Селеномонадалес

Порядок бактерий

Селеномонадалес
Научная классификация Редактировать эту классификацию
Домен:Бактерии
Тип:Бациллота
Сорт:Негативики
Заказ:Селеномонадалс
Маршандин и др. 2010 год
Семьи и роды
Синонимы
  • "Споромусалес" Кавальер-Смит 2006 г.

Selenomonadales — это отряд бактерий в классе Negativicutes ; в отличие от большинства других членов Bacillota , они грамотрицательные . Филогения этого отряда изначально была определена путем сравнения 16S рРНК . [1] Совсем недавно были обнаружены молекулярные маркеры в форме консервативных сигнатурных инделей (CSI), специфичные для всех видов Selenomonadales. [2] На основании этих маркеров Selenomonadales включают два отдельных семейства и больше не являются единственным отрядом в Negativicutes . Также было обнаружено несколько CSI, специфичных для обоих семейств, Sporomusaceae и Selenomonadceae. [2] Образцы штаммов бактерий в этом отряде были выделены из корневых каналов здоровых человеческих зубов. [3]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [4] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) [5].

LTP на основе 16S рРНК _08_2023 [6] [7] [8]120 маркерных белков с одной копией на основе GTDB 08-RS214 [9] [10] [11]
Споровые

Анаэроспоромуса

Пелорабдус

Метиломуза

Споромуса

SS

Пропиониспора

Anaerosinus Strömpl et al. 1999 год

Селеномонадовые

Selenomonas lacticifex Schleifer et al. 1990 год

" Селеномастикс "

Группа видов Selenomonas 2

Мицуокелла

Анаэровибрион

Шварция

Вейлонелловые
"Sporomusaceae" сл.
Sporomusales_A
"Ацетонемовые"

Анаэроспоромуза Чой и др. 2016 год

Ацетонема Кейн и Брезнак, 1992 г.

Споровые C
DSM‑15969

Анаэроспора Ву и др. 2005

"Термозиновые"

Thermosinus Соколова и др. 2004 [ Sporolituus Огг и Патель, 2009 ]

"Споромусалес"
"Люциферовые"

Люцифера Санчес-Андреа и др. 2018 год

Споровые

Метиломуза Амано и др. 2018

Споровая муха Мёллер и др. 1985

"Анаэромусалес"
"Анаэромусовые"

Анаэромуса Баэна и др. 1999 г. (включая Anaeroarcus Strömpl и др., 1999 г. )

UMGS1260
UMGS1260

Пелорхабдус Грассле и др. 2022 год

"Пропиониспоровые"
"Пропиониспоровые"

Пропиониспора Библ и др. 2001 г.

"Pelosinaceae"

Пелозинус Шелоболина и др. 2007

«Дендроспоробактериалес»
"Дендроспоробактерии"

Dendrosporobacter Штромпл и др. 2000

Селеномонадалес
"Massilibacillaceae"

« Massilibacillus » Тиджани Алоу и др. 2017 год

Селеномонадовые

Propionispira arboris Schink et al. 1983 год

Мегамонас Шах и Коллинз 1983

Гребешок Ли и др. 1978

Селеномонас фон Проважек 1913

Анаэровибрион Хангате 1966

Шварция Гилсвик и др. 1997 год

Квинелла Крумхольц и др. 1993

Многоножка Лай и др. 1983

Группа видов Selenomonas 2

" Селеномастикс " Вальдшнеп и Лапаж 1913

Мицуокелла Шах и Коллинз, 1983 г.

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Маршандин, Х.; Тейссье, К.; Кампос, Ж.; Жан-Пьер, Х.; Роджер, Ф.; Гей, Б.; Карлье, Ж.-П.; Жюмас-Билак, Э. (10 августа 2009 г.). «Negativicoccus succinicivorans gen. nov., sp. nov., выделенный из клинических образцов человека, исправил описание семейства Veillonellaceae и описание Negativicutes classis nov., Selenomonadales ord. nov. и Acidaminococcaceae fam. nov. в бактериальном типе Firmicutes». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 60 (6): 1271–1279. doi : 10.1099/ijs.0.013102-0 . PMID  19667386.
  2. ^ ab Campbell C, Adeolu M, Gupta RS (2015). «Геномная таксономическая структура для класса Negativicutes: разделение класса Negativicutes на порядки Selenomonadales emend., Acidaminococcales ord. nov. и Veillonellales ord. nov». Int J Syst Evol Microbiol . 65 (9): 3203–3215. doi : 10.1099/ijs.0.000347 . PMID  25999592.
  3. ^ Рибейро, Адриана К.; Матараццо, Флавия; Фавери, Марсело; Зезелл, Дениз М.; Майер, Марсия ПА (21 июня 2011 г.). «Изучение бактериального разнообразия эндодонтической микробиоты путем клонирования и секвенирования 16S рРНК». Журнал эндодонтии . 37 (7): 922–926. doi :10.1016/j.joen.2011.04.007. PMID  21689545.
  4. ^ JP Euzéby. "Negativicutes". Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре (LPSN) . Получено 09.09.2022 .
  5. ^ Sayers; et al. "Negativicutes". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 2022-09-09 .
  6. ^ "The LTP" . Получено 20 ноября 2023 г. .
  7. ^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 20 ноября 2023 г. .
  8. ^ "LTP_08_2023 Release Notes" (PDF) . Получено 20 ноября 2023 г.
  9. ^ "GTDB release 08-RS214". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
  10. ^ "bac120_r214.sp_label". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
  11. ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
  • ПАТРИК
  • JP Euzéby: Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре - Отряд Selenomonadales
  • NCBI
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Selenomonadales&oldid=1189093569"