VirCapSeq

VirCapSeq — это система для широкого скрининга всех вирусных инфекций у позвоночных, включая людей. ^[1] Она была разработана У. Яном Липкиным , Томасом Бризе и Амитом Капуром в Колумбийском университете . ^[2]

Исследователи создали библиотеку из 2 миллионов 50-100-мерных олигонуклеотидов на основе последовательностей вирусного генома, описанных в базе данных Европейской молекулярной биологической лаборатории , которая представляла собой кодирующие последовательности всех известных вирусов позвоночных. ^[3] Затем они разработали анализ, в котором добавление этих зондов к образцам позволило восстановить полные вирусные геномные последовательности. Этот анализ называется «VirCapSeq». ^[3]

Ссылки

^ Briese, Thomas; Kapoor, Amit; Mishra, Nischay; Jain, Komal; Kumar, Arvind; Jabado, Omar J.; Lipkin, W. Ian (22 сентября 2015 г.). "Virome Capture Sequencing Enables Sensitive Viral Diagnosis and Comprehensive Virome Analysis". mBio . 6 (5): e01491-15. doi :10.1128/mBio.01491-15. PMC 4611031 . PMID 26396248.
^ Йонг, Эд (22 сентября 2015 г.). «Новая технология позволяет дешево и эффективно обнаружить все известные вирусы человека в образце крови». theatlantic.com . Получено 6 октября 2015 г.
^ ab Heger, Monica (25 сентября 2015 г.). «Колумбийская команда разрабатывает метод NGS для скрининга вирусов из клинических образцов». genomeweb.com . Получено 7 октября 2015 г.

Внешние ссылки

Прорыв в диагностике приносит вирусное секвенирование в арсенал врачей, пресс-релиз Колумбийского университета

[1] Briese, Thomas; Kapoor, Amit; Mishra, Nischay; Jain, Komal; Kumar, Arvind; Jabado, Omar J.; Lipkin, W. Ian (22 сентября 2015 г.). "Virome Capture Sequencing Enables Sensitive Viral Diagnosis and Comprehensive Virome Analysis". mBio . 6 (5): e01491-15. doi :10.1128/mBio.01491-15. PMC 4611031 . PMID 26396248.

[2] Йонг, Эд (22 сентября 2015 г.). «Новая технология позволяет дешево и эффективно обнаружить все известные вирусы человека в образце крови». theatlantic.com . Получено 6 октября 2015 г.

[Heger-3] Heger, Monica (25 сентября 2015 г.). «Колумбийская команда разрабатывает метод NGS для скрининга вирусов из клинических образцов». genomeweb.com . Получено 7 октября 2015 г.