Синдром Шегрена антиген B

ССБ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1OWX, 1S79, 1S7A, 1YTY, 1ZH5, 2VOD, 2VON, 2VOO, 2VOP
Идентификаторы
Псевдонимы	SSB , LARP3, La, антиген B синдрома La/Шегрена, фактор защиты от экзонуклеазы, связывающей малую РНК La
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 109090; МГИ : 98423; Гомологен : 2366; GeneCards : SSB; ОМА :SSB - ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 2 (человек)
Конец	169,812,064 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	69,702,190 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верхний выражен в
	сухожилие двуглавой мышцы плеча; ; Ахиллово сухожилие; ; желудочковая зона; ; слизистая оболочка околоносовых пазух; ; моноцит; ; эпителий носоглотки; ; ганглионарное возвышение; ; брюшина; ; левая коронарная артерия; ; передняя доля гипофиза;
	Верхний выражен в
	хвост эмбриона; ; генитальный бугорок; ; верхнечелюстной выступ; ; выступ нижней челюсти; ; желудочковая зона; ; эмбрион; ; эмбрион; ; брюшная стенка; ; супраоптическое ядро; ; ганглионарное возвышение;
	Больше данных по справочным выражениям
	; ;
	Больше данных по справочным выражениям
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание белков; связывание мРНК; связывание нуклеиновых кислот; связывание тРНК; Связывание РНК; Связывание поли(У)РНК; активность гомодимеризации белка; последовательность-специфическое связывание мРНК;
Клеточный компонент	ядро; цитоплазма; рибонуклеопротеиновый комплекс;
Биологический процесс	Обработка РНК; метаболический процесс мРНК гистонов; локализация белка в цитоплазматической стрессовой грануле; модификация тРНК; IRES-зависимая вирусная трансляционная инициация; Удаление 5'-лидера тРНК; экспорт тРНК из ядра; процессинг тРНК; Обработка 3'-конца тРНК; ядерный гистоновый мРНК катаболический процесс;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	6741
	20823
	ENSG00000138385
	ENSMUSG00000068882
	Р05455
	Р32067
	NM_003142 ; NM_001294145
	НМ_001110145 ; НМ_009278 ; НМ_001355265
	NP_001281074 ; NP_003133
	НП_001103615 ; НП_033304 ; НП_001342194
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок

Антиген синдрома Шегрена типа B ( SS-B ), также известный как белок Lupus La, представляет собой белок , который у людей кодируется геном SSB . ^[5]

Функция

La участвует в различных аспектах метаболизма РНК, включая связывание и защиту 3-прайм-элементов UUU (OH) новой РНК-полимеразы III , транскрибированной РНК, обработку 5-прайм- и 3-прайм-концов предшественников пре-тРНК, действуя как шаперон РНК и связывание вирусных РНК, связанных с вирусом гепатита С. Белок La первоначально был определен по его реактивности с аутоантителами пациентов с синдромом Шегрена и системной красной волчанкой . ^[5]^[6]

Взаимодействия

Было показано, что антиген B синдрома Шегрена взаимодействует с нуклеолином . ^[7]

Смотрите также

Домен

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000138385 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000068882 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ ab «Ген Энтреза: антиген B синдрома Шегрена SSB (аутоантиген La)» .
^ Теплова М, Юань ИР, Фан АТ, Малинина Л, Ильин С, Теплов А, Патель Д.Дж. (январь 2006 г.). "Структурная основа распознавания и секвестрации UUU(OH) 3' концов растущих транскриптов РНК-полимеразы III La, аутоантигеном ревматического заболевания". Molecular Cell . 21 (1): 75– 85. doi :10.1016/j.molcel.2005.10.027. PMC 4689297 . PMID 16387655.
^ Фуро М.А., Буве П., Веркаарт С., ван Венрой В.Дж., Пруейн Г.Дж. (июль 2002 г.). «Нуклеолин ассоциируется с подмножеством рибонуклеопротеиновых комплексов Ro человека». Журнал молекулярной биологии . 320 (3): 475–88 . doi :10.1016/S0022-2836(02)00518-1. hdl : 2066/121576 . ПМИД 12096904.

Дальнейшее чтение

Kohsaka H, Yamamoto K, Fujii H, Miura H, Miyasaka N, Nishioka K, Miyamoto T (май 1990). "Точное картирование эпитопов человеческого белка SS-B/La. Идентификация отдельного аутоэпитопа, гомологичного вирусному полипротеину gag". The Journal of Clinical Investigation . 85 (5): 1566– 74. doi :10.1172/JCI114606. PMC 296607 . PMID 1692037.
Sturgess AD, Peterson MG, McNeilage LJ, Whittingham S, Coppel RL (май 1988). "Характеристики и картирование эпитопов клонированного человеческого аутоантигена La". Журнал иммунологии . 140 (9): 3212– 8. doi : 10.4049/jimmunol.140.9.3212 . PMID 2452201. S2CID 1863804.
Раух А. Дж., Хорниг Х., Люрманн Р. (декабрь 1988 г.). «По крайней мере три различных эпитопа В-клеток находятся в С-концевой половине белка La, как определено с помощью подхода рекомбинантной ДНК». Европейский журнал иммунологии . 18 (12): 2049–57 . doi :10.1002/eji.1830181227. PMID 2464497. S2CID 7014818.
Chan EK, Sullivan KF, Tan EM (март 1989). «Рибонуклеопротеин SS-B/La принадлежит к семейству белков с консенсусными последовательностями для связывания РНК». Nucleic Acids Research . 17 (6): 2233– 44. doi :10.1093/nar/17.6.2233. PMC 317593. PMID 2468131 .
Gottlieb E, Steitz JA (март 1989). "Функция белка La млекопитающих: доказательства его действия в терминации транскрипции РНК-полимеразой III". The EMBO Journal . 8 (3): 851– 61. doi :10.1002/j.1460-2075.1989.tb03446.x. PMC 400884 . PMID 2470590.
Chambers JC, Kenan D, Martin BJ, Keene JD (декабрь 1988 г.). «Геномная структура и домены аминокислотной последовательности человеческого аутоантигена La». Журнал биологической химии . 263 (34): 18043– 51. doi : 10.1016/S0021-9258(19)81321-2 . PMID 3192525.
Chambers JC, Keene JD (апрель 1985 г.). «Выделение и анализ клонов кДНК, экспрессирующих человеческий волчаночный антиген La». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 82 (7): 2115– 9. Bibcode : 1985PNAS...82.2115C. doi : 10.1073/pnas.82.7.2115 . PMC 397503. PMID 3856888.
Свиткин Ю.В., Паузе А., Соненберг Н. (ноябрь 1994 г.). «La autoantigen eases transcriptal repression by the 5' leader sequence of the human immunity deficiency virus type 1 mRNA». Журнал вирусологии . 68 (11): 7001– 7. doi : 10.1128 /jvi.68.11.7001-7007.1994. PMC 237137. PMID 7933082.
Tröster H, Metzger TE, Semsei I, Schwemmle M, Winterpacht A, Zabel B, Bachmann M (декабрь 1994 г.). «Один ген, два транскрипта: изоляция альтернативного транскрипта, кодирующего аутоантиген La/SS-B из библиотеки кДНК пациента с первичным синдромом Шегрена». Журнал экспериментальной медицины . 180 (6): 2059– 67. doi :10.1084/jem.180.6.2059. PMC 2191769. PMID 7964483 .
Fan H, Sakulich AL, Goodier JL, Zhang X, Qin J, Maraia RJ (март 1997). "Фосфорилирование человеческого антигена La на серине 366 может регулировать рециркуляцию транскрипционных комплексов РНК-полимеразы III". Cell . 88 (5): 707– 15. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81913-3 . PMID 9054510. S2CID 2223069.
McLaren RS, Caruccio N, Ross J (июнь 1997 г.). "Человеческий белок La: стабилизатор мРНК гистонов". Молекулярная и клеточная биология . 17 (6): 3028– 36. doi :10.1128 / mcb.17.6.3028. PMC 232155. PMID 9154801.
Grölz D, Bachmann M (апрель 1997 г.). «Ядерный аутоантиген La/SS-ассоциированный антиген B: один ген, три функциональные мРНК». The Biochemical Journal . 323 ( Pt 1) (1): 151– 8. doi :10.1042/bj3230151. PMC 1218288 . PMID 9173875.
Helsloot J, Sturgess A (декабрь 1997 г.). «Реактивность Т-клеток к антигену La(SSB) синдрома Шегрена». Журнал ревматологии . 24 (12): 2340–7 . PMID 9415639.
Broekhuis CH, Neubauer G, van der Heijden A, Mann M, Proud CG, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (март 2000 г.). «Подробный анализ фосфорилирования человеческого аутоантигена La (SS-B). (Де)фосфорилирование не влияет на его субклеточное распределение». Биохимия . 39 (11): 3023– 33. doi :10.1021/bi992308c. hdl : 2066/187036 . PMID 10715123.
Spångberg K, Wiklund L, Schwartz S (сентябрь 2000 г.). «HuR, белок, участвующий в распаде мРНК онкогенов и факторов роста, связывается с 3'-концами РНК вируса гепатита С обеих полярностей». Вирусология . 274 (2): 378–90 . doi : 10.1006/viro.2000.0461 . PMID 10964780.
Intine RV, Sakulich AL, Koduru SB, Huang Y, Pierstorff E, Goodier JL, Phan L, Maraia RJ (август 2000 г.). «Контроль созревания транспортной РНК путем фосфорилирования человеческого антигена La на серине 366». Molecular Cell . 6 (2): 339– 48. doi : 10.1016/S1097-2765(00)00034-4 . PMID 10983981.
Nashimoto M, Nashimoto C, Tamura M, Kaspar RL, Ochi K (октябрь 2001 г.). «Ингибирующее действие аутоантигена La на in vitro 3'-процессинг предшественников тРНК млекопитающих». Журнал молекулярной биологии . 312 (5): 975–84 . doi :10.1006/jmbi.2001.5026. PMID 11580243.
Де Нова-Окампо М., Вильегас-Сепульведа Н., дель Анхель Р.М. (апрель 2002 г.). «Фактор элонгации трансляции-1альфа, La и PTB взаимодействуют с 3'-нетранслируемой областью РНК вируса денге 4». Вирусология . 295 (2): 337–47 . doi : 10.1006/viro.2002.1407 . ПМИД 12033793.
Intine RV, Dundr M, Misteli T, Maraia RJ (май 2002 г.). «Аберрантный ядерный транспорт белка La приводит к нарушению обработки связанных предшественников тРНК». Molecular Cell . 9 (5): 1113– 23. doi : 10.1016/S1097-2765(02)00533-6 . PMID 12049746.
Фуро М.А., Буве П., Веркаарт С., ван Венрой В.Дж., Пруейн Г.Дж. (июль 2002 г.). «Нуклеолин ассоциируется с подмножеством рибонуклеопротеиновых комплексов Ro человека». Журнал молекулярной биологии . 320 (3): 475–88 . doi :10.1016/S0022-2836(02)00518-1. hdl : 2066/121576 . ПМИД 12096904.

Эта статья о гене на хромосоме 2 человека — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000138385 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000068882 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтреза: антиген B синдрома Шегрена SSB (аутоантиген La)» .

[pmid16387655-6] Теплова М, Юань ИР, Фан АТ, Малинина Л, Ильин С, Теплов А, Патель Д.Дж. (январь 2006 г.). "Структурная основа распознавания и секвестрации UUU(OH) 3' концов растущих транскриптов РНК-полимеразы III La, аутоантигеном ревматического заболевания". Molecular Cell . 21 (1): 75– 85. doi :10.1016/j.molcel.2005.10.027. PMC 4689297 . PMID 16387655.

[pmid12096904-7] Фуро М.А., Буве П., Веркаарт С., ван Венрой В.Дж., Пруейн Г.Дж. (июль 2002 г.). «Нуклеолин ассоциируется с подмножеством рибонуклеопротеиновых комплексов Ro человека». Журнал молекулярной биологии . 320 (3): 475–88 . doi :10.1016/S0022-2836(02)00518-1. hdl : 2066/121576 . ПМИД 12096904.