Трансгелин

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ТЭГЛН
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTAGLN , SM22, SMCC, TAGLN1, WS3-10, трансгелин, SM22-альфа
Внешние идентификаторыОМИМ : 600818; МГИ : 106012; гомологен : 2398; GeneCards : ТАГЛН; ОМА :TAGLN - ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_003186
NM_001001522

NM_011526

RefSeq (белок)

NP_001001522
NP_003177

NP_035656

Местоположение (UCSC)Хр 11: 117,2 – 117,21 МбХр 9: 45.84 – 45.85 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Трансгелин — это белок , который у людей кодируется геном TAGLN . [ 5] [6] [7]

Белок, кодируемый этим геном, является трансформирующим и чувствительным к изменению формы актиновым сшивающим/желирующим белком, обнаруженным в фибробластах и ​​гладких мышцах . Его экспрессия снижается во многих клеточных линиях, и эта обратная регуляция может быть ранним и чувствительным маркером начала трансформации. Функциональная роль этого белка неясна. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующих один и тот же белок. [7]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000149591 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000032085 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Kobayashi R, Kubota T, Hidaka H (март 1994). «Очистка, характеристика и частичный анализ последовательности нового 25-кДа актин-связывающего белка из аорты быка: гомолог SM22». Biochem Biophys Res Commun . 198 (3): 1275– 80. doi :10.1006/bbrc.1994.1180. PMID  8117285.
  6. ^ Thweatt R, Lumpkin CK Jr, Goldstein S (октябрь 1992 г.). «Новый ген, кодирующий белок гладких мышц, сверхэкспрессируется в стареющих фибробластах человека». Biochem Biophys Res Commun . 187 (1): 1– 7. doi :10.1016/S0006-291X(05)81449-4. PMID  1520290.
  7. ^ ab «Ген Энтрез: трансгелин TAGLN».

Дальнейшее чтение

  • Nishida W, Kitami Y, Abe M, Hiwada K (1991). «Клонирование гена и нуклеотидная последовательность SM22 alpha из гладкой мышцы куриного желудка». Biochem. Int . 23 (4): 663– 8. PMID  1872880.
  • Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А. и др. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), выведенные с помощью анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» (PDF) . DNA Res . 2 (1): 37– 43. doi : 10.1093/dnares/2.1.37 . PMID  7788527.
  • Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Ли Л., Лю З., Мерсер Б. и др. (1997). «Доказательства регуляторных сетей, опосредованных фактором ответа сыворотки, управляющих транскрипцией SM22alpha в клетках гладких, скелетных и сердечных мышц». Dev. Biol . 187 (2): 311– 21. doi : 10.1006/dbio.1997.8621 . PMID  9242426.
  • Yamamura H, Masuda H, Ikeda W и др. (1997). «Структура и экспрессия гена SM22alpha человека, назначение гена хромосоме 11 и подавление активности промотора метилированием цитозиновой ДНК». J. Biochem . 122 (1): 157– 67. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021722. PMID  9276683.
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K и др. (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
  • Lawson D, Harrison M, Shapland C (1998). «Трансгелин фибробластов и SM22alpha гладких мышц — это один и тот же белок, экспрессия которого подавлена ​​во многих клеточных линиях». Cell Motil. Cytoskeleton . 38 (3): 250– 7. doi :10.1002/(SICI)1097-0169(1997)38:3<250::AID-CM3>3.0.CO;2-9. PMID  9384215.
  • Camoretti-Mercado B, Forsythe SM, LeBeau MM и др. (1998). «Экспрессия и цитогенетическая локализация гена SM22 человека (TAGLN)». Genomics . 49 (3): 452– 7. doi :10.1006/geno.1998.5267. PMID  9615232.
  • Fu Y, Liu HW, Forsythe SM и др. (2001). «Анализ мутагенеза человеческого SM22: характеристика связывания актина». J. Appl. Physiol . 89 (5): 1985– 90. doi :10.1152/jappl.2000.89.5.1985. PMID  11053353. S2CID  1573662.
  • Shields JM, Rogers-Graham K, Der CJ (2002). «Потеря трансгелина в опухолях молочной железы и толстой кишки и в клетках RIE-1 из-за дерегуляции экспрессии генов Ras через Raf-независимые пути». J. Biol. Chem . 277 (12): 9790– 9. doi : 10.1074/jbc.M110086200 . PMID  11773051.
  • Chainiaux F, Magalhaes JP, Eliaers F и др. (2002). «Преждевременное старение диплоидных фибробластов кожи человека, вызванное УФ-B». Int. J. Biochem. Cell Biol . 34 (11): 1331– 9. doi :10.1016/S1357-2725(02)00022-5. PMID  12200029.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Xu R, Ho YS, Ritchie RP, Li L (2003). «Человеческий SM22 альфа BAC охватывает регуляторные последовательности для экспрессии в сосудистых и висцеральных гладких мышцах на стадиях плода и взрослого человека». Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol . 284 (4): H1398–407. doi :10.1152/ajpheart.00737.2002. PMID  12521938.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Yang Z, Chang YJ, Miyamoto H и др. (2007). «Трансгелин действует как супрессор посредством ингибирования трансактивации андрогенных рецепторов, усиленной ARA54, и роста клеток рака простаты». Mol. Endocrinol . 21 (2): 343–58 . doi : 10.1210/me.2006-0104 . PMID  17082327.
  • Liao X, Li S, Lou Z и др. (2007). «Кристаллизация и предварительный кристаллографический анализ трансгелина». Protein Pept. Lett . 14 (2): 209– 11. doi :10.2174/092986607779816122. PMID  17305610.
  • Ewing RM, Chu P, Elisma F и др. (2007). "Крупномасштабное картирование взаимодействий белок-белок человека с помощью масс-спектрометрии". Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC  1847948 . PMID  17353931.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Трансгелин&oldid=1194965080"