тРНК нуклеотидилтрансфераза
| тРНК нуклеотидилтрансфераза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 РНКаза PH гексамер, Pseudomonas aeruginosa | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 2.7.7.56 | ||||||||
| Номер CAS | 116412-36-3 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| ИнтЭнз | IntEnz вид | ||||||||
| БРЕНДА | запись BRENDA | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme вид | ||||||||
| КЕГГ | запись KEGG | ||||||||
| МетаЦик | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
В энзимологии тРНК -нуклеотидилтрансфераза ( КФ 2.7.7.56) — это фермент , катализирующий химическую реакцию
- тРНК n+1 + фосфат тРНК n + нуклеозиддифосфат
где тРНК-N является продуктом транскрипции, а тРНК-нуклеотидилтрансфераза катализирует это присоединение цитидина-цитидина-аденозина (CCA) с образованием продукта тРНК-NCCA.
Функция
Синтез белка происходит в цитозольных рибосомах , митохондриях (миторибосомах), а у растений — в пластидах (хлоропластных рибосомах). Каждому из этих отсеков требуется полный набор функциональных тРНК для осуществления синтеза белка. Производство зрелых тРНК требует этапов обработки и модификации [1], таких как добавление 3'-концевого цитидина-цитидина-аденозина (CCA). Поскольку ни один из генов растительных тРНК не кодирует эту конкретную последовательность, нуклеотидилтрансфераза тРНК должна добавлять эту последовательность посттранскрипционно и, следовательно, присутствовать во всех трех отсеках.
У эукариот множественные формы тРНК нуклеотидилтрансфераз синтезируются из одного гена и распределяются по разным субклеточным компартментам в клетке. Существует несколько стартовых кодонов в рамке считывания, которые позволяют производить вариантные формы фермента, содержащие различную целевую информацию, преимущественно находящуюся в N-концевой последовательности белка (ссылка). Эксперименты in vivo показывают, что N-концевые последовательности используются в качестве транзитных пептидов для импорта в митохондрии и пластиды. Сравнительные исследования с использованием доступных последовательностей тРНК нуклеотидилтрансфераз выявили один ген, кодирующий этот фермент в растениях. Исследования комплементации в дрожжах с использованием кДНК, полученной из генов Arabidopsis thaliana [2] или Lupinus albus [3], демонстрируют биологическую активность этих ферментов. Также было показано, что фермент восстанавливает поврежденные или неполные последовательности CCA в дрожжах. [4]
Этот фермент относится к семейству трансфераз , а именно тех, которые переносят фосфорсодержащие нуклеотидные группы ( нуклеотидилтрансферазы ).
Ссылки
- ^ Hopper AK, Phizicky EM (январь 2003 г.). «tRNA transfers to the limelight». Genes Dev . 17 (2): 162–80. doi : 10.1101/gad.1049103 . PMID 12533506.
- ^ Gu J (2000). Идентификация белков, взаимодействующих с нуклеотидилтрансферазой тРНК люпина и Arabidopsis (магистр наук). Университет Конкордия, Канада. С. 51–55.
- ^ Shanmugam K, Hanic-Joyce PJ, Joyce PB (январь 1996 г.). «Очистка и характеристика тРНК-нуклеотидилтрансферазы из Lupinus albus и функциональная комплементация мутации дрожжей соответствующей кДНК». Plant Mol. Biol . 30 (2): 281–95. doi :10.1007/bf00020114. PMID 8616252. S2CID 8120292.
- ^ Россет Р., Монье Р. (ноябрь 1965 г.). "[Нестабильность терминальной 3'-гидроксильной последовательности транспортной РНК у микроорганизмов. I. Оборот терминального AMP у Saccharomyces cerevisiae]". Biochim. Biophys. Acta (на французском). 108 (3): 376–84. doi :10.1016/0005-2787(65)90030-4. PMID 4286478.
Дальнейшее чтение
- Cudny H, Deutscher MP (1988). «3'-процессинг предшественников тРНК в Escherichia coli с дефицитом рибонуклеазы. Разработка и характеристика системы процессинга in vitro и доказательства необходимости фосфата». J. Biol. Chem . 263 (3): 1518–23. doi : 10.1016/S0021-9258(19)57334-3 . PMID 3275667.
- Deutscher MP, Marshall GT, Cudny H (1988). «РНКаза PH: фосфат-зависимая нуклеаза Escherichia coli, отличная от полинуклеотидфосфорилазы». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 85 (13): 4710–14. Bibcode :1988PNAS...85.4710D. doi : 10.1073/pnas.85.13.4710 . PMC 280505 . PMID 2455297.
