Домен белка UbiD
| UbiD | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура 3-октапренил-4-гидроксибензоатдекарбоксилазы (ubid) из Escherichia coli, северо-восточная структурная геномная цель er459. | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | UbiD | ||||||||
| Пфам | ПФ01977 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR002830 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии этот домен белка относится к UbiD, который обнаружен у прокариот , архей и грибов , с двумя членами в Archaeoglobus fulgidus . Они связаны с UbiD, 3-октапренил-4-гидроксибензоаткарбокси-лиазой из Escherichia coli , которая участвует в биосинтезе убихинона . [1] Член из Helicobacter pylori имеет C-концевое расширение чуть более 100 остатков , которое частично разделяет гомолог Aquifex aeolicus .
Функция
Убихинон является важным переносчиком электронов у прокариот . В Escherichia coli путь биосинтеза убихинона включает по меньшей мере девять реакций, в которых 3-октапренил-4-гидроксибензоатдекарбоксилаза (UbiD) является ферментом на пути, который катализирует превращение субстрата 3-октапренил-4-гидроксибензоата в продукт, 2-октапренилфенол. [2] Мутанты E. coli ubiD- имеют дефекты в биосинтезе Q8, накапливают 4-гидрокси-3-октапренилбензойную кислоту (HP8B) и не обладают декарбоксилазной активностью in vitro . Однако мутанты E. coli ubiD- сохранили способность продуцировать около 20–25% от нормального уровня Q 4-гидрокси-3-октапренилбензойной кислоты. [3] По сути, домен белка UbiD жизненно важен для создания убихинона, важного переносчика электронов при создании энергии.
Ссылки
- ^ Zhang H, Javor GT (ноябрь 2000 г.). «Идентификация гена ubiD на хромосоме Escherichia coli». J. Bacteriol . 182 (21): 6243– 6. doi :10.1128/jb.182.21.6243-6246.2000. PMC 94763. PMID 11029449 .
- ^ Liu J, Liu JH (2006). «Биосинтез убихинона (коэнзима Q) в Chlamydophila pneumoniae AR39: идентификация гена ubiD». Acta Biochim Biophys Sin (Шанхай) . 38 (10): 725– 30. doi : 10.1111/j.1745-7270.2006.00214.x . PMID 17033719.
- ^ Gulmezian M, Hyman KR, Marbois BN, Clarke CF, Javor GT (2007). «Роль UbiX в биосинтезе кофермента Q Escherichia coli». Arch Biochem Biophys . 467 (2): 144–53 . doi :10.1016/j.abb.2007.08.009. PMC 2475804. PMID 17889824 .
