Топономика
Топономика — это дисциплина в системной биологии , молекулярной клеточной биологии и гистологии, занимающаяся изучением топонома организмов . [1] [2] Это область исследований, целью которой является расшифровка полного топонома в состоянии здоровья и болезни (проект топонома человека) [3] — что является следующей большой задачей в области биотехнологии человека после расшифровки генома человека. [3] [4]
Топоном – это пространственный сетевой код белков и других биомолекул в морфологически неповрежденных клетках и тканях. [2] [5]
Пространственная организация биомолекул в клетках напрямую выявляется с помощью циклической микроскопии изображений с неограниченным по параметрам и размерности функциональным разрешением. Получающиеся структуры топонома иерархически организованы и могут быть описаны трехсимвольным кодом. [1] [5] [6] [7]
Этимология
Термины топоном и топономика были введены в 2003 году Вальтером Шубертом на основе наблюдений с помощью циклических микроскопов с визуализацией (ICM) . [1]
Топоном происходит от древнегреческих существительных topos (τόπος, «место, положение») и nomos (νόμος, «закон»). Следовательно, топономика — это описательный термин , обозначающий тот факт, что пространственная сеть биомолекул в клетках следует топологическим правилам, позволяющим осуществлять скоординированные действия. [1]
Ссылки
- ^ abcd Шуберт, В. (2003). Топологическая протеомика, Топономика, MELK-технология . Т. 83. С. 189–209. doi :10.1007/3-540-36459-5_8. ISBN 978-3-540-00546-9. PMID 12934931.
{{cite book}}:|journal=проигнорировано ( помощь ) - ^ ab Schubert, W (2013). «Топономика». Энциклопедия системной биологии . Springer New York. стр. 2191–2212. doi :10.1007/978-1-4419-9863-7_631. ISBN 978-1-4419-9862-0.
- ^ ab Cottingham, Katie (май 2008 г.). "Проект топонома человека | Human Proteinpedia открыта для (бесплатного) бизнеса". Journal of Proteome Research . 7 (5): 1806. doi : 10.1021/pr083701k .
- ^ Abott, A (12 октября 2006 г.). ""Картографирование единения" (основной момент исследования, ссылающийся на Schubert et al. 2006)". Nature . 443 (7112): 608–609. Bibcode :2006Natur.443..608.. doi : 10.1038/443608a .
- ^ аб Шуберт, Уолтер; Боннеко, Бернд; Поммер, Ансгар Дж; Филипсен, Ларс; Бёкельманн, Райк; Малых, Янина; Голлник, Харальд; Фриденбергер, Мануэла; Боде, Маркус; Платье, Андреас В.М. (1 октября 2006 г.). «Анализ топологии и функции протеома с помощью автоматизированной многомерной флуоресцентной микроскопии». Природная биотехнология . 24 (10): 1270–1278. дои : 10.1038/nbt1250. PMID 17013374. S2CID 30436820.
- ^ Шуберт, Вальтер (июнь 2007 г.). «Трехсимвольный код для организованных протеомов на основе циклической визуализации местоположений белков». Цитометрия Часть A. 71A ( 6): 352–360. doi : 10.1002/cyto.a.20281 . PMID 17326231. S2CID 3132423.
- ^ Шуберт, В. "Прямая пространственная визуализация случайно больших супермолекул с использованием циклической микроскопии TIS с неограниченным параметром" (PDF) . Международная конференция по микроскопии 2013 . Получено 23.09.2013 .
 | Эта статья по биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее. |
