ТАРБП1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ТАРБП1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTARBP1 , TRM3, TRP-185, TRP185, TAR (ВИЧ-1) РНК-связывающий белок 1, TRMT3
Внешние идентификаторыОМИМ : 605052; МГИ : 4936930; гомологен : 38082; GeneCards : TARBP1; OMA :TARBP1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_005646

NM_001159907

RefSeq (белок)

NP_005637

NP_001153379

Местоположение (UCSC)Хр 1: 234.39 – 234.48 МбХр 8: 127.15 – 127.2 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Вероятная метилтрансфераза TARBP1 — это фермент , который у человека кодируется геном TARBP1 . [5] [6]

ВИЧ-1 , возбудитель синдрома приобретенного иммунодефицита (СПИД), содержит геном РНК , который производит хромосомно интегрированную ДНК во время репликативного цикла. Активация экспрессии гена ВИЧ-1 трансактиватором Tat зависит от регуляторного элемента РНК (TAR), расположенного ниже по течению от сайта инициации транскрипции. Этот элемент образует стабильную структуру стебля-петли и может быть связан либо белком, кодируемым этим геном, либо РНК-полимеразой II . Этот белок может действовать, чтобы отсоединить РНК-полимеразу II от TAR во время транскрипционной элонгации . Альтернативно сплайсированные транскрипты этого гена могут существовать, но их полноразмерная природа не была определена. [6]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000059588 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000090290 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Wu F, Garcia J, Sigman D, Gaynor R (декабрь 1991 г.). "tat регулирует связывание трансактивирующего региона вируса иммунодефицита человека с петлесвязывающим белком РНК TRP-185". Genes Dev . 5 (11): 2128– 40. doi : 10.1101/gad.5.11.2128 . PMID  1936997.
  6. ^ ab "Ген Entrez: TARBP1 Tar (ВИЧ-1) РНК-связывающий белок 1".

Дальнейшее чтение

  • Sheline CT, Milocco LH, Jones KA (1992). «Два различных фактора ядерной транскрипции распознают остатки петли и выпуклости шпильки РНК TAR ВИЧ-1». Genes Dev . 5 (12B): 2508– 20. doi : 10.1101/gad.5.12b.2508 . PMID  1752441.
  • Wu-Baer F, Sigman D, Gaynor RB (1995). "Специфическое связывание РНК-полимеразы II с трансактивирующей областью РНК вируса иммунодефицита человека регулируется клеточными кофакторами и Tat". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (16): 7153– 7. Bibcode :1995PNAS...92.7153W. doi : 10.1073/pnas.92.16.7153 . PMC  41297 . PMID  7638159.
  • Wu-Baer F, Lane WS, Gaynor RB (1996). «Идентификация группы клеточных кофакторов, стимулирующих связывание РНК-полимеразы II и TRP-185 с РНК TAR вируса иммунодефицита человека 1». J. Biol. Chem . 271 (8): 4201– 8. doi : 10.1074/jbc.271.8.4201 . PMID  8626763.
  • Wu-Baer F, Lane WS, Gaynor RB (1996). «Клеточный фактор TRP-185 регулирует связывание РНК-полимеразы II с РНК TAR ВИЧ-1». EMBO J . 14 (23): 5995– 6009. doi :10.1002/j.1460-2075.1995.tb00288.x. PMC  394719 . PMID  8846792.
  • Yedavalli VS, Benkirane M, Jeang KT (2003). "Tat и трансактивационно-чувствительная (TAR) РНК-независимая индукция длинного терминального повтора ВИЧ-1 человеческим и мышиным циклином T1 требует Sp1". J. Biol. Chem . 278 (8): 6404– 10. doi : 10.1074/jbc.M209162200 . PMID  12458222.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Gregory SG, Barlow KF, McLay KE и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация человеческой хромосомы 1». Nature . 441 (7091): 315– 21. Bibcode :2006Natur.441..315G. doi : 10.1038/nature04727 . PMID  16710414.


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=TARBP1&oldid=1237069953"