Толстый белок
Семейство белков
Толстый белок
Белок типа «тубби», экспрессируемый в мозге мыши
Идентификаторы
СимволВанна
ПфамПФ01167
ИнтерПроIPR000007
ПРОСИТPDOC00923
СКОП21c8z / ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ / SUPFAM
суперсемейство OPM104
белок ОПМ1i7e
Доступные структуры белков:
Пфам  структуры / ECOD  
ПДБRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumрезюме структуры
ПДБ1с31 А:258-500 1и7е А:257-499 1c8z А:257-499

Белок тубби кодируется геном TUB . Это белок восходящей клеточной сигнализации, общий для многоклеточных эукариот . Первый ген тубби был идентифицирован у мышей , а белки, гомологичные тубби, известны как «белки типа тубби» (TULP). Они имеют общую и характерную третичную структуру , которая состоит из бета-бочонка, упакованного вокруг альфа-спирали в центральной поре. Ген получил свое название от своей роли в метаболизме; у мышей с мутировавшим геном тубби развивается ожирение с отсроченным началом , нейросенсорная потеря слуха и дегенерация сетчатки . [1] [2] [3]

Структура

Белки Tubby классифицируются как белки α+β и имеют 12- бета-цепочечный ствол, окружающий центральную альфа-спираль. Белки Tubby могут связывать сигнальную молекулу небольшой клетки фосфатидилинозитол , которая обычно локализуется в клеточной мембране . Похожая структурная складка для белков Tubby была обнаружена в семействе белков Scramblase . [4]

Функция

Белки Tubby были вовлечены в качестве факторов транскрипции [5] и в качестве потенциальных сигнальных факторов, связанных с активностью G-белка . [6] Они связаны с нейронной дифференциацией и развитием , а у млекопитающих вовлечены в три патологических процесса при мутации : ожирение , дегенерация сетчатки и потеря слуха . [5] Известно, что у мышей мутации в белках Tubby влияют на продолжительность жизни и накопление жира [7], а также на метаболизм углеводов . [8] Домены Tubby связаны с цитоплазматической стороной клеточных мембран посредством связывания различных фосфоинозитидов [9]

Белки человека, содержащие этот домен

ВАННА ; ТЮЛЬП1 ; ТЮЛЬП2; ТЮЛЬП3; ТЮЛЬП4;

  • SCOP тубби-фолд

Ссылки

  1. ^ Noben-Trauth, K.; Naggert, JK; North, MA; Nishina, PM (1996). «Ген-кандидат на мутацию мыши tubby». Nature . 380 (6574): 534– 538. Bibcode :1996Natur.380..534N. doi :10.1038/380534a0. PMID  8606774. S2CID  4272027.
  2. ^ Kleyn, PW; Fan, W.; Kovats, SG; Lee, JJ; Pulido, JC; Wu, Y.; Berkemeier, LR; Misumi, DJ; Holmgren, L.; Charlat, O.; Woolf, EA; Tayber, O.; Brody, T.; Shu, P.; Hawkins, F.; Kennedy, B.; Baldini, L.; Ebeling, C.; Alperin, GD; Deeds, J.; Lakey, ND; Culpepper, J.; Chen, H.; Glücksmann-Kuis, MA; Carlson, GA; Duyk, GM; Moore, KJ (1996). "Идентификация и характеристика гена ожирения у мышей tubby: член нового семейства генов". Cell . 85 (2): 281– 290. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81104-6 . PMID  8612280. S2CID  15670925.
  3. ^ Олемиллер, К.К.; Хьюз, Р.М.; Мосингер-Огилви, Дж.; Спек, Дж.Д.; Грософ, Д.Х.; Сильверман, М.С. (1995). «Дегенерация улитки и сетчатки у пузатой мыши». NeuroReport . 6 (6): 845– 9. doi :10.1097/00001756-199504190-00005. PMID  7612867. S2CID  8311280.
  4. ^ Bateman A, Finn RD, Sims PJ, Wiedmer T, Biegert A, Söding J (январь 2009 г.). «Фосфолипидные скрамблазы и белки, подобные Tubby, принадлежат к новому суперсемейству связанных с мембраной факторов транскрипции». Bioinformatics . 25 (2): 159– 62. doi :10.1093/bioinformatics/btn595. PMC 2639001 . PMID  19010806. 
  5. ^ ab Boggon, TJ; Shan, WS; Santagata, S; Myers, SC; Shapiro, L (1999). "Влияние белков tubby на транскрипцию с помощью структурно-ориентированного функционального анализа". Science . 286 (5447): 2119– 25. doi :10.1126/science.286.5447.2119. PMID  10591637.
  6. ^ Кэрролл, К; Гомес, К; Шапиро, Л (2004). «Пухлые белки: сюжет закручивается». Nat Rev Mol Cell Biol . 5 (1): 55– 63. doi :10.1038/nrm1278. PMID  14708010. S2CID  7065010.
  7. ^ Mukhopadhyay, A; Deplancke, B; Walhout, AJ; Tissenbaum, HA (2005). «C. elegans tubby регулирует продолжительность жизни и накопление жира двумя независимыми механизмами». Cell Metab . 2 (1): 35–42 . doi : 10.1016/j.cmet.2005.06.004 . PMID  16054097.
  8. ^ Ван, Y; Себурн, K; Бехтель, L; Ли, BY; Саткевич, JP; Нишина, PM; Наггерт, JK (2006). «Дефектный метаболизм углеводов у мышей, гомозиготных по мутации tubby». Physiol Genomics . 27 (2): 131– 40. doi :10.1152/physiolgenomics.00239.2005. PMID  16849632.
  9. ^ Cho, W. & Stahelin, RV (июнь 2005 г.). «Взаимодействие мембранных белков в клеточной сигнализации и мембранном транспорте». Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure . 34 : 119– 151. doi : 10.1146/annurev.biophys.33.110502.133337. PMID  15869386.


Значок заглушки

Эта статья о мембранных белках является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Tubby_protein&oldid=1137510500"