Темпл Ф. Смит
Американский академический
Темпл Смит
Темпл Смит в Йельском университете в 2008 году
Рожденный
Темпл Феррис Смит

7 марта 1939 г. (возраст  ( 1939-03-07 )85)
Оберн, Нью-Йорк
Альма-матер
ИзвестныйАлгоритм Смита-Уотермана [3]
Награды
Научная карьера
УчрежденияБостонский университет
ТезисАмплитуды дейтрона из теории ядерного рассеяния составных частиц  (1969)
Веб-сайтwww.bu.edu/eng/profile/temple-f-smith-ph-d/

Темпл Феррис Смит (родился 7 марта 1939 года) — почётный профессор биомедицинской инженерии [4] [5] , который помог разработать алгоритм Смита-Уотермана вместе с Майклом Уотерманом в 1981 году. [3] Алгоритм Смита-Уотермана служит основой для сравнения нескольких последовательностей, определяя сегмент с максимальным локальным сходством последовательностей, см. выравнивание последовательностей . Этот алгоритм используется для определения похожих сегментов ДНК , РНК и белков . Он был директором [ когда? ] Исследовательского центра биомолекулярной инженерии [4] в Бостонском университете в течение двадцати лет и теперь [ когда? ] почётный профессор .

Образование

Смит получил степень бакалавра в 1963 году на физическом факультете Университета Пердью , а затем степень доктора философии в 1969 году на физическом факультете Университета Колорадо в Боулдере . [6]

Исследования и карьера

После получения докторской степени Смит занимался постдокторскими исследованиями с марта 1969 года по август 1971 года на кафедре биофизики и генетики Медицинской школы Университета Колорадо в Боулдере. [ необходима ссылка ]

Его исследования сосредоточены на применении различных компьютерных наук и математических методов для обнаружения синтаксических и семантических закономерностей в последовательностях нуклеиновых кислот и аминокислот. В последние годы это было сосредоточено на молекулярной эволюции семейств белков, таких как WD-повторяющиеся бета-пропеллеры, трансляционно-ассоциированная ГТФаза и рибосомальные белки. [7] Он известен созданием алгоритма Смита-Уотермана . [3]

Смит занимал следующие должности:

  • 1965–1966: инструктор , ВВС США Лоуэри, Денвер, штат Колорадо
  • 1971–1984: Профессор , кафедра физики, Университет Северного Мичигана, Маркетт, Мичиган
  • 1985–1991: Директор , Ресурс компьютерных исследований в области молекулярной биологии, Институт рака Дана-Фарбера, Гарвардская медицинская школа и Гарвардская школа общественного здравоохранения
  • 1991–2009: Директор Центра ресурсов биомолекулярной инженерии Бостонского университета
  • 1999–: Соорганизатор , 1999 Институт академического развития молодежи, День открытия биотехнологий
  • 2000–: Соучредитель и директор по информационным технологиям Modular Genetics, Inc.
  • 2000– : Тренер молодежной хоккейной команды [ требуется ссылка ]

Избранные публикации

  • M. Mariotti, TF Smith, PH Sudmant и G. Goldberger, «Псевдогенизация специфичного для яичек Lfg5 предшествует расхождению человека и неандертальца», Journal of Human Genetics 59, 288–291 (2014)
  • Хайман Хартман и Темпл Ф. Смит «Эволюция рибосомы и генетического кода», Life, 4(2), 227–249 (2014)
  • Хартман, Х. и Т. Ф. Смит, «ГТФазы и происхождение рибосомы», Biology Direct, 5:36-39, (2010)
  • Хартман, Хайман и Смит, Темпл Ф. «Эволюция ресничек и эукариотических клеток» Подвижность клеток и цитоскелет.66: 215-219. (2009)
  • Ху, Лан, Смит, Темпл Ф. и Голдбергер, Габриэль. «LFG: кандидат на роль регулятора апоптоза в семействе генов» Апоптоз. 14: 1255-1265. (2009)
  • Смит, Темпл Ф., Ли, Юнг К., Гутелл, Робин Р. и Хартман, Хайман. «Происхождение и эволюция рибосомы» Biology Direct 3: 16, 1–13 (2008)
  • Смит, Темпл Ф. «Глава 2: Разнообразие белков с повторами WD» Семейство белков Коронина, 20–30 (2008)
  • Bhutkar, Arjun V., Gelbart, William M. и Smith, Temple F. (2007). Выводы о филогении перестроек в масштабе генома и порядке предковых генов: исследование случая Drosophila. Genome Biology 8, R236
  • Бхуткар, Арджун, Руссо, Сьюзан М., Смит, Темпл Ф. и Гелбарт, Уильям М. «Анализ позиционно перемещенных генов в масштабе генома» Genome Research 17: 1880-1887 (2007)
  • Хартман, Хайман, Фаваретто, Паола и Смит, Темпл Ф. «Архейное происхождение эукариотической трансляционной системы» Archaea 2: 1-9 (2006)
  • Бьенковска, Ядвига, Хартман, Хайман и Смит, Темпл Ф. (2003). Метод поиска гомологов малых белков, убиквитин-подобных белков в прокариотических клетках? Белковая инженерия 16 (12), 897–904.
  • Venkatesan, Kavitha, McManus, Heather R., Mello, Craig C., Smith, Temple F. и Hansen, Ulla. (2003). Функциональная консервация между членами древнего семейства дублированных факторов транскрипции, LSF/Grainyhead. Nucleic Acids Research 31(15), 4304–4316.
  • Zhang YX1, Fox JG, Ho Y, Zhang L, Stills HF Jr, Smith TF. Сравнение гена основного белка наружной мембраны (MOMP) штаммов мышиной пневмонии (MoPn) и хомячьего SFPD Chlamydia trachomatis с другими штаммами Chlamydia. Mol Biol Evol. 1993 Nov;10(6):1327–42.
  • Фигге Дж., Смит Т.Ф. Мотив последовательности деления клеток. Nature 334 (6178), 109 (14 июля 1988 г.) |pmid=3290690 |doi=10.1038/334109a0.

Награды и почести

В 2009 году Международное общество вычислительной биологии наградило Смита премией ISCB Senior Scientist Award [1] и избрало его членом ISCB . [2]

В 2002 году он был принят в Американский институт медицинской и биологической инженерии (AIMBE) «за выдающийся вклад в определение и развитие области биоинформатики с упором на новые инженерные методы прогнозирования структуры и функции белков». [ необходима ссылка ]

Ссылки

  1. ^ ab Maisel, M. (2007). "ISCB Honors Temple F. Smith and Eran Segal". PLOS Computational Biology . 3 (6): e128. Bibcode : 2007PLSCB...3..128M. doi : 10.1371/journal.pcbi.0030128 . PMC  1904388. PMID  17604447 .
  2. ^ ab "ISCB Fellows". iscb.org . Международное общество вычислительной биологии . 2017. Архивировано из оригинала 2017-03-20.
  3. ^ abc Smith, T.; Waterman, MS (1981). «Идентификация общих молекулярных подпоследовательностей». Журнал молекулярной биологии . 147 (1): 195– 197. CiteSeerX 10.1.1.63.2897 . doi :10.1016/0022-2836(81)90087-5. PMID  7265238. 
  4. ^ ab "Исследовательский центр биомолекулярной инженерии | Бостонский университет". Bmerc-www.bu.edu . Получено 24.03.2017 .
  5. ^ "Temple Smith". Архивировано из оригинала 2007-07-07 . Получено 2007-05-03 .
  6. ^ Смит, Темпл Феррис (1969). Амплитуды дейтрона из теории ядерного рассеяния составных частиц (диссертация). Университет Колорадо в Боулдере. OCLC  50252533. ProQuest  302393082.
  7. ^ "Temple F. Smith, Ph.D. » Микробиология » BUMC". Архивировано из оригинала 2012-04-04 . Получено 2011-10-28 .
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Temple_F._Smith&oldid=1264998075"