Термококк барофилус

Виды археев

Термококк барофилус
Научная классификация
Домен:
Королевство:
Тип:
Сорт:
Заказ:
Семья:
Род:
Разновидность:
Т. барофилус
Биномиальное имя
Термококк барофилус
Мартейнссон и др. 1999

Thermococcus barophilus пьезофильный и гипертермофильный архей , выделенный из глубоководного гидротермального источника . Он анаэробный и метаболизирующий серу, с типовым штаммом MP T. [1 ]

Номенклатура

Название Thermococcus barophilus имеет греческие корни: thermo — тепло, kokkos — сферические клетки, baros — вес и philos — любить. В целом, название означает «организм со сферическим телом, который тяготеет к теплу и давлению водяного столба ». [2]

Физиология

T. barophilus может расти даже при более высоких температурах, если давление высокое. При атмосферном давлении он может расти при температуре 45–90 °C, с оптимальной температурой 85 °C, но он может расти при температуре до 100 °C, если гидростатическое давление составляет 15,0–17,5 МПа. [2] Для его роста необходима сера, но он также может расти медленно и в отсутствие серы. Мембранный липид имеет основной археоловый компонент. [3]

Геном

Геном T. barophilus был секвенирован и имеет кольцевую природу с размером 2 010 078 п.н. Он также имеет кольцевую плазмиду pTBMP1. Последовательность генома показывает, что он имеет карбоксидотрофный путь и несет семь различных комплексов гидрогеназы. [4]

Транскриптом

Также был проведен анализ транскриптома этого организма. Было обнаружено, что 378 генов дифференциально экспрессируются в T. barophilus при различных условиях давления. Гены, связанные с производством и преобразованием энергии, транспортом и метаболизмом неорганических ионов, а также транспортом и метаболизмом крабогидратов, активируются. Гены, которые активируются с понижением, участвуют в транспорте и метаболизме аминокислот, транспорте и метаболизме нуклеотидов, репликации, восстановлении и рекомбинации, а также транспорте и метаболизме неорганических ионов. [5]

Ссылки

  1. ^ Marteinsson, VT; Birrien, J.-L.; Reysenbach, A.-L.; Vernet, M.; Marie, D.; Gambacorta, A.; Messner, P.; Sleytr, UB; Prieur, D. (1999). "Thermococcus barophilus sp. nov., новый барофильный и гипертермофильный архей, изолированный под высоким гидростатическим давлением из глубоководного гидротермального источника". International Journal of Systematic Bacteriology . 49 (2): 351– 359. doi : 10.1099/00207713-49-2-351 . ISSN  0020-7713. PMID  10319455.
  2. ^ ab Дэвид Р. Бун; Ричард В. Кастенхольц, ред. (2012-01-13). Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том 1 (2-е изд.). Springer Science & Business Media. стр. 344. ISBN 978-0387216096. Получено 23.09.2016 .
  3. ^ Marteinsson, VT; Birrien, JL; Reysenbach, AL; Vernet, M.; Marie, D.; Gambacorta, A.; Messner, P.; Sleytr, UB; Prieur, D. (апрель 1999 г.). "Thermococcus barophilus sp. nov., новый барофильный и гипертермофильный архей, изолированный под высоким гидростатическим давлением из глубоководного гидротермального источника". International Journal of Systematic Bacteriology . 49 Pt 2 (2): 351– 359. doi : 10.1099/00207713-49-2-351 . ISSN  0020-7713. PMID  10319455.
  4. ^ Ванниер, Полин; Мартейнссон, Вигго Тор; Фридьонссон, Олафур Хединн; Огер, Филипп; Джеббар, Мохамед (март 2011 г.). «Полная последовательность генома гипертермофильной, пьезофильной, гетеротрофной и карбоксидотрофной археи Thermococcus barophilus MP». Журнал бактериологии . 193 (6): 1481– 1482. doi :10.1128/JB.01490-10. ISSN  1098-5530. PMC 3067617. PMID 21217005  . 
  5. ^ Vannier, Pauline; Michoud, Grégoire; Oger, Philippe; Marteinsson, Viggó Þór; Jebbar, Mohamed (ноябрь 2015 г.). «Экспрессия генома Thermococcus barophilus и Thermococcus kodakarensis в ответ на различные условия гидростатического давления». Research in Microbiology . 166 (9): 717– 725. doi : 10.1016/j.resmic.2015.07.006 . ISSN  1769-7123. PMID  26239966.

Дальнейшее чтение

  • Thiel, A.; Michoud, G.; Moalic, Y.; Flament, D.; Jebbar, M. (2014). «Генетические манипуляции гипертермофильной пьезофильной археи Thermococcus barophilus». Applied and Environmental Microbiology . 80 (7): 2299– 2306. Bibcode : 2014ApEnM..80.2299T. doi : 10.1128/AEM.00084-14. ISSN  0099-2240. PMC 3993132.  PMID 24487541  .
  • Marteinsson, VT; Reysenbach, A. -L.; Birrien, J. -L.; Prieur, D. (1999). "Стрессовый белок индуцируется в глубоководном барофильном гипертермофиле Thermococcus barophilus при выращивании под атмосферным давлением". Extremophiles . 3 (4): 277– 282. doi :10.1007/s007920050128. ISSN  1431-0651. PMID  10591019. S2CID  19414485.
  • Vannier, Pauline (март 2011 г.). «Полная последовательность генома гипертермофильной, пьезофильной, гетеротрофной и карбоксидотрофной археи Thermococcus barophilus MP». Journal of Bacteriology . 193 (6): 1481– 2. doi :10.1128/JB.01490-10. PMC  3067617 . PMID  21217005 . Получено 4 ноября 2014 г. .
  • Satyanarayana, Tulasi; Littlechild, Jennifer; Kawarabayasi, Yutaka, ред. (2013). Термофильные микробы в экологической и промышленной биотехнологии: Биотехнология термофилов. Дордрехт: Springer Netherlands. doi : 10.1007/978-94-007-5899-5. ISBN 978-94-007-5898-8. S2CID  82088128.
  • «Thermococcus barophilus». Энциклопедия жизни .
  • ЛПСН
  • Типовой штамм Thermococcus barophilus в BacDive — базе метаданных бактериального разнообразия


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Thermococcus_barophilus&oldid=1208846612"