Тимопоэтин

ТМПО
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTMPO , CMD1T, LAP2, LEMD4, PRO0868, TP, тимопоэтин
Внешние идентификаторыОМИМ : 188380; МГИ : 106920; Гомологен : 31144; GeneCards : ТМПО; ОМА :ТМПО - ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001032283
NM_001032284
NM_001307975
NM_003276

RefSeq (белок)
Местоположение (UCSC)Хр 12: 98.52 – 98.55 МбХр 10: 90.98 – 91.02 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Ассоциированный с пластинкой полипептид 2 (LAP2), изоформы бета/гамма, представляет собой белок , который у человека кодируется геном TMPO . [5] [6] LAP2 представляет собой белок внутренней ядерной мембраны (INM) . [7]

Тимопоэтин — это белок, участвующий в индукции CD90 в тимусе . Ген тимопоэтина (TMPO) кодирует три альтернативно сплайсированные мРНК, кодирующие белки 75 кДа (альфа), 51 кДа (бета) и 39 кДа (гамма), которые повсеместно экспрессируются во всех клетках. Ген TMPO человека картируется на хромосомной полосе 12q22 и состоит из восьми экзонов. TMPO альфа присутствует диффузно экспрессируется с ядром клетки, в то время как TMPO бета и гамма локализованы в ядерной мембране. TMPO бета — это человеческий гомолог мышиного белка LAP2. LAP2 играет роль в регуляции ядерной архитектуры, связывая ламин B1 и хромосомы. Это взаимодействие регулируется фосфорилированием во время митоза. Учитывая ядерную локализацию трех изоформ TMPO, маловероятно, что эти белки играют какую-либо роль в индукции CD90.

Взаимодействия

Было показано, что тимопоэтин взаимодействует с барьером для фактора аутоинтеграции 1 , [8] AKAP8L , [9] [10] LMNB1 [11] [12] и LMNA . [13] [14]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000120802 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000019961 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Harris CA, Andryuk PJ, Cline S, Chan HK, Natarajan A, Siekierka JJ, Goldstein G (июль 1994 г.). «Три различных человеческих тимопоэтина получены из альтернативно сплайсированных мРНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (14): 6283– 7. Bibcode : 1994PNAS...91.6283H. doi : 10.1073/pnas.91.14.6283 . PMC 44185. PMID  7517549 . 
  6. ^ «Ген Энтрез: тимопоэтин ТМПО» .
  7. ^ Holmer L, Worman HJ (ноябрь 2001 г.). «Внутренние ядерные мембранные белки: функции и нацеливание». Cellular and Molecular Life Sciences . 58 ( 12– 13): 1741– 7. doi :10.1007/PL00000813. PMC 11337314 . PMID  11766875. S2CID  20902309. 
  8. ^ Фурукава К (август 1999). «LAP2-связывающий белок 1 (L2BP1/BAF) является кандидатом на роль медиатора взаимодействия LAP2-хроматина». Журнал клеточной науки . 112 (ч. 15) (15): 2485–92 . doi :10.1242/jcs.112.15.2485. PMID  10393804.
  9. ^ Мартинс СБ, Эйде Т, Стин РЛ, Яхнсен Т, Скалхегг БС, Коллас П (ноябрь 2000 г.). «HA95 — это белок хроматина и ядерного матрикса, регулирующий динамику ядерной оболочки». Журнал клеточной науки . 113 Pt 21 (21): 3703– 13. doi : 10.1242/jcs.113.21.3703 . PMID  11034899.
  10. ^ Мартинс С., Эйквар С., Фурукава К., Коллас П. (январь 2003 г.). «HA95 и LAP2 бета опосредуют новое взаимодействие хроматина и ядерной оболочки, вовлеченное в инициацию репликации ДНК». Журнал клеточной биологии . 160 (2): 177– 88. doi :10.1083/jcb.200210026. PMC 2172640. PMID  12538639 . 
  11. ^ Фурукава К, Кондо Т (февраль 1998). «Идентификация домена связывания полипептида 2, ассоциированного с ламиной, ламина типа B». Европейский журнал биохимии . 251 (3): 729–33 . doi : 10.1046/j.1432-1327.1998.2510729.x . PMID  9490046.
  12. ^ Foisner R, Gerace L (июль 1993). «Интегральные мембранные белки ядерной оболочки взаимодействуют с ламинами и хромосомами, а связывание модулируется митотическим фосфорилированием». Cell . 73 (7): 1267– 79. doi :10.1016/0092-8674(93)90355-T. PMID  8324822. S2CID  10641633.
  13. ^ Markiewicz E, Dechat T, Foisner R, Quinlan RA, Hutchison CJ (декабрь 2002 г.). «Ламин A/C-связывающий белок LAP2alpha необходим для ядерного закрепления белка ретинобластомы». Молекулярная биология клетки . 13 (12): 4401– 13. doi :10.1091/mbc.E02-07-0450. PMC 138642. PMID  12475961 . 
  14. ^ Dechat T, Korbei B, Vaughan OA, Vlcek S, Hutchison CJ, Foisner R (октябрь 2000 г.). «Полипептид 2альфа, ассоциированный с ламиной, связывает внутриядерные ламины А-типа». Journal of Cell Science . 113 Pt 19 (19): 3473– 84. doi :10.1242/jcs.113.19.3473. PMID  10984438.

Дальнейшее чтение

  • Harris CA, Andryuk PJ, Cline SW, Mathew S, Siekierka JJ, Goldstein G (июль 1995 г.). «Структура и картирование гена человеческого тимопоэтина (TMPO) и связь человеческого TMPO бета с крысиным ламин-ассоциированным полипептидом 2». Genomics . 28 (2): 198– 205. doi :10.1006/geno.1995.1131. PMID  8530026.
  • Dechat T, Vlcek S, Foisner R (апрель 2000 г.). «Обзор: изоформы полипептида 2, ассоциированного с пластинкой, и родственные белки в динамике ядерной структуры, зависящей от клеточного цикла». Журнал структурной биологии . 129 ( 2– 3): 335– 45. doi : 10.1006/jsbi.2000.4212. PMID  10806084.
  • Twomey JJ, Goldstein G, Lewis VM, Bealmear PM, Good RA (июнь 1977 г.). «Биологическое определение уровней тимопоэтина и тимического гормона в плазме человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 74 (6): 2541– 5. Bibcode : 1977PNAS...74.2541T. doi : 10.1073/pnas.74.6.2541 . PMC  432209. PMID  302007 .
  • Heavner GA, Audhya T, Goldstein G (февраль 1990 г.). «Пептидные аналоги тимопентина различают различные специфичности рецепторов тимопоэтина на двух линиях человеческих Т-клеток». Regulatory Peptides . 27 (2): 257– 62. doi :10.1016/0167-0115(90)90044-W. PMID  2158125. S2CID  12562672.
  • Fuccello A, Audhya T, Talle MA, Goldstein G (январь 1984). «Иммуноферментный анализ на тимопоэтин бычьей сыворотки: различение от спленина моноклональными антителами». Архивы биохимии и биофизики . 228 (1): 292– 8. doi :10.1016/0003-9861(84)90070-5. PMID  6364989.
  • Hara H, Hayashi K, Ohta K, Itoh N, Ohta M (ноябрь 1994). «Новый ген-предшественник тимопоэтина из человеческого тимуса». Biochemistry and Molecular Biology International . 34 (5): 927–33 . PMID  7703909.
  • Goldstein G, Schlesinger DH, Audhya T (июнь 1994 г.). "Выделение и полная аминокислотная последовательность человеческого тимопоэтина и спленина". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (13): 6249. Bibcode : 1994PNAS ...91.6249G. doi : 10.1073/pnas.91.13.6249 . PMC  44176. PMID  8016147.
  • Harris CA, Andryuk PJ, Cline SW, Mathew S, Siekierka JJ, Goldstein G (июль 1995 г.). «Структура и картирование гена человеческого тимопоэтина (TMPO) и связь человеческого TMPO бета с крысиным ламин-ассоциированным полипептидом 2». Genomics . 28 (2): 198– 205. doi :10.1006/geno.1995.1131. PMID  8530026.
  • Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшенного построения библиотеки дробовика». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107– 13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID  8619474.
  • Berger R, Theodor L, Shoham J, Gokkel E, Brok-Simoni F, Avraham KB, Copeland NG, Jenkins NA, Rechavi G, Simon AJ (май 1996 г.). «Характеристика и локализация гена мышиного тимопоэтина/ламина-ассоциированного полипептида 2 и его альтернативно сплайсированных продуктов». Genome Research . 6 (5): 361– 70. doi : 10.1101/gr.6.5.361 . PMID  8743987.
  • Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (апрель 1997 г.). "Крупномасштабное конкатенационное секвенирование ДНК". Genome Research . 7 (4): 353– 8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC  139146 . PMID  9110174.
  • Furukawa K, Fritze CE, Gerace L (февраль 1998 г.). «Основной домен таргетинга ядерной оболочки LAP2 совпадает с его областью связывания ламина, но отличается от его домена взаимодействия с хроматином». Журнал биологической химии . 273 (7): 4213– 9. doi : 10.1074/jbc.273.7.4213 . PMID  9461618.
  • Фурукава К, Кондо Т (февраль 1998). «Идентификация домена связывания полипептида 2, ассоциированного с ламиной, ламина типа B». Европейский журнал биохимии . 251 (3): 729–33 . doi : 10.1046/j.1432-1327.1998.2510729.x . PMID  9490046.
  • Дечат Т., Готцманн Дж., Стокингер А., Харрис К.А., Талле М.А., Сикерка Дж.Дж., Фойснер Р. (август 1998 г.). «Устойчивость LAP2альфа к детергентам и соли в интерфазных ядрах и зависимая от фосфорилирования ассоциация с хромосомами на ранних стадиях сборки ядра подразумевают функции в динамике ядерной структуры». Журнал ЭМБО . 17 (16): 4887–902 . doi :10.1093/emboj/17.16.4887. ПМК  1170818 . ПМИД  9707448.
  • Фурукава К (август 1999). "LAP2-связывающий белок 1 (L2BP1/BAF) является кандидатом на роль медиатора взаимодействия LAP2-хроматина". Журнал клеточной науки . 112 (ч. 15) (15): 2485–92 . doi :10.1242/jcs.112.15.2485. PMID  10393804.
  • Weber PJ, Eckhard CP, Gonser S, Otto H, Folkers G, Beck-Sickinger AG (июнь 1999 г.). «О роли тимопоэтинов в пролиферации клеток. Иммунохимические доказательства новых членов семейства человеческих тимопоэтинов». Biological Chemistry . 380 (6): 653– 60. doi :10.1515/BC.1999.081. PMID  10430029. S2CID  12957414.
  • Dechat T, Korbei B, Vaughan OA, Vlcek S, Hutchison CJ, Foisner R (октябрь 2000 г.). «Полипептид 2альфа, ассоциированный с ламиной, связывает внутриядерные ламины А-типа». Journal of Cell Science . 113 Pt 19 (19): 3473– 84. doi :10.1242/jcs.113.19.3473. PMID  10984438.
  • Martins SB, Eide T, Steen RL, Jahnsen T, Skålhegg BS, Collas P (ноябрь 2000 г.). «HA95 — это белок хроматина и ядерного матрикса, регулирующий динамику ядерной оболочки». Journal of Cell Science . 113 Pt 21 (21): 3703– 13. doi : 10.1242/jcs.113.21.3703 . PMID  11034899.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Тимопоэтин&oldid=1242302918"