Спондин 1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
СПОН1
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSPON1 , VSGP/F-спондин, ф-спондин, спондин 1
Внешние идентификаторыОМИМ : 604989; МГИ : 2385287; гомологен : 4453; Генные карты : SPON1; OMA :SPON1 — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_006108

NM_145584

RefSeq (белок)

NP_006099

NP_663559

Местоположение (UCSC)Хр 11: 13.96 – 14.27 МбХр 7: 113.37 – 113.64 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Спондин-1 (также известный как F-спондин) — это белок , который у людей кодируется геном SPON1 . [ 5] Он секретируется клетками донной пластинки и может участвовать в управлении аксонами . [6] Белок содержит 807 аминокислот и структурно состоит из шести доменов тромбоспондина , одного домена рилина и одного домена спондина.

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000262655 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000038156 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (апрель 1999 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Res . 5 (5): 277– 86. doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . PMID  9872452.
  6. ^ «Ген Энтреза: SPON1 спондин 1, белок внеклеточного матрикса».

Дальнейшее чтение

  • Накадзима Д., Оказаки Н., Ямакава Х. (2003). «Конструирование экспрессионно-готовых клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA». DNA Res . 9 (3): 99–106 . doi : 10.1093/dnares/9.3.99 . PMID  12168954.
  • Klar A, Baldassare M, Jessell TM (1992). "F-спондин: ген, экспрессируемый на высоком уровне в пластинке основания, кодирует секретируемый белок, который способствует адгезии нервных клеток и расширению нейритов". Cell . 69 (1): 95– 110. doi :10.1016/0092-8674(92)90121-R. PMID  1555244. S2CID  14880785.
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548.
  • Миямото К., Моришита Й., Ямазаки М. (2001). «Выделение и характеристика фактора, способствующего росту сосудистых гладкомышечных клеток, из фолликулярной жидкости яичников быка и клонирование его кДНК из яичников быка и человека». Arch. Biochem. Biophys . 390 (1): 93– 100. doi :10.1006/abbi.2001.2367. PMID  11368520.
  • Гонсалес де Передо А., Кляйн Д., Мацек Б. (2002). «C-маннозилирование и o-фукозилирование повторов тромбоспондина типа 1». Mol. Cell. Proteomics . 1 (1): 11– 8. doi : 10.1074/mcp.M100011-MCP200 . PMID  12096136.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932.
  • Ота Т., Сузуки Й., Нишикава Т. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
  • Ho A, Südhof TC (2004). «Связывание F-спондина с белком-предшественником бета-амилоида: кандидат на роль лиганда белка-предшественника бета-амилоида, который модулирует расщепление белка-предшественника бета-амилоида». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (8): 2548– 53. Bibcode :2004PNAS..101.2548H. doi : 10.1073/pnas.0308655100 . PMC  356987 . PMID  14983046.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID  15489334 .
  • Pyle-Chenault RA, Stolk JA, Molesh DA (2005). "VSGP/F-спондин: новый маркер рака яичников". Tumour Biol . 26 (5): 245–57 . doi :10.1159/000087379. PMID  16103746. S2CID  13409234.
  • Otsuki T, Ota T, Nishikawa T (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевых слов in silico для выбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек кДНК с олиго-кэпом». DNA Res . 12 (2): 117–26 . doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID  16303743.
  • Китагава М., Кудо Ю., Иидзука С. (2006). «Влияние F-спондина на цементобластическую дифференцировку клеток периодонтальной связки человека» (PDF) . Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 349 (3): 1050–6 . doi :10.1016/j.bbrc.2006.08.142. ПМИД  16965763.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9HCB6 (Spondin-1) в PDBe-KB .


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Spondin_1&oldid=1247327485"