Горнолыжный комплекс

Комплекс Ski представляет собой многобелковый комплекс, участвующий в 3'-концевой деградации матричных РНК в дрожжах. ^[1]

Структура

Комплекс состоит из трех основных белков , РНК- хеликазы Ski2 и белков Ski3 и Ski8 . Этот тетрамер содержит комплекс ядра массой 370 кДа, содержащий N-концевые плечи и C-концевые плечи от Ski3 . Ядро геликазы Ski2 позиционируется как C-концом Ski3 , так и двумя субъединицами Ski8 .

Механизм

Активность геликазы инициируется N-концевым плечом и доменом вставки Ski2 . ^[2] У дрожжей комплекс направляет молекулы РНК в экзосомальный комплекс для деградации через четвертый белок, называемый Ski7 , который содержит белок, подобный ГТФазе . ^[3] Ski7 включает деградацию РНК от 3' до 5' двумя различными путями: укорочение 3' поли(А)-хвоста и связывание тетрамера Ski2 , Ski3 и Ski8 с экзосомой. ^[1]

Деградация 3'-выступа мРНК происходит путем ассоциации с 80-й рибосомой. 3'-конец мРНК пронизывает рибосому до Ski2 , подготавливая ее к процессу деградации. ^[4]

Биохимические исследования также показывают, что комплекс Ski может пропускать РНК через экзосомальный комплекс, тем самым связывая функцию геликазы белка Ski2 с активностью экзорибонуклеазы, что приводит к деградации цепи РНК . ^[2]

Смотрите также

Ссылки

^ ab Araki Y, Takahashi S, Kobayashi T, Kajiho H, Hoshino S, Katada T (сентябрь 2001 г.). «Белок Ski7p G взаимодействует с экзосомой и комплексом Ski для распада мРНК от 3' до 5' у дрожжей». The EMBO Journal . 20 (17): 4684– 4693. doi : 10.1093 /emboj/20.17.4684. PMC 125587. PMID 11532933.
^ ab Halbach F, Reichelt P, Rode M, Conti E (август 2013 г.). «Комплекс дрожжей ski: кристаллическая структура и канализация РНК в комплекс экзосом». Cell . 154 (4): 814– 826. doi : 10.1016/j.cell.2013.07.017 . PMID 23953113. S2CID 12699297.
^ Wang L, Lewis MS, Johnson AW (август 2005 г.). «Взаимодействия доменов в комплексе Ski2/3/8 и между комплексом Ski и Ski7p». РНК . 11 (8): 1291– 1302. doi :10.1261/rna.2060405. PMC 1370812. PMID 16043509 .
^ Шмидт С., Ковалински Э., Шанмуганатан В., Дефенуйер К., Браунгер К., Хойер А. и др. (декабрь 2016 г.). «Крио-ЭМ структура геликазного комплекса рибосома-Ski2-Ski3-Ski8». Наука . 354 (6318): 1431–1433 . Бибкод : 2016Sci...354.1431S. doi : 10.1126/science.aaf7520. PMID 27980209. S2CID 30262907.

[Araki_2001-1] Araki Y, Takahashi S, Kobayashi T, Kajiho H, Hoshino S, Katada T (сентябрь 2001 г.). «Белок Ski7p G взаимодействует с экзосомой и комплексом Ski для распада мРНК от 3' до 5' у дрожжей». The EMBO Journal . 20 (17): 4684– 4693. doi : 10.1093 /emboj/20.17.4684. PMC 125587. PMID 11532933.

[Halbach_2013-2] Halbach F, Reichelt P, Rode M, Conti E (август 2013 г.). «Комплекс дрожжей ski: кристаллическая структура и канализация РНК в комплекс экзосом». Cell . 154 (4): 814– 826. doi : 10.1016/j.cell.2013.07.017 . PMID 23953113. S2CID 12699297.

[3] Wang L, Lewis MS, Johnson AW (август 2005 г.). «Взаимодействия доменов в комплексе Ski2/3/8 и между комплексом Ski и Ski7p». РНК . 11 (8): 1291– 1302. doi :10.1261/rna.2060405. PMC 1370812. PMID 16043509 .

[4] Шмидт С., Ковалински Э., Шанмуганатан В., Дефенуйер К., Браунгер К., Хойер А. и др. (декабрь 2016 г.). «Крио-ЭМ структура геликазного комплекса рибосома-Ski2-Ski3-Ski8». Наука . 354 (6318): 1431–1433 . Бибкод : 2016Sci...354.1431S. doi : 10.1126/science.aaf7520. PMID 27980209. S2CID 30262907.