Т4 холин
Класс трансмембранных транспортных белков

Семейство холинов T4 (TC# 1.E.8) представляет собой группу предполагаемых порообразующих белков, которые не принадлежат ни к одному из семи суперсемейств холинов. Фаги T-четные, такие как T4, используют систему холин-эндолизин для лизиса клеток- хозяев . Хотя эндолизин фага T4, кодируемый геном e (лизоцим E), был идентифицирован в 1961 году, холин (продукт гена t и называемый T-холином) не был охарактеризован до 2001 года. [1] Представительный список белков, принадлежащих к семейству холинов T4, можно найти в Базе данных классификации транспортеров. [2]

Структура

T4 холин довольно большой, около 218 аминокислотных остатков (aas) в длину. Белок очень гидрофильный с 49 кислотными и основными остатками, распределенными по его длине, и одним предполагаемым трансмембранным сегментом (TMS) около его N-конца , оставляя большую часть белка в периплазме . [3]

Функция

Большой периплазматический домен является основным определяющим фактором в механизме синхронизации и участвует в ингибировании лизиса (LIN). [4] LIN включает в себя антихолиновый белок rI T4 (см. TC# 1.E.8.1.1). [5] Ингибирование лизиса является эффективной стратегией для координации синхронизации лизиса с созреванием фаговых частиц и исключения других фагов. [6] C-концевой периплазматический домен холина T4 связывает периплазматический домен антихолина T4 (RI; 97 аминокислот), который, как и холин, охватывает мембрану один раз. [3] T-холин фага T4 образует комплекс 1:1 с ингибитором RI, который блокирует агрегацию и образование пор. [7]

Гомология

T-холин фага T4 ( лизирующий белок ) идентичен холину из фага K3 и почти идентичен холину из фага ARI. Остатки 35-96 на 28% идентичны остаткам 436-495 белка поглощения K + Lactococcus lactis (gbAAK04721; TC# 2.A.72; KUP), что предполагает эволюционную связь между холином и транспортером. Холины имеют от 1 до 4 TMS и короткий C-концевой домен, богатый основными остатками.

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Ramanculov, E.; Young, R. (2001-04-01). "Функциональный анализ холина фага T4 в контексте лямбда". Molecular Genetics and Genomics . 265 (2): 345–353 . doi :10.1007/s004380000422. ISSN  1617-4615. PMID  11361346. S2CID  40455691.
  2. ^ "1.E.8 Семейство T4 Holin (T4 Holin)". База данных классификации транспортеров . Получено 26.03.2016 .
  3. ^ ab Tran, Tram Anh T.; Struck, Douglas K.; Young, Ry (2005-10-01). «Периплазматические домены определяют холин-антихолиновые взаимодействия при ингибировании лизиса t4». Журнал бактериологии . 187 (19): 6631– 6640. doi :10.1128/JB.187.19.6631-6640.2005. ISSN  0021-9193. PMC 1251592. PMID 16166524  . 
  4. ^ Ramanculov, E.; Young, R. (2001-03-07). "Генетический анализ холина T4: синхронизация и топология". Gene . 265 ( 1– 2): 25– 36. doi :10.1016/s0378-1119(01)00365-1. ISSN  0378-1119. PMID  11255004.
  5. ^ Ramanculov, E.; Young, R. (2001-08-01). «Древний игрок разоблачен: T4 rI кодирует t-специфический антихолин». Молекулярная микробиология . 41 (3): 575– 583. doi : 10.1046/j.1365-2958.2001.02491.x . ISSN  0950-382X. PMID  11532126. S2CID  25273199.
  6. ^ Миллер, Эрик С.; Куттер, Элизабет; Мосиг, Гизела; Арисака, Фумио; Кунисава, Такаши; Рюгер, Вольфганг (2003-03-01). «Геном бактериофага Т4». Microbiology and Molecular Biology Reviews . 67 (1): 86–156 , оглавление. doi :10.1128/mmbr.67.1.86-156.2003. ISSN  1092-2172. PMC 150520. PMID 12626685  . 
  7. ^ Мусса, Самир Х.; Кузнецов, Владимир; Тран, Трам Ань Т.; Саккеттини, Джеймс К.; Янг, Рай (2012-04-01). "Белковые детерминанты ингибирования лизиса фага T4". Protein Science . 21 (4): 571– 582. doi :10.1002/pro.2042. ISSN  1469-896X. PMC 3375757 . PMID  22389108. 

Дальнейшее чтение

  • Каталан МЖ, Жиль Ф, Мониш-Перейра Х, Сан-Жозе К, Пиментель М (2013). «Разнообразие систем бактериального лизиса: бактериофаги показывают путь». Обзоры микробиологии FEMS . 37 (4): 554–571 . doi : 10.1111/1574-6976.12006 . ПМИД  23043507.
  • Мусса СХ, Лоулер ДжЛ, Янг Р. (2014). «Генетическое препарирование лизиса Т4». Журнал бактериологии . 196 (12): 2201– 2209. doi :10.1128 / JB.01548-14. PMC  4054191. PMID  24706740.
  • Saier MH, Reddy BL, Margolin W (2015). «Холины в бактериях, эукариотах и ​​археях: многофункциональные ксенологи с потенциальными биотехнологическими и биомедицинскими применениями». Журнал бактериологии . 197 (1): 7– 17. doi :10.1128/JB.02046-14. PMC 4288690.  PMID 25157079  .
  • Tran TA, Struck DK, Young R (2005). «Периплазматические домены определяют холин-антихолиновые взаимодействия при ингибировании лизиса T4». Журнал бактериологии . 187 (19): 6631– 6640. doi :10.1128/JB.187.19.6631-6640.2005. PMC  1251592. PMID  16166524 .
  • Tran TA, Struck DK, Young R (2007). «Антихолин T4 RI имеет домен высвобождения сигнального якоря N-терминала, который нацеливает его на деградацию DegP». Журнал бактериологии . 189 (21): 7618– 7625. doi :10.1128/JB.00854-07. PMC  2168732. PMID  17693511 .
  • Ван ИН, Смит ДЛ, Янг Р. (2000). «Холины: белковые часы бактериофаговых инфекций». Ежегодный обзор микробиологии . 54 (1): 799– 825. doi :10.1146/annurev.micro.54.1.799. PMID  11018145.

На момент редактирования эта статья использует контент из "1.E.8 The T4 Holin (T4 Holin) Family" , который лицензирован таким образом, что позволяет повторное использование в соответствии с Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , но не в соответствии с GFDL . Все соответствующие условия должны быть соблюдены.

Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=T4_holin&oldid=1082981561"