Несприн-2 — это белок , который у людей кодируется геном SYNE2 . [ 5] [6] [7] Человеческий ген SYNE2 состоит из 116 экзонов и кодирует несприн-2, член семейства спектрин-повторов ядерной оболочки (NE) . Несприны — это модульные белки с центральным стержневым доменом расширенного спектрин-повтора (SR) и трансмембранным доменом гомологии Klarsicht/ANC-1/Syne (KASH) на С-конце, который действует как мотив, нацеливающий на NE. Несприн-2 (Nesp2) связывается с цитоплазматическим F -актином , привязывая ядро к цитоскелету и поддерживая структурную целостность ядра.
Ген SYNE2 человека кодирует белок из 6885 аминокислот (изоформа 1, гигантская Nesp2); альтернативный сплайсинг мРНК производит транскрипты, кодирующие более крупную изоформу и многочисленные более мелкие изоформы, некоторые из которых специфичны для различных тканей; альтернативные сайты начала и окончания в мРНК также позволяют транслировать более мелкие изоформы, многие из которых обладают уникальными N- или C-концевыми последовательностями, кодируемыми сохраненными интронами. Два механизма создают варианты сплайсинга несприна-2 с удаленным доменом KASH (deltaKASH). В вариантах deltaKASH1 удаление экзонов кассеты 111-112 приводит к сдвигу рамки, который нарушает домен KASH, но сохраняет 3'-нетранслируемую область (UTR) в экзоне 116, используемую для изоформ, содержащих домен KASH. Этот механизм, который также встречается в мРНК SYNE1, кодирующей несприн-1 ( энаптин ), генерирует изоформы deltaKASH1, заканчивающиеся отдельным 11-аминокислотным хвостом (GIAGHSATPPA заменяет YPMLRYTNGPPPT в изоформах с KASH). Использование альтернативного стоп-кодона в экзоне 115, за которым следует отдельный 3'-UTR, генерирует варианты deltaKASH2. Этот механизм усекает более крупные изоформы, не генерируя отдельную С-концевую последовательность. Экспрессия вариантов deltaKASH1 происходит в основном в мозге и почках, с меньшим количеством в сердце; варианты deltaKASH2 обнаруживаются в сердце и селезенке. [8]
Ссылки
^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000054654 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000063450 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (июль 1999). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных человеческих генов. XIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Res . 6 (1): 63–70 . doi : 10.1093/dnares/6.1.63 . PMID 10231032.
^ Apel ED, Lewis RM, Grady RM, Sanes JR (ноябрь 2000 г.). "Syne-1, белок, связанный с дистрофином и Кларсихтом, связанный с синаптическими ядрами в нервно-мышечном соединении". J Biol Chem . 275 (41): 31986– 95. doi : 10.1074/jbc.M004775200 . PMID 10878022.
^ Rajgor D, Mellad JA, Autore F, Zhang Q, Shanahan CM (июль 2012 г.). «Множественные новые варианты несприна-1 и несприна-2 действуют как универсальные тканеспецифические внутриклеточные каркасы». PLOS ONE . 7 (7): e40098. Bibcode :2012PLoSO...740098R. doi : 10.1371/journal.pone.0040098 . PMC 3388047 . PMID 22768332.
Дальнейшее чтение
Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Х. и др. (2003). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Рез . 9 (3): 99–106 . doi : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД 12168954.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кодирующих белок человеческих кДНК». Genome Res . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 .
Zhang Q, Skepper JN, Yang F и др. (2002). «Несприны: новое семейство белков, содержащих спектриновый повтор, которые локализуются в ядерной мембране во многих тканях». J. Cell Sci . 114 (Pt 24): 4485–98 . doi :10.1242/jcs.114.24.4485. PMID 11792814.
Zhen YY, Libotte T, Munck M и др. (2003). «NUANCE, гигантский белок, соединяющий ядро и актиновый цитоскелет». J. Cell Sci . 115 (Pt 15): 3207– 22. doi :10.1242/jcs.115.15.3207. PMID 12118075.
Zhang Q, Ragnauth C, Greener MJ и др. (2003). «Несприны — это гигантские актин-связывающие белки, ортологичные мышечному белку MSP-300 Drosophila melanogaster». Genomics . 80 (5): 473– 81. doi :10.1016/S0888-7543(02)96859-X. PMID 12408964.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Heilig R, Eckenberg R, Petit JL и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ человеческой хромосомы 14». Nature . 421 (6923): 601– 7. Bibcode :2003Natur.421..601H. doi : 10.1038/nature01348 . PMID 12508121.
Schirmer EC, Florens L, Guan T и др. (2003). «Ядерные мембранные белки с потенциальными связями с заболеваниями, обнаруженные с помощью субтрактивной протеомики». Science . 301 (5638): 1380– 2. Bibcode :2003Sci...301.1380S. doi :10.1126/science.1088176. PMID 12958361. S2CID 23832536.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA и др. (2004). «Состояние, качество и расширение проекта NIH по полноразмерной ДНК: коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Zhang Q, Ragnauth CD, Skepper JN и др. (2005). «Несприн-2 — это мультиизомерный белок, который связывает ламин и эмерин в ядерной оболочке и образует субклеточную сеть в скелетных мышцах». J. Cell Sci . 118 (Pt 4): 673–87 . doi : 10.1242/jcs.01642 . PMID 15671068.
Cheng J, Kapranov P, Drenkow J, et al. (2005). «Транскрипционные карты 10 человеческих хромосом с разрешением в 5 нуклеотидов». Science . 308 (5725): 1149– 54. Bibcode :2005Sci...308.1149C. doi :10.1126/science.1108625. PMID 15790807. S2CID 13047538.
Libotte T, Zaim H, Abraham S и др. (2005). «Ламин A/C-зависимая локализация Nesprin-2, гигантского каркаса на ядерной оболочке». Mol. Biol. Cell . 16 (7): 3411– 24. doi :10.1091/mbc.E04-11-1009. PMC 1165422. PMID 15843432 .
Падмакумар В.К., Либотт Т., Лу В. и др. (2005). «Белок внутренней ядерной мембраны Sun1 опосредует прикрепление Несприна-2 к ядерной оболочке». Дж. Клеточная наука . 118 (Pt 15): 3419–30 . doi : 10.1242/jcs.02471 . ПМИД 16079285.
Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Й и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов». Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635– 48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983.
Wheeler MA, Davies JD, Zhang Q и др. (2007). «Различные функциональные домены в несприне-1альфа и несприне-2бета напрямую связываются с эмерином, и оба взаимодействия нарушаются при Х-сцепленной мышечной дистрофии Эмери–Дрейфуса». Exp. Cell Res . 313 (13): 2845– 57. doi :10.1016/j.yexcr.2007.03.025. PMID 17462627.
Эта статья о гене на человеческой хромосоме 14 — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.
