Lachancea kluyveri
| Lachancea kluyveri | |
|---|---|
Научная классификация  | |
| Домен: | Эукариоты |
| Королевство: | Грибы |
| Разделение: | Аскомикота |
| Сорт: | Сахаромицеты |
| Заказ: | Сахаромицеты |
| Семья: | Сахаромицетовые |
| Род: | Лахансия |
| Разновидность: | L. kluyveri |
| Биномиальное имя | |
| Lachancea kluyveri ( Фафф , М.В.Милл и Шифрин) Курцман (2003) | |
| Синонимы | |
| |
Lachancea kluyveri — аскомицетовые дрожжи , связанные с плодовыми мушками, слизистыми потоками , почвой и пищевыми продуктами.
Место обитания
Среда обитания L. kluyveri не очень хорошо известна, поскольку было зарегистрировано всего около 30 изолятов. Однако считается, что он широко распространен в окружающей среде. Впервые описан как Saccharomyces kluyveri в 1956 году у плодовых мух в Калифорнии , [1] этот вид был выделен из слизистых потоков на деревьях, почв в Северной Америке и Европе, [2] [3] и сыров. [4] Он также был зарегистрирован как возбудитель диссеминированного микоза у пациента с ВИЧ/СПИД . [5]
Биология
Lachancea kluyveri — это почкующиеся дрожжи, родственные Saccharomyces cerevisiae , или пекарским дрожжам, модельному организму , интенсивно используемому в биохимии, генетике и клеточной биологии. В 2003 году он был переведен из рода Saccharomyces в род Lachancea, названный в честь канадского миколога и биолога дрожжей Марка-Андре Лашанса. [6] Saccharomyces cerevisiae и L. kluyveri имеют несколько фундаментальных различий, которые оправдывают геномные сравнения. Во-первых, как и большинство типов клеток, L. kluyveri прибегают к ферментации (разложению сахаров при отсутствии кислорода) только при ограниченном количестве кислорода. S. cerevisiae , с другой стороны, предпочитает проводить ферментацию даже в присутствии кислорода. Это означает, что L. kluyveri более эффективно использует глюкозу для производства энергии. Таким образом, L. kluyveri представляет собой контрастную модель для одной из самых необычных особенностей S. cerevisiae . Во-вторых, L. kluyveri имеет более простую организацию генома, чем S. cerevisiae : по-видимому, он стал видом до полной дупликации генома, которая произошла в линии Saccharomyces. В результате его геном меньше (около 9,5 миллионов пар оснований ), чем у S. cerevisiae, с меньшим количеством дублированных генов. Кроме того, L. kluyveri все шире используется в качестве модельного организма и для промышленных применений, таких как производство белков, поскольку выход его биомассы больше, чем у S. cerevisiae из-за более эффективного использования глюкозы. [7]
Информация о последовательности
| Идентификатор генома NCBI | 69 |
|---|---|
| Плоидность | диплоидный |
| Размер генома | 12.6 Мб |
| Число хромосом | 8 пар |
| Год завершения | 2002 |
Геном L. kluyveri был первоначально секвенирован в 2002 году с охватом всего генома методом дробовика (WGS) примерно в 3,5 раза. [7]
Ссылки
- ^ Phaff, HJ; Miller, MW; Shifrine, M. (1956). «Таксономия дрожжей, выделенных из Drosophila в районе Йосемити в Калифорнии». Antonie van Leeuwenhoek . 22 (2): 145– 61. doi :10.1007/BF02538322. PMID 13340701. S2CID 23218010.
- ^ Миллер, М. В.; Фафф, Х. Дж.; Снайдер, Х. Э. (1962). «О встречаемости различных видов дрожжей в природе» (PDF) . Mycopathologia et Mycologia Applicata . 16 : 1–18 . doi :10.1007/BF02136176. S2CID 36912547.
- ^ Каприотти, Аугусто (1958). " Saccharomyces smittii nov. Spec. Новые дрожжи, выделенные из голландских, итальянских и шведских почв". Антони ван Левенгук . 24 : 215–220 . doi :10.1007/BF02548448. S2CID 39312212.
- ^ Wojtatowicz, M; Chrzanowska, J; Juszczyk, P; Skiba, A; Gdula, A (2001). «Идентификация и биохимические характеристики дрожжевой микрофлоры сыра Рокполь». Международный журнал пищевой микробиологии . 69 ( 1– 2): 135– 40. doi :10.1016/S0168-1605(01)00582-7. PMID 11589552.
- ^ Pynka, M; Wnuk, A; Bander, D; Syczewska, M; Boroń, A; Prost, B; Wrzecion, S (1998). «Диссеминированная инфекция Saccharomyces kluyveri у пациента со СПИДом». Инфекция . 26 (3): 184– 6. doi :10.1007/bf02771850. PMID 9646114. S2CID 6407225.
- ^ Курцман, CP (2003). «Филогенетические границы Saccharomyces, Kluyveromyces и других членов Saccharomycetaceae и предложение новых родов Lachancea, Nakaseomyces, Naumovia, Vanderwaltozyma и Zygotorulaspora». FEMS Yeast Research . 4 (3): 233– 45. doi : 10.1016/S1567-1356(03)00175-2 . PMID 14654427.
- ^ ab S.kluyveri Проект секвенирования генома
