Pospiviroidae
| Pospiviroidae | |
|---|---|
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вироид |
| Семья: | Pospiviroidae |
| Генера | |
Pospiviroidae [1] — это incertae sedis семейство одноцепочечных РНК- вироидов с 5 родами и 39 видами , включая первый обнаруженный вироид PSTVd , который является частью рода Pospiviroid . [2] Их вторичная структура является ключом к их биологической активности . Классификация этого семейства основана на различиях в последовательности консервативной центральной области. [3] Репликация Pospiviroidae происходит асимметрично через РНК-полимеразу клетки-хозяина , РНКазу и РНК-лигазу . Их хозяевами являются растения , в частности двудольные и некоторые однодольные . Тяжесть инфекции может варьироваться от отсутствия эффекта до разрушительного и широко распространенного ущерба популяции. Это также может зависеть от комбинации вирус-хозяин. [4]
Геном
Члены семейства Pospiviroidae имеют кольцевую одноцепочечную РНК из 246–375 нт. Они принимают стержневидную или квазистержневидную конформацию, содержащую центральную консервативную область (CCR) и концевую консервативную шпильку (TCH) или концевую консервативную область (TCR). Геном вироидов не кодирует никаких белков. [5]
Репликация
 | Этот раздел может быть слишком техническим для понимания большинства читателей . ( Август 2023 ) |
Его репликация является ядерной и опосредована ДНК-зависимой РНК-полимеразой II, которая перенаправляется на использование РНК-шаблонов через асимметричный механизм катящегося кольца РНК–РНК. Молекулы кольцевой РНК с (+) полярностью (по соглашению самая распространенная цепь in vivo ) многократно транскрибируются в олигомерные комплементарные (−) РНК. Такие промежуточные продукты служат матрицами для получения олигомерных (+) РНК, которые расщепляются ферментом хозяина класса РНКазы III. Концы полученных линейных мономеров лигируются ДНК-лигазой хозяина 1 для получения зрелой кольцевой вироидной РНК. [5]
Таксономия
- вироид яблочной ямочки
- вироид кожи шрамов яблок
- Апскавироид aclsvd
- Апскавироид cvd-VII
- Апскавироид dvd
- Апскавироид glvd
- Апскавироид lvd
- Апскавироид plvd-I
- Апскавироид pvd
- Апскавироид pvd-2
- австралийский вироид винограда
- Вироид полегания листьев цитрусовых
- Вироид, вызывающий карликовость цитрусовых
- Цитрусовый вироид V
- Цитрусовый вироид VI
- Вироид желтой пятнистости винограда 1
- Вироид желтой пятнистости винограда 2
- Вироид пузырчатого рака груши
- Вироид растрескивания коры цитрусовых
- Кокосовый каданг-каданг вироид
- Вироид кокосовой тинангаджи
- латентный вироид хмеля
- Coleus blumei вироид 1
- Coleus blumei вироид 2
- Coleus blumei вироид 3
- Колевироид cbvd-5
- Колевироид cbvd-6
- Далия латентный вироид
- Вироид трюка хопа
- Вироид хризантемовой карликовости
- Вироид экзокортиса цитрусовых
- Columnea латентный вироид
- Ирезиновый вироид 1
- вироид фрукта чата перца
- Поспивироид плвд
- Вироид веретеновидности клубней картофеля
- Вироид апикальной задержки роста томата
- Вироид хлоротической карликовости томата
- вироид томатного растения мачо
Ссылки
- ^ Ди Серио, Ф; Оуэнс, РА; Ли, Сан-Франциско; Матушек, Дж; Паллас, В; Рэндлс, Дж.В.; Сано, Т; Верховен, JTJ; Видалакис, Г; Флорес, Р; Консорциум отчетов ICTV (17 декабря 2020 г.). «Профиль таксономии вируса ICTV: Pospiviroidae». Журнал общей вирусологии . 102 (2). дои : 10.1099/jgv.0.001543 . ПМК 8116940 . ПМИД 33331814.
- ^ "Virus Taxonomy: 2022 Release". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2023 г. Получено 20 августа 2023 г.
- ^ "Отчет ICTV Pospiviroidae" .
- ^ "Семейство: Pospiviroidae | ICTV" . ictv.global . Проверено 9 декабря 2024 г.
- ^ ab Франческо Ди Серио, Роберт А. Оуэнс, Ши-Фанг Ли, Матушек Дж., Паллас В., Джон В. Рэндлс, Сано Т., Якобус Т. Дж. Верховен, Видалакис Г., Флорес Р. (2020). «Профиль таксономии вируса ICTV: Pospiviroidae». Джей Ген Вирол . 102 (2): 001543. doi : 10.1099/jgv.0.001543 . ПМК 8116940 . ПМИД 33331814.
Внешние ссылки
- Отчет ICTV: Pospiviroidae
- Веб-архив – обширная информация о поспивироидах и вироидах.
