Обсуждение:Малатдегидрогеназа
 | Эта статья имеет рейтинг Start-class по шкале оценки контента Википедии . Она представляет интерес для следующих WikiProjects : | ||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||
Задание на курс, спонсируемое Wiki Education Foundation
Эта статья является или была предметом задания курса, поддерживаемого Wiki Education Foundation. Более подробная информация доступна на странице курса . Редактор(ы) студентов: KevinHuai . Рецензенты: Marissaogata .
Вышеприведенное недатированное сообщение заменено из задания Template:Dashboard.wikiedu.org от PrimeBOT ( обсуждение ) 03:10, 17 января 2022 (UTC)
Аллостерическая регуляция и равновесие
Из статьи:
«Поскольку малатдегидрогеназа тесно связана с циклом лимонной кислоты, регуляция в значительной степени зависит от продуктов TCA. Высокие концентрации малата стимулируют активность MDH, и, наоборот, высокие концентрации оксалоацетата ингибируют фермент[11]. Цитрат может как аллостерически активировать, так и ингибировать ферментативную активность MDH. Он ингибирует окисление малата при низких уровнях малата и NAD+. Однако при высоких уровнях малата и NAD+ цитрат может стимулировать выработку оксалоацетата. Считается, что на ферменте есть аллостерический регуляторный участок, с которым цитрат может связываться и направлять равновесие реакции в любом направлении[12]. »
Направление реакции регулируется константой равновесия, которая в свою очередь является функцией стандартного изменения свободной энергии ΔG°'. Аллостерическая регуляция или отсутствие аллостерической регуляции, ферменты могут изменять скорость реакции, но не могут изменить чистое направление реакции. (А. Фершт, Структура и механизм в науке о белках , Freeman 3-е изд. 1999, начало с. 118). Изменение направления в этом случае является функцией концентраций малата и НАД + , а не аллостерической регуляции. 96.54.32.44 ( talk ) 06:23, 1 марта 2011 (UTC)
Неправильно использовать слово равновесие в этом процессе. Имеется в виду, что компоненты находятся в устойчивом состоянии, весьма вероятно, далеком от равновесия, и движутся в определенном направлении постоянным поступлением пирувата. Как и в любой реакции, катализируемой ферментом, справедливо предположить, что начальное связывание происходит быстро и близко к равновесию, но по мере отвода продуктов равновесие нарушается, и реакция развивается в определенном направлении. Весь цикл далек от равновесия, но в устойчивом состоянии пируват постоянно поступает в цикл, а продукты (углекислый газ) непрерывно удаляются. Скорость вращения цикла, возможно, можно принять за показатель меры расстояния от точки равновесия. Помните, что весь цикл действует как гигантский катализатор (и это справедливо для всех циклических реакций). chami 19:06, 8 февраля 2012 (UTC) — Предыдущий комментарий без подписи добавлен Ck.mitra ( talk • contribs )
Схема малатдегидрогеназы
Механизм действия малатдегидрогеназы зависит от pH
Взаимодействие малатдегидрогеназы с субстратом опосредовано и зависит от уровня pH. Когда малатдегидрогеназа связывается с оксалоацетатом и коферментами для формирования комплекса, требуется более высокий pH. Образование комплекса MDH-NADH со связыванием L-малата требует более высокого pH и гистидиновой части на MDH. В частности, протонированный гистидин может образовывать водородную связь с карбонильным кислородом субстрата, что смещает электронную плотность от кислорода и делает его более восприимчивым к нуклеофильной атаке гидрида. В результате непротонированная форма комплекса MDH-NADH более благоприятно связывается с L-малатом. Напротив, связывание D-малата и гидроксималоната с комплексом MDH-NADH требует более низкого pH. Кроме того, протонированная форма комплекса MDH-NADH имеет более высокое сродство к D-малату и гидроксималонату. [1]
Более подробный механизм действия малатдегидрогеназы
Субстат малат ориентирован на активный сайт малатдегидрогеназы таким образом, что водородная связь между атомом кислорода карбоксилата малата и функциональными группами гуанидиния на боковых цепях Arg-81 и Arg-153 на MDH помогает стабилизировать и облегчить перенос протона и гидрида между субстратом и ферментом. Эти водородные связи остаются постоянными на протяжении всего процесса. Каталитический механизм описывается как последовательный, при этом перенос протона от малата к малатдегидрогеназе происходит до переноса гидрида от малата к NAD+, что приводит к образованию NADH. [8]
Малат + НАД -> НАДН + оксалоацетат
Более подробная информация о регуляции малатдегидрогеназы
Было показано, что глутамат ингибирует активность малатдегидрогеназы. Кроме того, было показано, что альфа-кетоглутаратдегидрогеназа может взаимодействовать с митохондриальной аспартатаминотрансферазой, образуя комплекс, который затем может связываться с малатдегидрогеназой, образуя тройной комплекс, который отменяет ингибирующее действие глутамата на ферментативную активность малатдегидрогеназы. [6]Кроме того, образование этого комплекса позволяет глутамату реагировать с аминотрансферазой, не мешая активности малатдегидрогеназы. Было показано, что связывание малатдегидрогеназы увеличивает скорость реакции, поскольку Km малатдегидрогеназы уменьшается при связывании в составе этого комплекса. — Предыдущий неподписанный комментарий добавлен KevinHuai ( обсуждение • вклад ) 23:57, 14 февраля 2017 (UTC)
