USP5
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
USP5
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыUSP5 , ISOT, убиквитин-специфическая пептидаза 5
Внешние идентификаторыОМИМ : 601447; МГИ : 1347343; гомологен : 55758; GeneCards : USP5; OMA :USP5 – ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

8078

22225

Ансамбль

ENSG00000111667

ENSMUSG00000038429

UniProt

Р45974

Р56399

РефСек (мРНК)

NM_001098536
NM_003481

NM_013700
NM_001326594

RefSeq (белок)

NP_001313523
NP_038728

Местоположение (UCSC)Хр 12: 6.85 – 6.87 МбХр 6: 124,79 – 124,81 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Убиквитин-специфическая пептидаза 5 — это фермент , который у людей кодируется геном USP5 . [ 5] [6] [7]

Взаимодействия

Было показано, что USP5 взаимодействует с TADA3L . [8]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000111667 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000038429 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Puente XS, Sánchez LM, Overall CM, López-Otín C (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Nature Reviews Genetics . 4 (7): 544–58 . doi :10.1038/nrg1111. PMID  12838346. S2CID  2856065.
  6. ^ Ansari-Lari MA, Muzny DM, Lu J, Lu F, Lilley CE, Spanos S, Malley T, Gibbs RA (апрель 1996 г.). «Богатый генами кластер между генами CD4 и триозофосфатизомеразы на хромосоме человека 12p13». Genome Research . 6 (4): 314–26 . doi : 10.1101/gr.6.4.314 . PMID  8723724.
  7. ^ "Ген Энтреза: специфическая пептидаза 5 убиквитина USP5 (изопептидаза T)".
  8. ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н, Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедесу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

Дальнейшее чтение

  • D'Andrea A, Pellman D (1999). «Деубиквитинирующие ферменты: новый класс биологических регуляторов». Критические обзоры по биохимии и молекулярной биологии . 33 (5): 337–52 . doi :10.1080/10409239891204251. PMID  9827704.
  • Фальке Л., Паке Н., Фрутигер С., Хьюз Г.Дж., Хоанг-Ван К., Джейтон Дж.К. (декабрь 1995 г.). «Клонирование кДНК человеческого деубиквитинирующего фермента массой 100 кДа: деубиквитиназа человека массой 100 кДа принадлежит к семейству 2 убиквитин-концевых гидролаз (UCH2)». Письма ФЭБС . 376 (3): 233–7 . doi :10.1016/0014-5793(95)01287-7. PMID  7498549. S2CID  19521632.
  • Wilkinson KD, Tashayev VL, O'Connor LB, Larsen CN, Kasperek E, Pickart CM (ноябрь 1995). "Метаболизм сигнала деградации полиубиквитина: структура, механизм и роль изопептидазы T". Биохимия . 34 (44): 14535– 46. doi :10.1021/bi00044a032. PMID  7578059.
  • Falquet L, Paquet N, Frutiger S, Hughes GJ, Hoang-Van K, Jaton JC (февраль 1995 г.). "Человеческий деубиквитинирующий фермент с активностью как изопептидазы, так и пептидазы in vitro". FEBS Letters . 359 (1): 73– 7. doi : 10.1016/0014-5793(94)01451-6 . PMID  7851534. S2CID  39667023.
  • Ansari-Lari MA, Shen Y, Muzny DM, Lee W, Gibbs RA (март 1997). "Крупномасштабное секвенирование в человеческой хромосоме 12p13: экспериментальное и вычислительное определение структуры гена". Genome Research . 7 (3): 268– 80. doi : 10.1101/gr.7.3.268 . PMID  9074930.
  • Сузуки Ю, Цунода Т, Сесе Дж, Тайра Х, Мидзушима-Сугано Дж, Хата Х, Ота Т, Исогай Т, Танака Т, Накамура Ю, Суяма А, Сакаки Ю, Моришита С, Окубо К, Сугано С (май 2001 г.). «Идентификация и характеристика потенциальных промоторных областей 1031 вида человеческих генов». Геномные исследования . 11 (5): 677– 84. doi :10.1101/gr.gr-1640р. ПМК  311086 . ПМИД  11337467.
  • Engidawork E, Juranville JF, Fountoulakis M, Dierssen M, Lubec G (2001). "Избирательная регуляция белков протеолитического пути убиквитина-протеасомы, дзета-цепи протеасомы и изопептидазы T при синдроме Дауна плода". Экспрессия белка в мозге при синдроме Дауна . стр.  117–30 . doi :10.1007/978-3-7091-6262-0_10. ISBN 978-3-211-83704-7. PMID  11771738. {{cite book}}: |journal=проигнорировано ( помощь )
  • Gabriel JM, Lacombe T, Carobbio S, Paquet N, Bisig R, Cox JA, Jaton JC (ноябрь 2002 г.). «Цинк необходим для каталитической активности человеческой деубиквитинирующей изопептидазы T». Биохимия . 41 (46): 13755– 66. doi :10.1021/bi026096m. PMID  12427038.
  • Lacombe T, Gabriel JM (ноябрь 2002 г.). «Дальнейшая характеристика предполагаемого каталитического сайта человеческой изопептидазы T». FEBS Letters . 531 (3): 469– 74. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03586-X . PMID  12435595. S2CID  26832850.
  • Anderson NL, Polanski M, Pieper R, Gatlin T, Tirumalai RS, Conrads TP, Veenstra TD, Adkins JN, Pounds JG, Fagan R, Lobley A (апрель 2004 г.). «Протеом человеческой плазмы: неизбыточный список, разработанный путем объединения четырех отдельных источников». Молекулярная и клеточная протеомика . 3 (4): 311–26 . doi : 10.1074/mcp.M300127-MCP200 . PMID  14718574.
  • Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (июнь 2004 г.). «Характеристика транскриптома проливает свет на сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку эмбриональных стволовых клеток человека». Nature Biotechnology . 22 (6): 707– 16. doi : 10.1038/nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
  • Колланд Ф, Жак Икс, Труплен В, Мужен С, Гроазело С, Гамбургер А, Мейл А, Войчик Дж, Легрен П, Готье ЖМ (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геномные исследования . 14 (7): 1324– 32. doi :10.1101/gr.2334104. ПМЦ  442148 . ПМИД  15231748.
  • Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173– 8. Библиографический код : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Reyes-Turcu FE, Horton JR, Mullally JE, Heroux A, Cheng X, Wilkinson KD (март 2006 г.). «Связывающий домен убиквитина ZnF UBP распознает C-концевой диглициновый мотив незакрепленного убиквитина». Cell . 124 (6): 1197– 208. doi : 10.1016/j.cell.2006.02.038 . PMID  16564012. S2CID  1312137.


Значок заглушки

Эта статья о гене на хромосоме 12 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=USP5&oldid=1189886103"