль 2007 г.). «ZZ-домен дистрофина и атрофина: топология и картирование сайта взаимодействия бета-дистрогликанов». Биохим. Дж . 401 (3): 667–77 . doi : 10.1042/BJ20061051. ПМК 1770854 . ПМИД 17009962.
