СИНПО
Белок млекопитающих обнаружен у Homo sapiens
СИНПО
Идентификаторы
ПсевдонимыSYNPO , синаптоподин
Внешние идентификаторыОМИМ : 608155; МГИ : 1099446; гомологен : 5274; GeneCards : СИНПО; ОМА :SYNPO - ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез

11346

104027

Ансамбль

ENSG00000171992

ENSMUSG00000043079

UniProt

Q8N3V7

Q8CC35

RefSeq (мРНК)

NM_001109974
NM_001166208
NM_001166209
NM_007286

NM_001109975
NM_177340

RefSeq (белок)

NP_001103444
NP_001159680
NP_001159681
NP_009217

NP_001103445
NP_796314

Местоположение (UCSC)Хр 5: 150,6 – 150,66 МбХр 18: 60,73 – 60,79 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Синаптоподин — это белок , который у людей кодируется геном SYNPO . [ 5] [6] [7]

Функция

Синаптоподин — это связанный с актином белок, который может играть роль в форме и подвижности клеток на основе актина. Название синаптоподин происходит от ассоциации белка с постсинаптическими плотностями и дендритными шипиками, а также с почечными подоцитами (Mundel et al., 1997).[предоставлено OMIM] [7]

Взаимодействия

Было показано, что SYNPO взаимодействует с MAGI1 . [8]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000171992 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000043079 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Mundel P, Heid HW, Mundel TM, Krüger M, Reiser J, Kriz W (октябрь 1997 г.). «Синаптоподин: ассоциированный с актином белок в дендритах конечного мозга и почечных подоцитах». Журнал клеточной биологии . 139 (1): 193–204 . doi :10.1083/jcb.139.1.193. PMC 2139823. PMID  9314539 . 
  6. ^ Кикуно Р., Нагасе Т., Ишикава К., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (июнь 1999 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Research . 6 (3): 197–205 . doi : 10.1093/dnares/6.3.197 . PMID  10470851.
  7. ^ ab "Ген Энтрез: синаптоподин SYNPO" .
  8. ^ Patrie KM, Drescher AJ, Welihinda A, Mundel P, Margolis B (август 2002 г.). «Взаимодействие двух актин-связывающих белков, синаптоподина и альфа-актинина-4, с белком плотного контакта MAGI-1». Журнал биологической химии . 277 (33): 30183– 90. doi : 10.1074/jbc.M203072200 . PMID  12042308.

Дальнейшее чтение

  • Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (сентябрь 1995 г.). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и моделей экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF) . Nature . 377 (6547 Suppl): 3– 174. PMID  7566098.
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфической рекомбинации». Genome Research . 10 (11): 1788– 95. doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948. PMID  11076863 .
  • Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р., Гассенхубер Дж., Глассль С., Ансорж В., Бёхер М., Блёкер Х., Бауэрсакс С., Блюм Х., Лаубер Дж., Дюстерхёфт А., Бейер А., Кёрер К., Штрак Н., Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б. , Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. ПМК  311072 . PMID  11230166.
  • Patrie KM, Drescher AJ, Welihinda A, Mundel P, Margolis B (август 2002 г.). «Взаимодействие двух актин-связывающих белков, синаптоподина и альфа-актинина-4, с белком плотного контакта MAGI-1». Журнал биологической химии . 277 (33): 30183– 90. doi : 10.1074/jbc.M203072200 . PMID  12042308.
  • Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (сентябрь 2004 г.). "Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных регионах". Genome Research . 14 (9): 1711– 8. doi :10.1101/gr.2435604. PMC  515316 . PMID  15342556.
  • He JC, Husain M, Sunamoto M, D'Agati VD, Klotman ME, Iyengar R, Klotman PE (сентябрь 2004 г.). «Nef стимулирует пролиферацию гломерулярных подоцитов посредством активации Src-зависимых путей Stat3 и MAPK1,2». Журнал клинических исследований . 114 (5): 643–51 . doi :10.1172/JCI21004. PMC  514582. PMID  15343382 .
  • Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлигер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования . 14 (10Б): 2136– 44. doi :10.1101/gr.2576704. ПМК  528930 . ПМИД  15489336.
  • Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (январь 2005 г.). "Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках". Nature Biotechnology . 23 (1): 94– 101. doi :10.1038/nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
  • Kremerskothen J, Plaas C, Kindler S, Frotscher M, Barnekow A (февраль 2005 г.). «Синаптоподин, молекула, участвующая в формировании аппарата дендритных шипиков, является двойным актин/альфа-актинин-связывающим белком». Journal of Neurochemistry . 92 (3): 597– 606. doi :10.1111/j.1471-4159.2004.02888.x. PMID  15659229. S2CID  1837841.
  • Асанума К., Ким К., О Дж., Джардино Л., Чабанис С., Фаул С., Райзер Дж., Мандел П. (май 2005 г.). «Синаптоподин регулирует активность альфа-актинина, связывающую актин, специфичным для изоформы способом». Журнал клинических исследований . 115 (5): 1188–98 . doi : 10.1172/JCI23371. ПМЦ  1070637 . ПМИД  15841212.
  • Husain M, D'Agati VD, He JC, Klotman ME, Klotman PE (ноябрь 2005 г.). "HIV-1 Nef вызывает дедифференциацию подоцитов in vivo: характерная черта HIVAN". AIDS . 19 (17): 1975–80 . doi : 10.1097/01.aids.0000191918.42110.27 . PMID  16260903. S2CID  40286329.
  • Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., Дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бехтель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. дои : 10.1093/nar/gkj139. ПМЦ  1347501 . ПМИД  16381901.
  • Хиракава М., Цуруя К., Ёцуэда Х., Токумото М., Икеда Х., Катафучи Р., Фуджими С., Хираката Х., Иида М. (июль 2006 г.). «Экспрессия синаптоподина и GLEPP1 как маркеров чувствительности к стероидам при первичном фокально-сегментарном гломерулосклерозе». Науки о жизни . 79 (8): 757–63 . doi :10.1016/j.lfs.2006.02.031. ПМИД  16564554.
  • Asanuma K, Yanagida-Asanuma E, Faul C, Tomino Y, Kim K, Mundel P (май 2006 г.). «Синаптоподин управляет организацией актина и подвижностью клеток посредством регуляции сигнализации RhoA». Nature Cell Biology . 8 (5): 485– 91. doi :10.1038/ncb1400. PMID  16622418. S2CID  12861229.
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573.
  • Garovic VD, Wagner SJ, Petrovic LM, Gray CE, Hall P, Sugimoto H, Kalluri R, Grande JP (апрель 2007 г.). «Клубочковая экспрессия нефрина и синаптоподина, но не подоцина, снижена в срезах почек у женщин с преэклампсией». Нефрология, диализ, трансплантация . 22 (4): 1136– 43. doi : 10.1093/ndt/gfl711 . PMID  17255128.
Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SYNPO&oldid=1185528180"