Обсуждение:FASTA

Эта статья имеет рейтинг B-класса по шкале оценки контента Википедии . Она представляет интерес для следующих WikiProjects :

Молекулярная биология : MCB / COMPBIO This article is within the scope of WikiProject Molecular Biology, a collaborative effort to improve the coverage of Molecular Biology on Wikipedia. If you would like to participate, please visit the project page, where you can join the discussion and see a list of open tasks.Molecular BiologyWikipedia:WikiProject Molecular BiologyTemplate:WikiProject Molecular BiologyMolecular Biology ??? This article has not yet received a rating on the importance scale. This article is supported by the Molecular and Cell Biology task force (assessed as Low-importance). This article is supported by the Computational Biology task force (assessed as High-importance).

Tip: Anchors are case-sensitive in most browsers. This article contains broken links to one or more target anchors: [[Sequence alignment#Local alignment|local sequence alignment]] The anchor (#Local alignment) has been deleted by other users before. The anchors may have been removed, renamed, or are no longer valid. Please fix them by following the link above, checking the page history of the target pages, or updating the links. Remove this template after the problem is fixed | Report an error

"elephas maximus maximus" на самом деле должен иметь скобки по обеим сторонам, но я не могу понять, как это сделать, оставив внутреннюю ссылку. Если кто-то знает, как, пожалуйста, сделайте это. Turnstep

Готово. Не уверен, что я правильно использовал теги "nowiki", но это работает. Isoxyl 20:59, 26 сентября 2005 (UTC) [ ответить ]

Выглядит хорошо, спасибо. Turnstep 21:22, 26 сентября 2005 (UTC) [ ответить ]

У меня есть фотография, защищенная авторским правом. Ожидаю разрешения, прежде чем я ее добавлю... весь этот процесс лучше объясняется ею.

hydkat 17:11, 20 января 2006 (UTC) [ ответить ]

==Копилефт ;)==

Проблема устранена.

hydkat 18:28, 20 января 2006 (UTC) [ ответить ]

удален mGen - он не имеет отношения к fasta.

hydkat 05:55, 23 января 2006 (UTC) [ ответить ]

На странице написано: FASTA произносится как "ФАСТ-Айе"

Это подводит нас к вопросу: «Как произносится слово Aye?»

Чаще всего произносится как «eye», как в военно-морском выражении Aye-Aye, но, полагаю, может ли оно звучать как заглавная буква A! Ни то, ни другое не соответствует тому, как fasta произносится здесь. —Предыдущий неподписанный комментарий добавлен 131.111.85.79 ( обсуждение • вклад ) 21:30, 1 ноября 2006 г.

Вероятно, он произносится как « А », потому что он является преемником « FAST-P » и « FAST-N » — h y dka t 11:31, 4 декабря 2006 (UTC) [ ответить ]

Наши исследователи говорят, что это либо FAST-A (длинная A), либо FASTA (рифмуется с shasta, для тех, кто помнит) — Предыдущий неподписанный комментарий добавлен 137.110.118.175 (обс.) 00:25, 10 января 2008 (UTC)[ отвечать ]

Когда я впервые узнал об этом, это был FAST(long A), но в то время FASTP и FASTN все еще были вокруг, а BLAST все еще находился в разработке. История, возможно, уже забыта. Gah4 ( talk ) 21:53, 18 сентября 2015 (UTC) [ ответить ]

это можно спутать с форматом файла FASTA (*.fasta) — Предыдущий неподписанный комментарий добавлен Fedra ( обсуждение • вклад ) 19:37, 16 июля 2008 (UTC) [ ответить ]

Если никто не возражает, я собираюсь разместить одну из этих "Вы можете искать.." вверху для людей, которые искали формат файла FASTA. Я попадал сюда несколько раз, ища формат файла, и только после прочтения большой части этой статьи понял, что есть отдельная статья.

И я бы поставил на многое, что большинство людей, которые сюда приходят, искали этот формат файла. После многих лет в разных классах и исследовательских лабораториях я увидел, что все знают о формате файла, и все называют его "FASTA" или "формат FASTA". И я никогда не слышал, чтобы кто-то упоминал этот программный пакет. В заключение, я думаю, что нам нужно уведомление, и также очень интересно узнать об истории формата!

Вот что я выложу, если нет возражений:

-- Qwerty0 ( обсуждение ) 05:43, 12 октября 2010 (UTC) [ ответить ]

В статье упоминается FASTP, а затем переход к FASTA, но FASTA объединяла FASTP и FASTN в одну программу. Когда был FASTN, и можно ли это включить в статью? Gah4 ( talk ) 23:37, 17 апреля 2017 (UTC) [ ответить ]

Уважаемый редактор, недавнее добавление TREE2FASTA в раздел «Процесс» неуместно, поскольку оно не относится к программе FASTA. См. выше раздел «Путаница с форматом файла FASTA». TREE2FASTA не полагается на программу FASTA, а на формат FASTA . Это утилита скрипта perl для быстрой сортировки данных последовательностей в формате FASTA из исследовательских деревьев. TREE2FASTA позволяет пользователям быстро выбирать интересующие их последовательности из пула исходных последовательностей с помощью раскрашивания/аннотирования на дереве.

TREE2FASTA можно добавить на страницу википедии о формате FASTA https://en.wikipedia.org/wiki/FASTA_format На этой странице можно создать новый раздел под названием «Сортировка файлов FASTA» для описания различных возможных способов/программ сортировки интересующих последовательностей. TREE2FASTA представляет собой инструмент для этого среди других возможных программ, но TREE2FASTA представляет собой улучшение, позволяя сортировать посредством визуализации на дереве, в то время как другие программы работают только с входными списками заголовков последовательностей.

Пожалуйста, посоветуйте, как можно помочь оформить соответствующий абзац, если интересно создать такой раздел на странице Википедии в формате FASTA.

Спасибо — Предыдущий неподписанный комментарий добавлен 160.111.254.17 ( обсуждение )

Пожалуйста, укажите:

1. Куда следует перенести недавнее добавление tree2fasta в разделе «Процессы» ?
2. Если раздел «Сортировка» создан, что в нем должно быть указано, как это должно быть указано и кто будет на него ссылаться.
3. Каким образом будет осуществляться сортировка путем раскрашивания последовательностей на дереве или путем их аннотирования, и почему сортировка таким образом будет улучшением?

Пожалуйста, дайте совет. SPINTENDO 14:32, 1 мая 2018 (UTC) [ ответить ]           

Как бы это ни было сделано, это должно быть обсуждено на этой странице. Gah4 ( обсуждение ) 14:58, 2 мая 2018 (UTC) [ ответить ]