Обсуждение:Взаимодействие белок–белок

Задание на курс, спонсируемое Wiki Education Foundation

Эта статья была предметом задания курса, спонсируемого Wiki Education Foundation, с 28 августа 2018 г. по 14 декабря 2018 г. Более подробная информация доступна на странице курса . Редактор(ы)-студенты: 1974manish .

Вышеприведенное недатированное сообщение заменено из задания Template:Dashboard.wikiedu.org от PrimeBOT ( обсуждение ) 02:47, 18 января 2022 (UTC) [ ответить ]

Задание на курс, спонсируемое Wiki Education Foundation

Эта статья является или была предметом задания курса, поддерживаемого Wiki Education Foundation. Более подробная информация доступна на странице курса . Редактор(ы) студента: Jukakim .

Вышеприведенное недатированное сообщение заменено из задания Template:Dashboard.wikiedu.org от PrimeBOT ( обсуждение ) 07:21, 17 января 2022 (UTC) [ ответить ]

Как работает белок-белковое взаимодействие?

Эта статья называется «Взаимодействие белок-белок», но в основном она посвящена тому, как они обнаруживаются. Кто-нибудь знает больше о молекулярных концепциях взаимодействий (типа лейциновой молнии и т. д.)? —Предыдущий неподписанный комментарий, добавленный 134.102.101.48 (обсуждение) 12:10, 18 августа 2009 (UTC) [ ответить ]

Объединить.

Я против объединения этой статьи со статьей о стыковке белок-белок . Стыковка белков — это метод биоинформатики. Взаимодействия белок-белок — наблюдаемое явление. Но эта статья нуждается в расширении.-- Мигель Андраде 15:15, 24 января 2006 (UTC) [ ответить ]

Вы правы, что не объединяются. Однако методы взаимодействия белок-белок включают также моделирование стыковки белков, молекулярную динамику нескольких видов, а также несколько методов теоретического анализа, которые теперь включены в эту запись. Nu 23:57, 26 мая 2009 (UTC) Talk

Bci2:Обсуждение

Объем.

Я думаю, что эта статья должна быть более общей. В настоящее время она сосредоточена на картировании сетей белок-белкового взаимодействия. Белок-белковое взаимодействие также важно в структурной биохимии. Например, я считаю, что физико-химические механизмы (т. е. межмолекулярные силы) будут здесь интересны. Хендрик Фусс 09:34, 6 мая 2007 (UTC) [ ответить ]

Согласовано. Такие изменения были внесены.

Bci2 26 мая 2009 г.,Nu 00:17, 27 мая 2009 г. (UTC) [ ответить ]

Сугияма.

Я не думаю, что Sugiyama (алгоритм макета) принудительно направлен. Может кто-нибудь проверить и отредактировать? — Предыдущий неподписанный комментарий добавлен 65.207.2.2 ( обсуждениевклад ) 2007-08-13T17:01:46

Рентгеновская кристаллография и ЯМР.

По моему мнению, в этой части все еще не хватает информации о рентгеновской кристаллографии и ЯМР, которые являются методами изучения белок-белковых взаимодействий. Я не уверен, можно ли назвать это методами обнаружения, потому что они более полезны для изучения деталей взаимодействия. Может быть, ссылки на эту тему будет достаточно? Привет, Сандра — Предыдущий неподписанный комментарий добавлен 132.229.113.29 (обсуждение • вклад ) 2007-10-05t13:33:14z

Согласовано: Методы ЯМР были специально включены. Bci2Nu 00:18, 27 мая 2009 (UTC) BCi2 , 2009 Bci2

Внешние ссылки.

Я хотел бы поделиться с пользователями ссылкой на бесплатный доступ к действующей в течение 7 дней базе знаний о взаимодействии белков. Пожалуйста, сообщите мне об этом. —Предыдущий неподписанный комментарий добавлен Jkbioinfo ( обсуждениевклад ) 2007-11-05t12:12:28z

Опубликуйте ссылку здесь, и если редакторы этой статьи сочтут ее полезной, они смогут ее добавить. -- Жандре , 2007-11-11 t 10:07z

Белковые микрочипы

Я считаю, что белковые микрочипы являются способом определения белок-белковых взаимодействий и должны быть добавлены в список. --ZareliMan (обс.) 23:03, 22 июня 2008 (UTC) [ ответить ]

Я согласен, что технология белкового массива, например, программируемого белкового массива нуклеиновой кислоты (NAPPA), должна быть добавлена ​​в список методов взаимодействия белок-белок. Этот метод имеет преимущество в обходе процедуры очистки белка, которая требует много времени и денег, и большое количество белка может быть идентифицировано в одной реакции. 1974manish ( talk ) 14:40, 29 ноября 2018 (UTC) [ ответить ]

дифференциация

По моему мнению, следует различать методы, позволяющие изучать специфические взаимодействия (например, с антителами, где необходимо определить их цель), и методы поиска неизвестных/потенциальных взаимодействий белков. —Предыдущий неподписанный комментарий добавлен 153.19.202.101 (обсуждение) 17:11, 22 июня 2010 (UTC) [ ответить ]

Золотой стандарт? прямые белок-белковые взаимодействия

В статье говорится: Коиммунопреципитация считается золотым стандартом анализа белок-белковых взаимодействий... Однако далее в абзаце говорится: Предостережение также заключается в том, что эксперименты по иммунопреципитации выявляют прямые и косвенные взаимодействия. Таким образом, положительные результаты могут указывать на то, что два белка взаимодействуют напрямую или могут взаимодействовать через одну или несколько мостиковых молекул. Поэтому, хотя это может быть надежным для обнаружения взаимодействий, это не является надежным указанием на прямое взаимодействие. Возможно, статья могла бы быть более ясной относительно того, как идентифицировать прямые белок-белковые взаимодействия. pgr94 ( talk ) 09:32, 25 июля 2010 (UTC) [ reply ]

Терапевтика

Молекулы, которые нарушают белок-белковые взаимодействия, имеют терапевтическое применение. Было бы неплохо добавить новый раздел в эту статью по этой теме. Вот пара статей, которые, похоже, могли бы стать хорошей отправной точкой, хотя они немного устарели.

  • Arkin MR, Wells JA (2004). «Низкомолекулярные ингибиторы белок-белковых взаимодействий: прогресс на пути к мечте». Nat Rev Drug Discov . 3 (4): 301–17 . doi :10.1038/nrd1343. PMID  15060526. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |month=проигнорирован ( помощь )
  • Аркин М (2005). «Взаимодействие белок-белок и рак: малые молекулы, идущие на убийство». Curr Opin Chem Biol . 9 (3): 317–24 . doi :10.1016/j.cbpa.2005.03.001. PMID  15939335. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |month=проигнорирован ( помощь )

Есть ли добровольцы? Alexbateman ( обсуждение ) 11:08, 8 августа 2010 (UTC) [ ответить ]

Оценка

Эта статья получила оценку WP:Good Article . Просмотр WP:Assessment показал, что она слишком высока, поскольку в статье все еще есть ряд проблем, которые нужно решить. Есть некоторый существенный контент, особенно по методам обнаружения PPI, но есть важные области, которые отсутствуют, поэтому я думаю, что C-класс разумен. Alexbateman ( talk ) 11:21, 8 августа 2010 (UTC) [ ответить ]

Похоже, эта статья была повышена до GA в мае 2009 года без номинации и рецензирования (см. разницу). Учитывая это, я думаю, что ваше краткое понижение статьи было уместным. Однако, пожалуйста, учтите, что более формальная переоценка хорошей статьи должна быть завершена до понижения статей, которые законно получили статус GA. Emw ( talk ) 13:44, 8 августа 2010 (UTC) [ ответить ]
Спасибо за указание правильной процедуры! WP:Оценка — это новая для меня область. Alexbateman ( обсуждение ) 12:55, 9 августа 2010 (UTC) [ ответить ]

Предложение по слиянию

Я бы предложил объединить статью о комплексе Multiprotein с этой статьей. Текущее содержание двух статей не полностью совпадает, но, по моему мнению, они представляют собой одно и то же с двух разных точек зрения. Alexbateman ( talk ) 10:40, 22 августа 2012 (UTC) [ ответить ]

Алекс, я не сторонник слияния на данном этапе, но я полностью согласен, что избыточность должна быть удалена или уменьшена. Существуют определенные свойства комплексов, которые имеют мало общего с PPI, наиболее важным является тот факт, что PPI часто неизвестны внутри комплекса. Ни одна из статей не очень хорошо проработана, поэтому необходимо больше информации по обеим. Я предлагаю снова поднять предложение о слиянии, как только будет больше данных. Peteruetz ( обсуждение ) 18:35, 11 июля 2013 (UTC) [ ответить ]

Редактирование

Я редактирую эту тему и прочитал все предложения, которые уже были сделаны. На самом деле, есть некоторые отсутствующие материалы... Поэтому я думаю о: - немного изменить введение и включить некоторые последствия, которые возникают из-за аберрантных белок-белковых взаимодействий; - ввести "классы белок-белковых взаимодействий" (гомо-олигомеры и гетеро-олигомеры); - ввести "структурные домены, вовлеченные в белок-белковые взаимодействия" (SH2, SH3, PDZ, LIM и т. д.); - ввести "характеристику белок-белковых интерфейсов"; - ввести "факторы, которые регулируют белок-белковую ассоциацию"; - завершить методы изучения белок-белковых взаимодействий; - добавить тему о "белок-белковых сетях", которая включает разделы "визуализация сетей" и "коллекции баз данных" и дополнительную информацию; - добавить заключительный раздел о важности изучения белок-белковых взаимодействий (цели лекарственных препаратов). --JulianaCF ( обсуждение ) 19:56, 19 декабря 2013 (UTC) [ ответ ]

Привет. Мне все это кажется хорошими предложениями. Спасибо за вклад! Alexbateman ( обсуждение ) 20:47, 6 января 2014 (UTC) [ ответить ]

Оценка комментария

Комментарии ниже изначально были оставлены на Talk:Protein–protein interaction/Comments и размещены здесь для потомков. После нескольких обсуждений в прошлые годы эти подстраницы теперь устарели. Комментарии могут быть неактуальными или устаревшими; если это так, пожалуйста, не стесняйтесь удалить этот раздел.

Изменил оценку на "высокую", так как это обзор взаимодействия белок-белок. Статью необходимо расширить, включив разделы об общих доменах взаимодействия, биологической значимости, например, гомо- и гетеродимерном образовании факторов транскрипции и т. д. - tameeria 22:27, 18 февраля 2007 (UTC) [ ответить ]

Последнее изменение: 01:47, 1 января 2012 (UTC). Заменено: 03:29, 30 апреля 2016 (UTC)

Технология белкового массива, программируемого нуклеиновыми кислотами (NAPPA)

Взаимодействие белков с белками Критика Википедии взаимодействия белков с белками для написания курса, осень 2018 г. Статья, над которой я решил поработать, хорошая, но я обнаружил, что в ней отсутствуют последние методы определения взаимодействия белков с белками. Информация, упомянутая в этой статье, ясна и охватывает все смежные области. Раздел методов охватывает только традиционный метод, но мы можем включить новый и эффективный метод, такой как технология программируемой нуклеиновой кислотой белковой матрицы (NAPPA), и мы можем добавить изображение, преимущества и ограничения этого метода. Информация в статье взята из большого количества источников, и большинство исходных статей взяты из рецензируемых статей, таких как передовая молекулярная и клеточная биология, Plos, Nature. В этой статье новый метод, такой как белковая матрица (технология NAPPA), включен только в подзаголовок другие методы белков, но я думаю, что его следует включить в качестве основного метода вместе с другими методами. 1974manish ( обсуждение ) 14:39, 29 ноября 2018 (UTC) [ ответить ]

Фазовые переходы

Я хотел бы написать раздел о том, как белок-белковые взаимодействия играют важную роль в физическом состоянии раствора белков. А именно, смешиваемость некоторых белков зависит от концентрации, что приводит к разделению фаз при определенных концентрациях. Я быстро найду несколько обзорных статей по этой теме и начну, если только у кого-то нет серьезных опасений.

Приветствую, Malnu ( обсуждение ) Malnu ( обсуждение ) 14:17, 12 февраля 2024 (UTC) [ ответить ]

Мембранный транспорт: источник

Здравствуйте. Я видел в этой статье, что требуется источник, чтобы утверждать, что белки могут переноситься другими белками, например, когда один из цитоплазмы транслоцируется в ядро.

«Белок может переносить другой белок (например, из цитоплазмы в ядро ​​или наоборот в случае импортинов ядерной поры ). [ необходима цитата ] »

Об этом говорится в 12-й главе «Внутриклеточная организация и сортировка белков» и в разделе 6 «Транспорт в ядро ​​и из ядра» главы 13 «Перемещение белков в мембраны и органеллы» книги Альберта и соавторов («Молекулярная биология клетки», 7-е издание) и книги Лодиша и соавторов («Молекулярная биология клетки», 8-е издание).

Предлагаю либо удалить требуемую ссылку, либо добавить один из этих источников. Itawewhr (обсуждение) 20:34, 6 марта 2024 (UTC) [ ответить ]

Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Talk:Protein–protein_interaction&oldid=1212237165"