STX16

STX16
Идентификаторы
Псевдонимы	STX16 , SYN16, синтаксин 16, SYN-16
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 603666; МГИ : 1923396; гомологен : 2791; Генные карты : STX16; OMA :STX16 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 20 (человек)
Конец	58,679,526 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 2 (мышь)
Конец	173,941,564 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	правая маточная труба; ; икроножный нерв; ; мозолистое тело; ; поверхностная височная артерия; ; Гипофиз; ; правое полушарие мозжечка; ; тело матки; ; Сегмент С1; ; правый яичник; ; передняя доля гипофиза;
	Верх выражен в
	рука; ; нервный слой сетчатки; ; отолитовый орган; ; мочка матки; ; тимус; ; линза; ; кора мозжечка; ; первичная зрительная кора; ; желточный мешок; ; верхняя лобная извилина;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	Активность рецептора SNAP; связывание белков; связывание синтаксина; Связывание SNARE;
Клеточный компонент	цитоплазма; неотъемлемый компонент мембраны; аппарат Гольджи; мембрана; внутриклеточная мембранно-связанная органелла; цистерна Гольджи; фокальная адгезия; транс-сеть Гольджи; комплекс SNARE; эндоплазматический ретикулум; перинуклеарная область цитоплазмы; цитозоль; транс-Гольджи сетевая мембрана; мембрана Гольджи; эндомембранная система; неотъемлемый компонент мембраны синаптических везикул;
Биологический процесс	стыковка везикул; ретроградный транспорт, эндосома в Гольджи; транспорт белков; внутриклеточный транспорт белков; слияние везикул; Формирование ленты Гольджи; везикулярно-опосредованный транспорт; транспорт;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	8675
	228960
	ENSG00000124222
	ENSMUSG00000027522
	О14662
	Q8BVI5
NM_001001433 ; NM_001001434 ; NM_001134772 ; NM_001134773 ; NM_001204868;
	NM_003763
NM_001102423 ; NM_001102424 ; NM_001102425 ; NM_172675 ; NM_001363029;
	NM_001363030 ; NM_001363031
	NP_001001433 ; NP_001128244 ; NP_001128245 ; NP_001191797 ; NP_003754
NP_001095893 ; NP_001095894 ; NP_001095895 ; NP_766263 ; NP_001349958;
	NP_001349959 ; NP_001349960
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Синтаксин-16 — это белок , который у людей кодируется геном STX16 . [ ^5]^[6]^[7]^[8]

Его связывают с псевдогипопаратиреозом типа Ib. Потеря этого гена приводит к потере метилирования в экзоне A/B GNAS1 . ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что STX16 взаимодействует с VAMP4 . ^[9]

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000124222 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000027522 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Tang BL, Low DY, Lee SS, Tan AE, Hong W (январь 1998). «Молекулярное клонирование и локализация человеческого синтаксина 16, члена семейства синтаксинов белков SNARE». Biochemical and Biophysical Research Communications . 242 (3): 673– 9. doi :10.1006/bbrc.1997.8029. PMID 9464276.
^ Симонсен А, Бремнес Б, Реннинг Э, Осланд Р, Стенмарк Х (март 1998 г.). «Синтаксин-16, предполагаемый t-SNARE Гольджи». Европейский журнал клеточной биологии . 75 (3): 223–31 . doi :10.1016/S0171-9335(98)80116-7. ПМИД 9587053.
^ ab Linglart A, Gensure RC, Olney RC, Jüppner H, Bastepe M (май 2005 г.). «Новая делеция STX16 при аутосомно-доминантном псевдогипопаратиреозе типа Ib переопределяет границы цис-действующего элемента управления импринтингом GNAS». American Journal of Human Genetics . 76 (5): 804– 14. doi :10.1086/429932. PMC 1199370 . PMID 15800843.
^ "Ген Энтреза: синтаксин 16 STX16".
^ Mallard F, Tang BL, Galli T, Tenza D, Saint-Pol A, Yue X, Antony C, Hong W, Goud B, Johannes L (февраль 2002 г.). «Ранний/рециркулирующий транспорт эндосом в TGN включает два комплекса SNARE и изоформу Rab6». Журнал клеточной биологии . 156 (4): 653– 64. doi :10.1083/jcb.200110081. PMC 2174079. PMID 11839770 .

Дальнейшее чтение

Yu Y, Zhang C, Zhou G, Wu S, Qu X, Wei H, Xing G, Dong C, Zhai Y, Wan J, Ouyang S, Li L, Zhang S, Zhou K, Zhang Y, Wu C, He F (август 2001 г.). «Профилирование экспрессии генов в печени плода человека и идентификация генов, специфичных для тканей и стадий развития, с помощью составленных профилей экспрессии и эффективного клонирования полноразмерных кДНК». Genome Research . 11 (8): 1392– 403. doi :10.1101/gr.175501. PMC 311073 . PMID 11483580.
Mallard F, Tang BL, Galli T, Tenza D, Saint-Pol A, Yue X, Antony C, Hong W, Goud B, Johannes L (февраль 2002 г.). «Ранний/рециркулирующий транспорт эндосом в TGN включает два комплекса SNARE и изоформу Rab6». Журнал клеточной биологии . 156 (4): 653– 64. doi :10.1083/jcb.200110081. PMC 2174079. PMID 11839770 .
Dulubova I, Yamaguchi T, Gao Y, Min SW, Huryeva I, Südhof TC, Rizo J (июль 2002 г.). «Как Tlg2p/syntaxin 16 'заманивает' Vps45». The EMBO Journal . 21 (14): 3620– 31. doi :10.1093/emboj/cdf381. PMC 126126. PMID 12110575 .
Кларк А.Г., Глановски С., Нильсен Р., Томас П.Д., Кежаривал А., Тодд М.А., Таненбаум Д.М., Чивелло Д., Лу Ф, Мерфи Б., Феррьера С., Ван Г., Чжэн Икс, Уайт Ти.Дж., Снински Дж.Дж., Адамс М.Д., Каргилл М. (декабрь 2003 г.). «Вывод о ненейтральной эволюции на основе трио ортологичных генов человека, шимпанзе и мыши». Наука . 302 (5652): 1960– 3. Бибкод : 2003Sci...302.1960C. дои : 10.1126/science.1088821. PMID 14671302. S2CID 6682593.
Tai G, Lu L, Wang TL, Tang BL, Goud B, Johannes L, Hong W (сентябрь 2004 г.). «Участие комплекса SNARE синтаксина 5/Ykt6/GS28/GS15 в транспорте из ранней/рециклирующей эндосомы в транс-сеть Гольджи». Молекулярная биология клетки . 15 (9): 4011– 22. doi :10.1091/mbc.E03-12-0876. PMC 515336. PMID 15215310 .
Колланд Ф, Жак Икс, Труплен В, Мужен С, Гроазело С, Гамбургер А, Мейл А, Войчик Дж, Легрен П, Готье ЖМ (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геномные исследования . 14 (7): 1324– 32. doi :10.1101/gr.2334104. ПМЦ 442148 . ПМИД 15231748.
Amessou M, Fradagrada A, Falguières T, Lord JM, Smith DC, Roberts LM, Lamaze C, Johannes L (апрель 2007 г.). «Синтаксин 16 и синтаксин 5 необходимы для эффективного ретроградного транспорта нескольких экзогенных и эндогенных грузовых белков». Journal of Cell Science . 120 (Pt 8): 1457– 68. doi :10.1242/jcs.03436. PMC 1863825 . PMID 17389686.

Эта статья о белках — заглушка . Вы можете помочь Википедии, расширив ее.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000124222 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000027522 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9464276-5] Tang BL, Low DY, Lee SS, Tan AE, Hong W (январь 1998). «Молекулярное клонирование и локализация человеческого синтаксина 16, члена семейства синтаксинов белков SNARE». Biochemical and Biophysical Research Communications . 242 (3): 673– 9. doi :10.1006/bbrc.1997.8029. PMID 9464276.

[pmid9587053-6] Симонсен А, Бремнес Б, Реннинг Э, Осланд Р, Стенмарк Х (март 1998 г.). «Синтаксин-16, предполагаемый t-SNARE Гольджи». Европейский журнал клеточной биологии . 75 (3): 223–31 . doi :10.1016/S0171-9335(98)80116-7. ПМИД 9587053.

[pmid15800843-7] Linglart A, Gensure RC, Olney RC, Jüppner H, Bastepe M (май 2005 г.). «Новая делеция STX16 при аутосомно-доминантном псевдогипопаратиреозе типа Ib переопределяет границы цис-действующего элемента управления импринтингом GNAS». American Journal of Human Genetics . 76 (5): 804– 14. doi :10.1086/429932. PMC 1199370 . PMID 15800843.

[entrez-8] "Ген Энтреза: синтаксин 16 STX16".

[pmid11839770-9] Mallard F, Tang BL, Galli T, Tenza D, Saint-Pol A, Yue X, Antony C, Hong W, Goud B, Johannes L (февраль 2002 г.). «Ранний/рециркулирующий транспорт эндосом в TGN включает два комплекса SNARE и изоформу Rab6». Журнал клеточной биологии . 156 (4): 653– 64. doi :10.1083/jcb.200110081. PMC 2174079. PMID 11839770 .