WASHC2C

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
WASHC2C
Идентификаторы
ПсевдонимыWASHC2C , FAM21A, VPEF, FAM21C, семейство с последовательностью, схожей с 21 членом C, субъединица комплекса WASH 2C
Внешние идентификаторыОМИМ : 613631; МГИ : 106463; гомологен : 41686; GeneCards : WASHC2C; OMA :WASHC2C — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_001169106
NM_001169107
NM_015262
NM_001330074

NM_026585

RefSeq (белок)

NP_080861

Местоположение (UCSC)Хр 10: 45.73 – 45.79 МбХр 6: 116.18 – 116.24 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Субъединица 2C комплекса WASH — это белок , который у людей кодируется геном WASHC2C . [5] WASHC2C, также известный как WASHCAP, VPEF, FAM21A или FAM21C, экспрессируется повсеместно. [6] WASHC2C является внутриклеточным и находится в основном в цитозоле, связанном с везикулами. [6]  Белок имеет низкую специфичность к иммунным клеткам, региону человеческого мозга и тканям. [7] Некоторые заболевания, с которыми связан этот белок, — это коровья оспа и транзиторное тикозное расстройство. [8]

Функция WASHC2C

WASHC2C является частью комплекса ядра WASH, где он функционирует как фактор, способствующий зародышеобразованию (NPF) на поверхности эндосом. Здесь он рекрутирует и активирует комплекс Arp 2/3, чтобы вызвать полимеризацию актина. Полимеризация актина играет ключевую роль в делении трубочек, которые служат транспортными промежуточными продуктами во время сортировки эндосом. [7] WASHC2C также опосредует рекрутирование димера белка F-актин-кэппинга в комплекс, а также рекрутирование комплекса ядра в мембраны эндосом посредством связывания с фосфолипидами. Самая сильная фосфолипидная связь, которую делает белок, это с фосфатидилинозитол-4-фосфатом, фосфатидилинозитол-3,5-бифосфатом и фосфатидилинозитол-5-фосфатом. [7] GLUT1 5 — это белок, который рециркулируется в процессе перемещения эндосом в плазматическую мембрану, в котором WASHC2C играет важную роль. [7] Этот белок также необходим для эндосомального рекрутирования CCC, многосубъединичного белкового комплекса, и других субъединиц, таких как COMMD1, VPS35L и CCDC93. [9] WASHC2C участвует в нескольких других процессах, отрицательной регуляции кэппинга актиновых филаментов с заостренными концами, эндосомальном транспорте эндоцитоза на основе жидкости и регуляции распространения клеток, зависящего от адгезии субстрата. [9]

Структура

Размер гена WASHC2C составляет около 1320 аминокислот с молекулярной массой 144911 дальтон (Да) или 144,911 килодальтон (кДа). Белок имеет четвертичную структуру [10] и базальную изоэлектрическую точку 4,66. [11]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000172661 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000024104 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Ген Entrez: семейство FAM21C с последовательностью сходства 21, член C».
  6. ^ ab "WASHC2C WASH complex subunit 2C [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 2022-05-09 .
  7. ^ abcd "Обзор экспрессии белка WASHC2C - Атлас белков человека". www.proteinatlas.org . Получено 09.05.2022 .
  8. ^ "Ген WASHC2C - GeneCards | Белок WAC2C | Антитело WAC2C". www.genecards.org . Получено 09.05.2022 .
  9. ^ ab Филлипс-Кравчак, Кристин А.; Сингла, Амика; Старокадомский, Петро; Дэн, Чжихуэй; Осборн, Дуглас Г.; Ли, Хайин; Дик, Кристофер Дж.; Гомес, Тимоти С.; Коенекке, Меган; Чжан, Цзинь-Сан; Дай, Хаймин (2015-01-01). "COMMD1 связан с комплексом WASH и регулирует эндосомальный трафик транспортера меди ATP7A". Молекулярная биология клетки . 26 (1): 91– 103. doi :10.1091/mbc.E14-06-1073. ISSN  1939-4586. PMC 4279232. PMID 25355947  . 
  10. ^ "Ген WASHC2C - GeneCards | Белок WAC2C | Антитело WAC2C". www.genecards.org . Получено 09.05.2022 .
  11. ^ "WASHC2C (человек)". www.phosphosite.org . Получено 2022-05-09 .

Дальнейшее чтение

  • Нагасе Т., Ишикава К., Миядзима Н. и др. (1998). «Предсказание кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». DNA Res . 5 (1): 31– 9. doi : 10.1093/dnares/5.1.31 . PMID  9628581.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB и др. (2004). «Надежное фосфопротеомное профилирование участков фосфорилирования тирозина из человеческих Т-клеток с использованием иммобилизованной металл-аффинной хроматографии и тандемной масс-спектрометрии». Anal. Chem . 76 (10): 2763– 72. doi :10.1021/ac035352d. PMID  15144186.
  • Deloukas P, Earthrowl ME, Grafham DV и др. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ человеческой хромосомы 10». Nature . 429 (6990): 375– 81. Bibcode :2004Natur.429..375D. doi : 10.1038/nature02462 . PMID  15164054.
  • Босолей СА, Едриховски М, Шварц Д и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Lim J, Hao T, Shaw C и др. (2006). «Сеть взаимодействия белок-белок при наследственных атаксиях и расстройствах дегенерации клеток Пуркинье у человека». Cell . 125 (4): 801– 14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID  16713569. S2CID  13709685.
  • Босолей СА, Виллен ДЖ, Гербер СА и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации участков». Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285– 92. doi :10.1038/nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=WASHC2C&oldid=1241523225"