SUI1
| SUI1 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура раствора ЯМР гена yciH E. coli . | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | SUI1 | ||||||||
| Пфам | ПФ01253 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR001950 | ||||||||
| ПРОСИТ | PDOC00862 | ||||||||
| СКОП2 | 2if1 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии однодоменный белок SUI1 является фактором инициации трансляции, часто встречающимся в грибке Saccharomyces cerevisiae (пекарские дрожжи), но он также встречается в других эукариотах и прокариотах , а также в археях . Он также известен как фактор инициации трансляции эукариот 1 ( eIF1 ) у эукариот или YciH у бактерий. [1]
Функция
SUI1 — это фактор инициации трансляции , который направляет рибосому к месту начала трансляции с помощью eIF2 и инициатора Met - тРНК i Met . [2] SUI1 обеспечивает начало инициации трансляции с правильного стартового кодона (обычно AUG), стабилизируя преинициативный комплекс вокруг стартового кодона. SUI1 способствует высокой точности инициации для кодона AUG, дискриминируя не-AUG кодоны. [3]
Однако в E. coli гомолог SUI1 YciH, по-видимому, является ингибитором трансляции во время стресса. [4]
Структура
Первичная структура белка SUI1 состоит из 108 аминокислот . Домен белка имеет структуру, состоящую из семилопастного бета-пропеллера , а также содержит C-концевую альфа-спираль . [5] Гомологи SUI1 были обнаружены [6] у млекопитающих , насекомых и растений . SUI1 также эволюционно связан с белками Escherichia coli (yciH), Haemophilus influenzae (HI1225) и Methanococcus vannielii . [5]
Ссылки
- ^ Прокариотический+Инициация+Фактор-3 в Национальной медицинской библиотеке США Медицинские предметные рубрики (MeSH)
- ^ Yoon HJ, Donahue TF (январь 1992). «Локус-супрессор suil в Saccharomyces cerevisiae кодирует фактор трансляции, который функционирует во время распознавания стартового кодона тРНК (iMet)». Молекулярная и клеточная биология . 12 (1): 248– 60. doi :10.1128/mcb.12.1.248. PMC 364089. PMID 1729602.
- ^ Martin-Marcos P, Cheung YN, Hinnebusch AG (декабрь 2011 г.). «Функциональные элементы в факторах инициации 1, 1A и 2β дискриминируют плохой контекст AUG и стартовые кодоны, отличные от AUG». Молекулярная и клеточная биология . 31 (23): 4814– 31. doi :10.1128/MCB.05819-11. PMC 3232919. PMID 21930786 .
- ^ Остерман, Айова; Евфратов С.А.; Дзама, ММ; Плетнев П.И.; Ковальчук С.И.; Бутенко И.О.; Побегуц, О.В.; Головина А.Ю.; Говорун, В.М.; Богданов А.А.; Сергиев П.В.; Донцова, О.А. (2015). «Бактериальный гомолог YciH эукариотического фактора инициации трансляции eIF1 регулирует связанную со стрессом экспрессию генов и вряд ли будет участвовать в точности инициации трансляции». Биология РНК . 12 (9): 966–71 . doi : 10.1080/15476286.2015.1069464. ПМЦ 4615754 . ПМИД 26177339.
- ^ ab Herrmannová A, Daujotyte D, Yang JC, Cuchalová L, Gorrec F, Wagner S, Dányi I, Lukavsky PJ, Valásek LS (март 2012 г.). «Структурный анализ подкомплекса eIF3 выявляет консервативные взаимодействия, необходимые для стабильной и правильной сборки комплекса предварительной инициации трансляции». Nucleic Acids Research . 40 (5): 2294– 311. doi :10.1093/nar/gkr765. PMC 3300007. PMID 22090426 .
- ^ Fields C, Adams MD (январь 1994). «Экспрессированные метки последовательности идентифицируют человеческий изолог фактора инициации трансляции suil». Biochemical and Biophysical Research Communications . 198 (1): 288– 91. doi :10.1006/bbrc.1994.1040. PMID 7904817.
