Венделл Лим

Венделл Лим
Национальностьамериканский
Альма-матерГарвардский университет , Массачусетский технологический институт
Научная карьера
ПоляБиоинженерия
УчрежденияКалифорнийский университет, Сан-Франциско
Научные консультантыФред Ричардс [1]

Венделл Лим — американский биохимик, почетный профессор клеточной и молекулярной фармакологии Байера в Калифорнийском университете в Сан-Франциско . [2] Он является директором Института клеточного дизайна UCSF. [3] Он получил степень бакалавра химии в Гарвардском университете, работая с Джереми Ноулзом над эволюционной оптимизацией ферментов. Он получил степень доктора философии в области биохимии и биофизики в Массачусетском технологическом институте под руководством Боба Зауэра, используя генетические и биофизические подходы для понимания роли гидрофобных взаимодействий ядра в сворачивании белка . [4] Затем он работал над постдокторской работой с Фредериком Ричардсом в Йельском университете над структурой доменов взаимодействия белков . [5] [6] Работа Лима была сосредоточена на клеточной сигнализации , синтетической биологии и клеточной инженерии , особенно в иммунных клетках . [7]

Исследовательская карьера

Модульные сигнальные белки

Исследования Лима были сосредоточены на механизмах клеточной сигнализации – как клетки воспринимают окружающую среду и обрабатывают эту информацию для принятия сложных функциональных решений. [6] Он начал свою карьеру, изучая структуру и функции модульных сигнальных доменов и каркасных белков , но все больше интересовался общим вопросом о том, какую роль модульность играет в эволюции новых сигнальных цепей и сетей. [6]

Синтетическая и системная биология

Лим был пионером в области синтетической и системной биологии , задаваясь вопросом, как перепрограммирование клеточных регуляторных цепей может быть использовано для понимания фундаментальных принципов проектирования биологических систем . Он показал, что сигнальные белки и пути могут быть функционально перепрограммированы в живых клетках с использованием измененных доменов взаимодействия белков, каркасных белков и модульных аллостерических взаимодействий . [8] [9] [10] [11] Он помог пионеру использовать модули оптогенетических ответов как способ осуществления контроля над внутриклеточной сигнализацией и его использования в профилировании того, как клетки реагируют на временные паттерны стимуляции. [12] [13] [14] Он также работал над выявлением общих модулей регуляторных сетей, которые выполняют фундаментальные клеточные функции, такие как усиление , адаптация , пространственная самоорганизация , поляризованное движение клеток и временное восприятие. [15] [16] [17] [18] Он применял эти подходы для проектирования и понимания функции иммунных клеток, а также многоклеточной самоорганизации (синтетическое развитие). [18] [19]

Инженерные терапевтические иммунные клетки

Лим был лидером в применении подходов синтетической биологии к инженерии иммунных клеток и разработке клеточной терапии , выступая за подходы к предиктивной инженерии клеток с точными терапевтическими функциями для лечения рака и других сложных заболеваний . [20] [21] Его группа была первой, кто разработал низкомолекулярные управляемые химерные антигенные рецепторы (CAR) [22] , а также высокогибкую синтетическую платформу рецепторов Notch (synNotch) для программирования новых схем транскрипционного контроля . [23] [24] [25] Его группа показала, как эти компоненты можно использовать для проектирования схем Т-клеток , которые достигают точного комбинаторного обнаружения антигена и уничтожения рака (схемы synNotch to CAR). [24] [26] [27] Его группа также сконструировала Т-клетки для распознавания определенных целевых тканей и доставки генетически закодированных терапевтических полезных нагрузок в эти места. [25] Кроме того, группа Лима использовала эти синтетические рецепторы для проектирования схем положительной обратной связи для определения плотности антигена с нелинейными пороговыми значениями. [28]

Лим был частью команды, которая изобрела систему CRISPRi, которая использовала модульное ДНК-нацеливание неактивного Cas9 для управления транскрипцией определенных эндогенных генов. [29] Он также занимался разработкой многоклеточных сетей, которые управляют специфическим формированием сложных самоорганизующихся тканеподобных структур. [18] Лим и его коллеги выступали за применение подходов клеточной инженерии ко многим другим сложным заболеваниям, помимо рака, а также за использование сконструированных клеток в качестве исследовательских инструментов для зондирования и нарушения регуляторных сетей клеток и тканей. [28]

Биотехнологическая промышленность

Работа Лима в области инженерии иммунных клеток привела к основанию в 2015 году компании Cell Design Labs, занимающейся разработкой технологий клеточной терапии, которую в 2017 году приобрела компания Gilead Sciences. [30]

Научное образование и пропаганда

Лим является соавтором учебника «Сигнализация клеток» вместе с коллегами Брюсом Майером и Тони Поусоном. [31] Его группа также участвовала в программе по распространению синтетической биологии iGEM с учениками и учителями старших классов в районе залива Сан-Франциско . [32] [33] Он также проводил творческие проекты по дизайн-мышлению , [34] а также по науке и кулинарии . [35]

Личная жизнь

Лим — американец китайского происхождения , выросший в Чикаго , где он окончил лабораторные школы Чикагского университета . [36] В настоящее время он живет в Сан-Франциско со своей женой и детьми. Лим — заядлый баскетболист, серфер и художник. [6]

Награды и заслуги

Ссылки

  1. ^ «Фред Ричардс на академическом дереве».
  2. ^ «Профили UCSF».
  3. ^ "UCSF Cell Design Institute". UCSF Cell Design Institute . Получено 28.07.2022 .
  4. ^ "Wendell Lim" . Получено 1 ноября 2012 г.
  5. ^ "Wendell A. Lim, Ph.D." HHMI . Получено 1 ноября 2012 г. .
  6. ^ abcd Sedwick, C. (17 сентября 2012 г.). «Венделл Лим: исследование невыбранного пути». Журнал клеточной биологии . 198 (6): 956–957. doi :10.1083/jcb.1986pi. PMC 3444780. PMID  22986491 . 
  7. ^ "Исследования | Lim Lab". limlab.ucsf.edu . Получено 29.07.2022 .
  8. ^ Park, Sang-Hyun; Zarrinpar, Ali; Lim, Wendell A. (2003-02-14). «Перестройка путей MAP-киназы с использованием альтернативных механизмов сборки каркаса». Science . 299 (5609): 1061–1064. Bibcode :2003Sci...299.1061P. doi : 10.1126/science.1076979 . ISSN  1095-9203. PMID  12511654. S2CID  1643040.
  9. ^ Дьюбер, Джон Э.; Мирски, Итан А.; Лим, Венделл А. (июнь 2007 г.). «Разработка синтетических сигнальных белков с ультрачувствительным контролем ввода/вывода». Nature Biotechnology . 25 (6): 660–662. doi :10.1038/nbt1308. ISSN  1087-0156. PMID  17515908. S2CID  10465894.
  10. ^ Йе, Брайан Дж.; Рутильяно, Роберт Дж.; Деб, Анрика; Бар-Саги, Дафна; Лим, Венделл А. (2007-05-31). «Перестройка путей клеточной морфологии с помощью синтетических факторов обмена гуаниновых нуклеотидов». Nature . 447 (7144): 596–600. Bibcode :2007Natur.447..596Y. doi :10.1038/nature05851. ISSN  1476-4687. PMID  17515921. S2CID  4393136.
  11. ^ Башор, Кейлеб Дж.; Хелман, Ноа К.; Ян, Шуд; Лим, Венделл А. (14.03.2008). «Использование сконструированных взаимодействий каркасов для изменения динамики сигнализации пути МАР-киназы». Science . 319 (5869): 1539–1543. Bibcode :2008Sci...319.1539B. doi :10.1126/science.1151153. ISSN  1095-9203. PMID  18339942. S2CID  365578.
  12. ^ Левская, Ансельм; Вайнер, Орион Д.; Лим, Венделл А.; Фойгт, Кристофер А. (2009-10-15). «Пространственно-временной контроль клеточной сигнализации с использованием взаимодействия белков, переключаемых светом». Nature . 461 (7266): 997–1001. Bibcode :2009Natur.461..997L. doi :10.1038/nature08446. ISSN  1476-4687. PMC 2989900 . PMID  19749742. 
  13. ^ Toettcher, Jared E.; Weiner, Orion D.; Lim, Wendell A. (2013-12-05). «Использование оптогенетики для исследования динамического управления передачей сигнала модулем Ras/Erk». Cell . 155 (6): 1422–1434. doi :10.1016/j.cell.2013.11.004. ISSN  1097-4172. PMC 3925772 . PMID  24315106. 
  14. ^ Бугай, Лукаш Дж.; О'Донохью, Джефф П.; Лим, Венделл А. (2017-01-02). «Исследование клеточного восприятия и принятия решений с помощью оптогенетических инструментов». Журнал клеточной биологии . 216 (1): 25–28. doi :10.1083/jcb.201612094. ISSN  1540-8140. PMC 5223619. PMID 28003330  . 
  15. ^ Ма, Вэньчжэ; Трусина, Ала; Эль-Самад, Хана; Лим, Венделл А.; Тан, Чао (21 августа 2009 г.). «Определение топологий сетей, которые могут обеспечить биохимическую адаптацию». Cell . 138 (4): 760–773. doi :10.1016/j.cell.2009.06.013. ISSN  1097-4172. PMC 3068210 . PMID  19703401. 
  16. ^ Джерардин, Джалин; Редди, Нишит Р.; Лим, Венделл А. (2019-09-25). «Принципы проектирования биохимических таймеров: схемы, различающие кратковременную и длительную стимуляцию». Cell Systems . 9 (3): 297–308.e2. doi :10.1016/j.cels.2019.07.008. ISSN  2405-4720. PMC 6763348 . PMID  31521602. 
  17. ^ Чау, Анджела Х.; Уолтер, Джессика М.; Джерардин, Джалин; Тан, Чао; Лим, Венделл А. (2012-10-12). «Проектирование синтетических регуляторных сетей, способных к самоорганизации клеточной поляризации». Cell . 151 (2): 320–332. doi :10.1016/j.cell.2012.08.040. ISSN  1097-4172. PMC 3498761 . PMID  23039994. 
  18. ^ abc Тода, Сатоши; Блаух, Лукас Р.; Тан, Синди К.Й.; Морсут, Леонардо; Лим, Венделл А. (2018-07-13). «Программирование самоорганизующихся многоклеточных структур с помощью синтетической межклеточной сигнализации». Science . 361 (6398): 156–162. Bibcode :2018Sci...361..156T. doi :10.1126/science.aat0271. ISSN  1095-9203. PMC 6492944 . PMID  29853554. 
  19. ^ Тода, Сатоши; МакКейтан, Уэсли Л.; Хаккинен, Теему Дж.; Лопес, Пилар; Кляйн, Офир Д.; Лим, Венделл А. (2020-10-16). «Инженерные синтетические морфогенные системы, которые могут программировать многоклеточное паттернирование». Science . 370 (6514): 327–331. Bibcode :2020Sci...370..327T. doi :10.1126/science.abc0033. ISSN  1095-9203. PMC 7986291 . PMID  33060357. 
  20. ^ Лим, Венделл А. (июнь 2010 г.). «Проектирование индивидуальных цепей сигнализации клеток». Nature Reviews. Молекулярная клеточная биология . 11 (6): 393–403. doi :10.1038/nrm2904. ISSN  1471-0080. PMC 2975372. PMID 20485291  . 
  21. ^ Фишбах, Майкл А.; Блюстоун, Джеффри А.; Лим, Венделл А. (2013-04-03). «Клеточная терапия: следующий столп медицины». Science Translational Medicine . 5 (179): 179ps7. doi :10.1126/scitranslmed.3005568. ISSN  1946-6234. PMC 3772767. PMID 23552369  . 
  22. ^ Wu, Chia-Yung; Roybal, Kole T.; Puchner, Elias M.; Onuffer, James; Lim, Wendell A. (2015-10-16). «Удаленное управление терапевтическими Т-клетками с помощью химерного рецептора, управляемого малыми молекулами». Science . 350 (6258): aab4077. Bibcode :2015Sci...350.4077W. doi :10.1126/science.aab4077. ISSN  1095-9203. PMC 4721629 . PMID  26405231. 
  23. ^ Морсут, Леонардо; Ройбал, Коле Т.; Сюн, Синь; Гордли, Рассел М.; Койл, Скотт М.; Томсон, Мэтью; Лим, Венделл А. (2016-02-11). «Разработка индивидуальных клеточных сенсорных и ответных поведений с использованием синтетических рецепторов Notch». Cell . 164 (4): 780–791. doi :10.1016/j.cell.2016.01.012. ISSN  1097-4172. PMC 4752866 . PMID  26830878. 
  24. ^ ab Roybal, Kole T.; Rupp, Levi J.; Morsut, Leonardo; Walker, Whitney J.; McNally, Krista A.; Park, Jason S.; Lim, Wendell A. (2016-02-11). «Точное распознавание опухолей Т-клетками с помощью комбинаторных антиген-чувствительных цепей». Cell . 164 (4): 770–779. doi :10.1016/j.cell.2016.01.011. ISSN  1097-4172. PMC 4752902 . PMID  26830879. 
  25. ^ ab Roybal, Kole T.; Williams, Jasper Z.; Morsut, Leonardo; Rupp, Levi J.; Kolinko, Isabel; Choe, Joseph H.; Walker, Whitney J.; McNally, Krista A.; Lim, Wendell A. (2016-10-06). «Инженерия Т-клеток с индивидуальными программами терапевтического ответа с использованием синтетических рецепторов Notch». Cell . 167 (2): 419–432.e16. doi :10.1016/j.cell.2016.09.011. ISSN  1097-4172. PMC 5072533 . PMID  27693353. 
  26. ^ Уильямс, Джаспер З.; Аллен, Грег М.; Шах, Деван; Стерин, Игал С.; Ким, Ки Х.; Гарсия, Вивиан П.; Шавей, Гэвин Э.; Ю, Вэй; Пуиг-Саус, Кристина; Цой, Дженнифер; Рибас, Антони (27.11.2020). «Точные программы распознавания Т-клеток, разработанные путем транскрипционного связывания нескольких рецепторов». Science . 370 (6520): 1099–1104. Bibcode :2020Sci...370.1099W. doi :10.1126/science.abc6270. ISSN  1095-9203. PMC 8054651 . PMID  33243890. 
  27. ^ Choe, Joseph H.; Watchmaker, Payal B.; Simic, Milos S.; Gilbert, Ryan D.; Li, Aileen W.; Krasnow, Nira A.; Downey, Kira M.; Yu, Wei; Carrera, Diego A.; Celli, Anna; Cho, Juhyun (2021-04-28). «Т-клетки SynNotch-CAR преодолевают проблемы специфичности, гетерогенности и настойчивости при лечении глиобластомы». Science Translational Medicine . 13 (591): eabe7378. doi :10.1126/scitranslmed.abe7378. ISSN  1946-6242. PMC 8362330. PMID  33910979 . 
  28. ^ ab Elowitz, Michael; Lim, Wendell A. (декабрь 2010 г.). «Строим жизнь, чтобы понять ее». Nature . 468 (7326): 889–890. Bibcode :2010Natur.468..889E. doi :10.1038/468889a. ISSN  1476-4687. PMC 3068207 . PMID  21164460. 
  29. ^ Qi, Lei S.; Larson, Matthew H.; Gilbert, Luke A.; Doudna, Jennifer A.; Weissman, Jonathan S.; Arkin, Adam P.; Lim, Wendell A. (2021-02-04). «Повторное использование CRISPR в качестве платформы с РНК-управлением для последовательно-специфического контроля экспрессии генов». Cell . 184 (3): 844. doi : 10.1016/j.cell.2021.01.019 . ISSN  1097-4172. PMID  33545038. S2CID  231809613.
  30. ^ "Startup Science | UCSF Magazine". magazine.ucsf.edu . Получено 29.07.2022 .
  31. ^ Торнер, Джереми (2017-03-01). «Сигнализация клеток: принципы и механизмы» Венделла Лима, Брюса Майера и Тони Поусона. The Quarterly Review of Biology . 92 (1): 105–106. doi :10.1086/690882. ISSN  0033-5770.
  32. ^ Танси, Бернадетт (17.11.2007). «Биоведы старших классов открывают новые горизонты в победном соревновании». SFGATE . Получено 29.07.2022 .
  33. ^ Закари, Г. Паскаль (18.11.2007). «Английский язык, алгебра, физическая подготовка ... и биотехнологии». The New York Times . ISSN  0362-4331 . Получено 29.07.2022 .
  34. ^ Бернстайн, Рэйчел (28.10.2011). «Брось пипетку: наука по замыслу». Cell . 147 (3): 496–497. doi : 10.1016/j.cell.2011.10.010 . ISSN  0092-8674. PMID  22036559. S2CID  13248964.
  35. ^ "UCSF Lecture Takes on the Science of Food | UC San Francisco". www.ucsf.edu . Получено 29.07.2022 .
  36. ^ "Лабораторные школы Чикагского университета: Выпускники » Выходные выпускников » Премия за профессиональные достижения «Восходящая звезда». 2014-11-11. Архивировано из оригинала 2014-11-11 . Получено 2022-07-29 .
  37. ^ "15-я лекция Ландштайнера на CeMM Венделла Лима и церемония вручения премии Дениз П. Барлоу 2021 года". CeMM - Наука - наша медицина! . Получено 29.07.2022 .
  38. ^ "Венделл Лим, выбранный для 34-й лекции памяти Джорджа Штрейзингера | Центр клеточного строительства". ccc.ucsf.edu . Получено 29 июля 2022 г.
  39. ^ «Лекция и медаль Федора Линена - Домашняя страница Gesellschaft für Biochemie und Molekularbiologie eV» gbm-online.de . Проверено 29 июля 2022 г.
  40. ^ "Программа премии директора NIH за преобразующие исследования - финансируемые исследования". commonfund.nih.gov . 2013-06-27 . Получено 2022-07-29 .
  41. ^ "The Smart List 2012: 50 человек, которые изменят мир". Wired UK . ISSN  1357-0978 . Получено 29 июля 2022 г.
  42. ^ "Венделл А. Лим". HHMI . Получено 29-07-2022 .
  43. ^ "The Protein Society: Премии Protein Society". www.proteinsociety.org . Получено 29.07.2022 .
  44. ^ "Science Talent Search 1982". Общество науки . Получено 29 июля 2022 г.
  45. ^ "Венделл Лим, доктор философии." www.science.org . Получено 29 июля 2022 г.
  46. ^ "Редакционная коллегия: Cell". www.cell.com . Получено 2022-07-29 .
  47. ^ "BWF Board". Burroughs Wellcome Fund . Получено 29.07.2022 .
  • Его академическая биография
  • Его биография в Медицинском институте Говарда Хьюза
  • Сайт лаборатории Лим
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Венделл_Лим&oldid=1243851912"