мотив ssnA РНК

сснА
сснА
	Консенсусная вторичная структура и сохранение последовательности ssnA РНК
Идентификаторы
Символ	сснА
Рфам	РФ03031
Другие данные
Тип РНК	Цис-рег
ТАК	SO:0005836
Структуры PDB	ПДБе

Консервативная структура РНК, открытая биоинформатикой

РНК-семейство

Мотив ssnA РНК представляет собой консервативную структуру РНК , которая была открыта биоинформатикой . ^{[1] РНК с мотивом}ssnA обнаружены у Clostridiales .

РНК с мотивом ssnA, вероятно, функционируют как цис-регуляторные элементы , ввиду их расположения выше генов , кодирующих белок . В частности, они возникают выше генов, гомологичных гену ssnA Escherichia coli , хотя сами РНК ssnA не встречаются в E. coli или родственных организмах. Биологическая функция этого гена пока неизвестна (по состоянию на 2018 год), но предполагается, что это тип металлозависимой гидролазы. РНК ssnA близки (в пределах 20–30 пар оснований ) к терминаторам транскрипции, не зависящим от Rho .

Ссылки

^ Weinberg Z, Lünse CE, Corbino KA, Ames TD, Nelson JW, Roth A, Perkins KR, Sherlock ME, Breaker RR (октябрь 2017 г.). «Обнаружение 224 структурированных РНК-кандидатов путем сравнительного анализа определенных подмножеств межгенных регионов». Nucleic Acids Res . 45 (18): 10811– 10823. doi :10.1093/nar/gkx699. PMC 5737381. PMID 28977401 .

[Weinberg2017b-1] Weinberg Z, Lünse CE, Corbino KA, Ames TD, Nelson JW, Roth A, Perkins KR, Sherlock ME, Breaker RR (октябрь 2017 г.). «Обнаружение 224 структурированных РНК-кандидатов путем сравнительного анализа определенных подмножеств межгенных регионов». Nucleic Acids Res . 45 (18): 10811– 10823. doi :10.1093/nar/gkx699. PMC 5737381. PMID 28977401 .