USP48

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
USP48
Идентификаторы
ПсевдонимыUSP48 , RAP1GA1, USP31, убиквитин-специфическая пептидаза 48
Внешние идентификаторыОМИМ : 617445; МГИ : 2158502; гомологен : 12988; Генные карты : USP48; OMA :USP48 – ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

НМ_130879
НМ_001347227
НМ_001355588

RefSeq (белок)
Местоположение (UCSC)Хр 1: 21,68 – 21,78 МбХр 4: 137,59 – 137,66 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Убиквитин-карбокситерминальная гидролаза 48 — это фермент , который у людей кодируется геном USP48 . [ 5] [6]

Этот ген кодирует белок, содержащий домены, которые связывают его с семейством пептидаз C19, также известным как семейство 2 убиквитиновых карбоксильно-терминальных гидролаз. Члены семейства функционируют как деубиквитинирующие ферменты, распознавая и гидролизуя пептидную связь на C-концевом глицине убиквитина. Ферменты в семействе пептидаз C19 участвуют в обработке предшественников полиубиквитина, а также убиквитинированных белков. Были охарактеризованы альтернативные транскрипционные варианты сплайсинга, кодирующие различные изоформы. [6]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена USP48 может регулироваться MITF . [7]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000090686 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000043411 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Puente XS, Sanchez LM, Overall CM, Lopez-Otin C (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Nat Rev Genet . 4 (7): 544–58 . doi :10.1038/nrg1111. PMID  12838346. S2CID  2856065.
  6. ^ ab "Ген Энтреза: специфическая пептидаза 48 убиквитина USP48".
  7. ^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM и др. (2008). «Новые цели MITF, идентифицированные с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Pigment Cell Melanoma Res . 21 (6): 665–76 . doi : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . PMID  19067971.

Дальнейшее чтение

  • Wilkinson KD (1998). «Регуляция убиквитин-зависимых процессов деубиквитинирующими ферментами». FASEB J . 11 (14): 1245– 56. doi : 10.1096/fasebj.11.14.9409543 . PMID  9409543. S2CID  11788220.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Кесада В., Диас-Пералес А., Гутьеррес-Фернандес А. и др. (2004). «Клонирование и ферментативный анализ 22 новых убиквитин-специфичных протеаз человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 314 (1): 54–62 . doi :10.1016/j.bbrc.2003.12.050. ПМИД  14715245.
  • Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M и др. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Genome Res . 14 (9): 1711– 8. doi :10.1101/gr.2435604. PMC  515316. PMID  15342556 .
  • Lockhart PJ, Hulihan M, Lincoln S и др. (2004). «Идентификация гена человеческой убиквитин-специфической протеазы 31 (USP31): анализ структуры, последовательности и экспрессии». DNA Seq . 15 (1): 9– 14. doi :10.1080/10855660310001638197. PMID  15354349. S2CID  36992328.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Tzimas C, Michailidou G, Arsenakis M и др. (2006). «Человеческая убиквитин-специфическая протеаза 31 является деубиквитинирующим ферментом, участвующим в активации ядерного фактора-kappaB». Cell. Signal . 18 (1): 83– 92. doi :10.1016/j.cellsig.2005.03.017. PMID  16214042.
  • Gregory SG, Barlow KF, McLay KE и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация человеческой хромосомы 1». Nature . 441 (7091): 315– 21. Bibcode :2006Natur.441..315G. doi : 10.1038/nature04727 . PMID  16710414.
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=USP48&oldid=1215922363"