Открытая рамка считывания вверх по течению

Открытая рамка считывания ( uORF ) — это открытая рамка считывания (ORF) в пределах 5'-нетранслируемой области (5'UTR) мРНК . uORF могут регулировать экспрессию эукариотических генов . ^[1]^[2] Трансляция uORF обычно подавляет нисходящую экспрессию первичной ORF. Однако в некоторых генах, таких как дрожжевой GCN4, трансляция определенных uORF может усиливать трансляцию основной ORF. ^[3]

У людей

Приблизительно 50% человеческих генов содержат uORF в 5'UTR, и когда они присутствуют, они вызывают снижение экспрессии белка. ^[4] Человеческие пептиды, полученные из транслированных uORF, можно обнаружить в клеточном материале с помощью масс-спектрометра . ^[5] uORF были обнаружены в двух третях протоонкогенов и связанных с ними белков. ^[6]

У бактерий

У бактерий uORF называются лидерными пептидами и были первоначально открыты на основе их влияния на регуляцию генов, участвующих в синтезе или транспорте аминокислот .

Смотрите также

Ссылки

^ Vilela C, McCarthy JE (август 2003 г.). «Регулирование экспрессии генов грибков с помощью коротких открытых рамок считывания в 5'-нетранслируемой области мРНК». Молекулярная микробиология . 49 (4): 859–67 . doi : 10.1046/j.1365-2958.2003.03622.x . PMID 12890013.
^ Lovett PS, Rogers EJ (июнь 1996 г.). «Регуляция рибосомы зарождающимся пептидом». Microbiological Reviews . 60 (2): 366– 85. doi : 10.1128/MMBR.60.2.366-385.1996 . PMC 239448 . PMID 8801438.
^ Хиннебуш, Алан Г. (1997-08-29). «Трансляционная регуляция дрожжевого GCN4: окно в факторы, которые контролируют связывание инициаторной тРНК с рибосомой *». Журнал биологической химии . 272 (35): 21661– 21664. doi : 10.1074/jbc.272.35.21661 . ISSN 0021-9258. PMID 9268289.
^ Calvo SE, Pagliarini DJ, Mootha VK (май 2009 г.). «Открытые рамки считывания Upstream вызывают широко распространенное снижение экспрессии белка и являются полиморфными среди людей» (PDF) . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (18): 7507– 12. Bibcode : 2009PNAS..106.7507C . doi : 10.1073/pnas.0810916106 . PMC 2669787. PMID 19372376. Архивировано из оригинала 3 декабря 2023 г. – через библиотеки MIT.
^ Slavoff SA, Mitchell AJ, Schwaid AG, Cabili MN, Ma J, Levin JZ, Karger AD, Budnik BA, Rinn JL, Saghatelian A (январь 2013 г.). «Пептидомическое открытие коротких пептидов, кодируемых открытой рамкой считывания, в клетках человека». Nature Chemical Biology . 9 (1): 59– 64. doi :10.1038/nchembio.1120. PMC 3625679 . PMID 23160002.
^ Geballe, AP; Morris, DR (апрель 1994). «Инициирующие кодоны в 5'-лидерах мРНК как регуляторы трансляции». Trends in Biochemical Sciences . 19 (4): 159– 164. doi :10.1016/0968-0004(94)90277-1. ISSN 0968-0004. PMID 8016865.

Эта статья по генетике — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[1] Vilela C, McCarthy JE (август 2003 г.). «Регулирование экспрессии генов грибков с помощью коротких открытых рамок считывания в 5'-нетранслируемой области мРНК». Молекулярная микробиология . 49 (4): 859–67 . doi : 10.1046/j.1365-2958.2003.03622.x . PMID 12890013.

[2] Lovett PS, Rogers EJ (июнь 1996 г.). «Регуляция рибосомы зарождающимся пептидом». Microbiological Reviews . 60 (2): 366– 85. doi : 10.1128/MMBR.60.2.366-385.1996 . PMC 239448 . PMID 8801438.

[3] Хиннебуш, Алан Г. (1997-08-29). «Трансляционная регуляция дрожжевого GCN4: окно в факторы, которые контролируют связывание инициаторной тРНК с рибосомой *». Журнал биологической химии . 272 (35): 21661– 21664. doi : 10.1074/jbc.272.35.21661 . ISSN 0021-9258. PMID 9268289.

[Calvo_Pagliarini_Mootha_pp._7507–7512-4] Calvo SE, Pagliarini DJ, Mootha VK (май 2009 г.). «Открытые рамки считывания Upstream вызывают широко распространенное снижение экспрессии белка и являются полиморфными среди людей» (PDF) . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (18): 7507– 12. Bibcode : 2009PNAS..106.7507C . doi : 10.1073/pnas.0810916106 . PMC 2669787. PMID 19372376. Архивировано из оригинала 3 декабря 2023 г. – через библиотеки MIT.

[5] Slavoff SA, Mitchell AJ, Schwaid AG, Cabili MN, Ma J, Levin JZ, Karger AD, Budnik BA, Rinn JL, Saghatelian A (январь 2013 г.). «Пептидомическое открытие коротких пептидов, кодируемых открытой рамкой считывания, в клетках человека». Nature Chemical Biology . 9 (1): 59– 64. doi :10.1038/nchembio.1120. PMC 3625679 . PMID 23160002.

[6] Geballe, AP; Morris, DR (апрель 1994). «Инициирующие кодоны в 5'-лидерах мРНК как регуляторы трансляции». Trends in Biochemical Sciences . 19 (4): 159– 164. doi :10.1016/0968-0004(94)90277-1. ISSN 0968-0004. PMID 8016865.