Малая ядрышковая РНК SNORD50

Малая ядрышковая РНК SNORD50
Малая ядрышковая РНК SNORD50
	Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности SNORD50
Идентификаторы
Символ	СНОРД50
Альтернативные символы	У50
Рфам	РФ00278
Другие данные
Тип РНК	Ген ; мяРНК ; snoRNA ; CD-box
Домены	Эукариоты
ИДТИ	GO:0006396 GO:0005730
ТАК	SO:0000593
Структуры PDB	ПДБе

РНК-семейство

В молекулярной биологии snoRNA U50 (также известная как SNORD50 ) представляет собой некодирующую молекулу РНК (ncRNA), которая функционирует в модификации других малых ядерных РНК (snRNA). Этот тип модифицирующей РНК обычно находится в ядрышке эукариотической клетки, которое является основным местом биогенеза snRNA. Она известна как малая ядрышковая РНК (snoRNA) и также часто называется направляющей РНК.

snoRNA U50 принадлежит к классу snoRNA C/D box , которые содержат консервативные мотивы последовательности, известные как C box (UGAUGA) и D box (CUGA). Большинство членов семейства box C/D выполняют функцию управления сайт-специфическим 2'-O- метилированием субстратных РНК. ^[1]^[2]

U50 — это интронный ген snoRNA, расположенный на хромосоме 6q15, в точке разрыва хромосомной транслокации t(3;6)(q27;q15). Ген U50HG состоит из шести экзонов , чьи сплайсированные транскрипты имеют небольшой потенциал для кодирования белка, а его интроны производят как U50, так и U50-подобные (U50') snoRNA, которые локализуются в ядрышках. ^[3] Имеются данные о том, что паралоги U50 образуют новое семейство генов, контролирующих онкогенез и чувствительность к терапии при раке. ^[4]^[5]

Ссылки

^ Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные snoRNP C/D box способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663– 6668. doi : 10.1128 /MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
^ Kiss-Laszlo, Z; Henry Y; Bachellerie JP; Caizergues-Ferrer M; Kiss T (1996). "Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК". Cell . 85 (7): 1077– 1088. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81308-2 . PMID 8674114. S2CID 10418885.
^ Танака, Р.; Сато Х.; Морияма М.; Сато К.; Моришита И.; Йошида С.; Ватанабе Т.; Накамура И.; Мори С. (2000). «Интронный ген хозяина малой ядрышковой РНК (snoRNA) U50 без потенциала кодирования белка картирован в точке разрыва хромосомы t(3;6)(q27;q15) В-клеточной лимфомы человека». Гены Клетки . 5 (4): 277– 287. doi : 10.1046/j.1365-2443.2000.00325.x . PMID 10792466.
^ Mourtada-Maarabouni M, Pickard MR, Hedge VL, Farzaneh F, Williams GT (октябрь 2008 г.). «GAS5, некодирующая белок РНК, контролирует апоптоз и подавляется при раке груди». Oncogene . 28 (2): 195– 208. doi : 10.1038/onc.2008.373 . PMID 18836484.
^ Dong XY, Guo P, Boyd J, et al. (август 2009 г.). «Влияние snoRNA U50 на рак молочной железы у человека». J Genet Genomics . 36 (8): 447– 54. doi :10.1016/S1673-8527(08)60134-4. PMC 2854654 . PMID 19683667.

Внешние ссылки

Страница для малой ядрышковой РНК SNORD50 в Rfam
Запись на SNORD50 на snoRNABase
Запись для SNORD50B на snoRNABase

Эта статья по молекулярной или клеточной биологии — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[1] Галарди, С.; Фатика, А.; Бачи, А.; Скалони, А.; Пресутти, К.; Боццони, И. (октябрь 2002 г.). «Очищенные snoRNP C/D box способны воспроизводить сайт-специфическое 2'-O-метилирование целевой РНК in vitro». Молекулярная и клеточная биология . 22 (19): 6663– 6668. doi : 10.1128 /MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.

[pmid8674114-2] Kiss-Laszlo, Z; Henry Y; Bachellerie JP; Caizergues-Ferrer M; Kiss T (1996). "Сайт-специфическое метилирование рибозы прерибосомальной РНК: новая функция для малых ядрышковых РНК". Cell . 85 (7): 1077– 1088. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81308-2 . PMID 8674114. S2CID 10418885.

[pmid10792466-3] Танака, Р.; Сато Х.; Морияма М.; Сато К.; Моришита И.; Йошида С.; Ватанабе Т.; Накамура И.; Мори С. (2000). «Интронный ген хозяина малой ядрышковой РНК (snoRNA) U50 без потенциала кодирования белка картирован в точке разрыва хромосомы t(3;6)(q27;q15) В-клеточной лимфомы человека». Гены Клетки . 5 (4): 277– 287. doi : 10.1046/j.1365-2443.2000.00325.x . PMID 10792466.

[pmid18836484-4] Mourtada-Maarabouni M, Pickard MR, Hedge VL, Farzaneh F, Williams GT (октябрь 2008 г.). «GAS5, некодирующая белок РНК, контролирует апоптоз и подавляется при раке груди». Oncogene . 28 (2): 195– 208. doi : 10.1038/onc.2008.373 . PMID 18836484.

[pmid19683667-5] Dong XY, Guo P, Boyd J, et al. (август 2009 г.). «Влияние snoRNA U50 на рак молочной железы у человека». J Genet Genomics . 36 (8): 447– 54. doi :10.1016/S1673-8527(08)60134-4. PMC 2854654 . PMID 19683667.