Транспортин-3

ТНПО3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	4C0O, 4C0P, 4C0Q, 4OL0
Идентификаторы
Псевдонимы	TNPO3 , IPO12, LGMD1F, MTR10A, TRN-SR, TRN-SR2, TRNSR, транспортин 3, LGMDD2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 610032; МГИ : 1196412; гомологен : 40848; Генные карты : TNPO3; ОМА :TNPO3 - ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 7 (человек)
Конец	129,055,173 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 6 (мышь)
Конец	29,609,886 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	вторичный ооцит; ; сухожилие двуглавой мышцы плеча; ; внутренний бледный шар; ; pars reticulata; ; pars compacta; ; латеральная группа ядер таламуса; ; внешний бледный шар; ; обонятельная луковица; ; дорсальное двигательное ядро блуждающего нерва; ; бета-клетка;
	Верх выражен в
	эпибласт; ; верхнечелюстной выступ; ; выступ нижней челюсти; ; сперматоцит; ; Эпителий подвздошной кишки; ; желудочковая зона; ; Ростральный миграционный поток; ; хвост эмбриона; ; эпителий хрусталика; ; почечное тельце;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ; ; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	ядерная локализация последовательность связывания; связывание белков; идентичное связывание белков; сигнальная активность рецептора; активность рецептора сигнала ядерного импорта;
Клеточный компонент	цитоплазма; ядерная мембрана; внутриклеточная мембранно-связанная органелла; ядро;
Биологический процесс	транспорт белков; передача сигнала; импорт белка в ядро; транспорт;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	23534
	320938
	ENSG00000064419
	ENSMUSG00000012535
	Q9Y5L0
	Q6P2B1
	NM_001191028 ; NM_012470
	НМ_177296 ; НМ_001347079 ; НМ_001361290
NP_001177957 ; NP_036602 ; NP_001369145 ; NP_001369146 ; NP_001369147;
	NP_001369148 ; NP_001369149 ; NP_001369150 ; NP_001369151 ; NP_001369152 ; NP_036602.1
	НП_001334008 ; НП_796270 ; НП_001348219
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Транспортин-3 — это белок , который у людей кодируется геном TNPO3 . [ ^5]^[6]^[7]

Функция

TNPO3 — это ядерный импортный рецептор для белков, богатых серином/аргинином (SR), включая фактор сплайсинга 1, богатый серином/аргинином , которые являются важными факторами сплайсинга мРНК- предшественников . ^[5]^[7]

Клиническое значение

Локус TNPO3-IRF5 участвует в первичном билиарном циррозе и системной склеродермии . ^[8]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000064419 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000012535 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab Kataoka N, Bachorik JL, Dreyfuss G (июль 1999). "Транспортин-SR, ядерный импортный рецептор для белков SR". J Cell Biol . 145 (6): 1145–52 . doi :10.1083/jcb.145.6.1145. PMC 2133142. PMID 10366588 .
^ Lai MC, Lin RI, Huang SY, Tsai CW, Tarn WY (апрель 2000 г.). «Человеческий белок семейства импортина-бета, транспортин-SR2, взаимодействует с фосфорилированным доменом RS белков SR». J Biol Chem . 275 (11): 7950– 7. doi : 10.1074/jbc.275.11.7950 . PMID 10713112.
^ ab «Ген Энтрез: транспортин 3 TNPO3» .
^ Radstake TR, Gorlova O, Rueda B, et al. (Май 2010). «Genome-wide association study of systemic sclerosis identifys CD247 as a new susceptibility locus». Nat. Genet . 42 (5): 426– 9. doi :10.1038/ng.565. PMC 2861917. PMID 20383147 .

Дальнейшее чтение

Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K и др. (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Lai MC, Lin RI, Tarn WY (2001). «Транспортин-SR2 опосредует ядерный импорт фосфорилированных белков SR». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (18): 10154– 9. doi : 10.1073/pnas.181354098 . PMC 56931 . PMID 11517331.
Allemand E, Dokudovskaya S, Bordonné R, Tazi J (2003). "Консервативный белок Drosophila transportin-serine/arginine-rich (SR) допускает ядерный импорт факторов сплайсинга белка Drosophila SR и их антагониста-репрессора фактора сплайсинга 1". Mol. Biol. Cell . 13 (7): 2436– 47. doi :10.1091/mbc.E02-02-0102. PMC 117325 . PMID 12134081.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR и др. (2003). «Человеческая хромосома 7: последовательность ДНК и биология». Science . 300 (5620): 767– 72. Bibcode :2003Sci...300..767S. doi :10.1126/science.1083423. PMC 2882961 . PMID 12690205.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Colland F, Jacq X, Trouplin V и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res . 14 (7): 1324– 32. doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Tsang HT, Connell JW, Brown SE и др. (2006). «Систематический анализ взаимодействий белков CHMP человека: дополнительные белки, содержащие домен MIT, связываются с несколькими компонентами комплекса ESCRT III человека». Genomics . 88 (3): 333– 46. doi : 10.1016/j.ygeno.2006.04.003 . PMID 16730941.
Ewing RM, Chu P, Elisma F и др. (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948 . PMID 17353931.

Эта статья о гене на человеческой хромосоме 7 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000064419 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000012535 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10366588-5] Kataoka N, Bachorik JL, Dreyfuss G (июль 1999). "Транспортин-SR, ядерный импортный рецептор для белков SR". J Cell Biol . 145 (6): 1145–52 . doi :10.1083/jcb.145.6.1145. PMC 2133142. PMID 10366588 .

[pmid10713112-6] Lai MC, Lin RI, Huang SY, Tsai CW, Tarn WY (апрель 2000 г.). «Человеческий белок семейства импортина-бета, транспортин-SR2, взаимодействует с фосфорилированным доменом RS белков SR». J Biol Chem . 275 (11): 7950– 7. doi : 10.1074/jbc.275.11.7950 . PMID 10713112.

[entrez-7] «Ген Энтрез: транспортин 3 TNPO3» .

[pmid20383147-8] Radstake TR, Gorlova O, Rueda B, et al. (Май 2010). «Genome-wide association study of systemic sclerosis identifys CD247 as a new susceptibility locus». Nat. Genet . 42 (5): 426– 9. doi :10.1038/ng.565. PMC 2861917. PMID 20383147 .