Суперсемейство факторов некроза опухоли
| Суперсемейство факторов некроза опухоли | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Тримерная структура TNF-альфа, продуцируемого Mus musculus , на основе структуры PDB 2TNF (разрешение 1,4 Å). Разные цвета представляют разные мономеры. Baeyens, KJ et al. (1999). [1] Рисунок получен с использованием FirstGlance Jmol. | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ФНО | ||||||||
| Пфам | ПФ00229 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR006052 | ||||||||
| ПРОСИТ | PDOC00224 | ||||||||
| СКОП2 | 1тнф / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| суперсемейство OPM | 292 | ||||||||
| белок ОПМ | 2hew | ||||||||
| Мембранома | 80 | ||||||||
| |||||||||
| ФНО | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 кристаллическая структура trail-sdr5 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ФНО | ||||||||
| Пфам | ПФ00229 | ||||||||
| Клан ПФАМ | CL0100 | ||||||||
| ЭКОД | 10.3.1 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR006052 | ||||||||
| ПРОСИТ | PDOC00561 | ||||||||
| СКОП2 | 1тнр / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Суперсемейство фактора некроза опухоли ( TNF ) — это суперсемейство белков трансмембранных белков типа II, содержащих домен гомологии TNF и образующих тримеры . Члены этого суперсемейства могут высвобождаться из клеточной мембраны путем внеклеточного протеолитического расщепления и функционировать как цитокин . Эти белки экспрессируются преимущественно иммунными клетками и регулируют различные функции клеток, включая иммунный ответ и воспаление, а также пролиферацию, дифференциацию, апоптоз и эмбриогенез . [2] [3]
Суперсемейство содержит 19 членов, которые связываются с 29 членами суперсемейства рецепторов ФНО . [4] Наличие ортологов у беспозвоночных намекает на древнее происхождение этого суперсемейства в эволюции. [2]
Паттерн PROSITE этого суперсемейства расположен в бета-слое в центральной части белка, который сохраняется у всех членов.
Участники
Существует 19 членов семьи, пронумерованных как TNFSF#, где # обозначает номер члена, иногда за которым следует буква. [4] [2]
| TNFSF# | Имя | Синонимы | Ген | Функция |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Лимфотоксин альфа | ФНОβ, TNFSF1B | ЛТА | Индукция воспаления и противовирусного ответа, развитие вторичных лимфоидных органов , роль в опухолеобразовании |
| 2 | Фактор некроза опухоли | TNFα, Dif, Некрозин, TNFSF1A, ... | ФНО | Регуляция иммунных клеток, индукция лихорадки , кахексии , воспаления и апоптоза , ингибирование опухолеобразования и репликации вирусов , а также ответ на сепсис |
| 3 | Лимфотоксин бета | ФНОγ | ЛТБ | Индукция воспаления и противовирусного ответа, развитие вторичных лимфоидных органов , роль в опухолеобразовании |
| 4 | Лиганд OX40 | CD252, Gp34, CD134L | TNFSF4 | Активация иммунного ответа Т-клеток путем костимуляции Т-клеток |
| 5 | Лиганд CD40 | CD154, TRAP, Gp39, T-BAM | CD40LG | Регуляция адаптивного иммунного ответа путем активации антигенпрезентирующих клеток |
| 6 | Fas-лиганд | CD178, АПТЛ, CD95L | ФАШЛГ | Регуляция гомеостаза Т-клеток путем индукции апоптоза |
| 7 | Лиганд CD27 | CD70 | CD70 | Регуляция активации В-клеток и гомеостаза Т-клеток |
| 8 | Лиганд CD30 | CD153 | TNFSF8 | Индукция апоптоза Т-клеток и В -клеток , профилактика аутоиммунитета |
| 9 | Лиганд CD137 | 4-1 баррель | TNFSF9 | |
| 10 | Лиганд, индуцирующий апоптоз, связанный с ФНО | CD253, АПО-2Л | TNFSF10 | Ингибирование опухолеобразования , индукция апоптоза |
| 11 | Рецептор активатора ядерного фактора каппа-В лиганд | CD254, OPGL, ТРАНС, ODF | TNFSF11 | Рост тканей (в частности, регенерация и ремоделирование костей), созревание дендритных клеток |
| 12 | Слабый индуктор апоптоза, связанный с ФНО | АПО-3Л, ДР3Л | TNFSF12 | Регуляция ангиогенеза , индукция апоптоза |
| 13 | Лиганд, индуцирующий пролиферацию | CD256, ТАЛЛ-2, TRDL1 | TNFSF13 | Регуляция развития В-клеток и выживаемости плазматических клеток |
| 13Б | Фактор активации В-клеток | CD257, BLyS, TALL-1, TNFSF20, ... | TNFSF13B | Стимуляция пролиферации и дифференцировки В-клеток |
| 14 | СВЕТ | CD258, HVEML | TNFSF14 | Стимуляция пролиферации Т-клеток , регуляция апоптоза |
| 15 | Ингибитор роста эндотелия сосудов | ТЛ1, ТЛ-1А | TNFSF15 | Ингибирование ангиогенеза |
| 18 | Член суперсемейства TNF 18 | ГИТРЛ, АИТРЛ, TL-6 | TNFSF18 | Регуляция выживаемости Т-клеток |
| 19 | Эктодисплазина А | ЭД1-А1, ЭД1-А2 | ЭДА | Развитие эктодермальных тканей |
Ссылки
- ^ Baeyens KJ, De Bondt HL, Raeymaekers A, Fiers W, De Ranter CJ (апрель 1999). «Структура фактора некроза опухоли мыши при разрешении 1,4 А: к модуляции его селективности и тримеризации». Acta Crystallographica Section D. 55 ( Pt 4): 772– 8. Bibcode :1999AcCrD..55..772B. doi :10.1107/s0907444998018435. PMID 10089307.
- ^ abc Эволюция иммунной системы: сохранение и диверсификация . Амстердам: Elsevier. 2016. ISBN 978-0-12-801975-7. OCLC 950694824.
- ^ Аббас А.К., Лихтман А.Х., Пиллаи С. (май 2017 г.). Клеточная и молекулярная иммунология (Девятое изд.). Филадельфия, Пенсильвания. ISBN 978-0-323-47978-3. OCLC 973917896.
{{cite book}}: CS1 maint: отсутствует местоположение издателя ( ссылка ) - ^ ab Aggarwal BB, Gupta SC, Kim JH (январь 2012 г.). «Исторические перспективы фактора некроза опухоли и его суперсемейства: 25 лет спустя, золотое путешествие». Blood . 119 (3): 651– 65. doi :10.1182/blood-2011-04-325225. PMC 3265196 . PMID 22053109.
Внешние ссылки
- Опухоль+Некроз+Факторы в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
- ген фактора некроза опухоли pex1
