SSX2IP

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
SSX2IP
Доступные структуры
ПДБПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSSX2IP , ADIP, синовиальная саркома, белок, взаимодействующий с точкой разрыва X 2, белок, взаимодействующий с членом семейства SSX 2, hMsd1
Внешние идентификаторыОМИМ : 608690; МГИ : 2139150; гомологен : 8522; GeneCards : SSX2IP; OMA :SSX2IP — ортологи
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Энтрез
Ансамбль
UniProt
РефСек (мРНК)

NM_001166293
NM_001166294
NM_001166295
NM_001166417
NM_014021

NM_001253768
NM_001253769
NM_001253770
NM_138744
NM_001355661

RefSeq (белок)

NP_001159765
NP_001159766
NP_001159767
NP_001159889
NP_054740

NP_001240697
NP_001240698
NP_001240699
NP_620083
NP_001342590

Местоположение (UCSC)Хр 1: 84,64 – 84,69 МбХр 3: 146.11 – 146.15 Мб
Поиск в PubMed[3][4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

Белок, связывающий афадин и альфа-актинин, — это белок , который у людей кодируется геном SSX2IP . [ 5] Было показано, что он функционирует вместе с WDR8 в созревании центросомы, обеспечивая правильную длину и ориентацию веретена. [6] [7] [8] [9] [10] Комплекс SSX2IP-WDR8 дополнительно способствует стыковке ресничных пузырьков во время цилиогенеза. [11] [12]

Взаимодействия

SSX2IP был первоначально описан как белок, взаимодействующий с MLLT4 [13] и актинином альфа 1. [ 13] В контексте созревания центросомы и цилиогенеза было показано, что он взаимодействует с WDR8. [8] [9] [11]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000117155 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000036825 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Ген Энтреза: синовиальная саркома SSX2IP, белок, взаимодействующий с точкой разрыва X 2».
  6. ^ Беренц Ф., Иноуэ Д., Ёкояма Х., Тегха-Дунгху Дж., Фрейсс С., Дрегер С. и др. (июль 2013 г.). «Центриолярный сателлитный белок SSX2IP способствует созреванию центросом». Журнал клеточной биологии . 202 (1): 81–95 . doi :10.1083/jcb.201302122. ПМЦ 3704989 . ПМИД  23816619. 
  7. ^ Юкава М., Икебе С., Тода Т. (май 2015 г.). «Комплекс Msd1-Wdr8-Pkl1 прикрепляет минус-концы микротрубочек к полюсным телам веретена делящихся дрожжей». Журнал клеточной биологии . 209 (4): 549–62 . doi :10.1083/jcb.201412111. PMC 4442821. PMID  25987607 . 
  8. ^ ab Inoue D, Stemmer M, Thumberger T, Ruppert T, Bärenz F, Wittbrodt J, Gruss OJ (январь 2017 г.). "Экспрессия нового фактора сборки материнских центросом Wdr8 необходима для эмбриональных митозов позвоночных". Nature Communications . 8 : 14090. Bibcode :2017NatCo...814090I. doi :10.1038/ncomms14090. PMC 5253655 . PMID  28098238. 
  9. ^ ab Hori A, Morand A, Ikebe C, Frith D, Snijders AP, Toda T (2015-12-04). «Консервативный комплекс Wdr8-hMsd1/SSX2IP локализуется в центросоме и обеспечивает правильную длину и ориентацию веретена». Biochemical and Biophysical Research Communications . 468 ( 1– 2): 39– 45. doi :10.1016/j.bbrc.2015.10.169. PMC 4669408. PMID  26545777 . 
  10. ^ Хори А, Педди К.Дж., Коллинсон Л.М., Тода Т. (июнь 2015 г.). «Закрепление микротрубочек, зависящее от центриолярного спутника и hMsd1/SSX2IP, имеет решающее значение для сборки центриолей». Молекулярная биология клетки . 26 (11): 2005–19 . doi :10.1091/mbc.E14-11-1561. PMC 4472012. PMID  25833712 . 
  11. ^ ab Куртулмус Б., Ван В., Рупперт Т., Нойнер А., Серикан Б., Виол Л., Дуэньяс-Санчес Р., Грусс О.Дж., Перейра Г. (февраль 2016 г.). «WDR8 представляет собой центриолярный сателлит и белок, связанный с центриолами, который способствует стыковке ресничных пузырьков во время цилиогенеза». Журнал клеточной науки . 129 (3): 621–36 . doi : 10.1242/jcs.179713 . ПМИД  26675238.
  12. ^ Клингер М., Ван В., Кунс С., Беренц Ф., Дрегер-Мойрер С., Перейра Г., Грусс О.Дж. (февраль 2014 г.). «Новый центриолярный сателлитный белок SSX2IP нацеливает Cep290 на цилиарную переходную зону». Молекулярная биология клетки . 25 (4): 495–507 . doi :10.1091/mbc.E13-09-0526. ПМЦ 3923641 . ПМИД  24356449. 
  13. ^ ab Asada M, Irie K, Morimoto K, Yamada A, Ikeda W, Takeuchi M, Takai Y (февраль 2003 г.). "ADIP, новый белок, связывающий афадин и альфа-актинин, локализованный в межклеточных адгезионных соединениях". Журнал биологической химии . 278 (6): 4103– 11. doi : 10.1074/jbc.M209832200 . PMID  12446711.

Дальнейшее чтение

  • Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (февраль 1999 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Research . 6 (1): 63– 70. doi : 10.1093/dnares/6.1.63 . PMID  10231032.
  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием in vitro сайт-специфической рекомбинации». Genome Research . 10 (11): 1788– 95. doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948. PMID  11076863 .
  • Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Дж, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блёкер Х, Бауэрсакс С, Блюм Х, Лаубер Дж, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б, Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. ПМК  311072 . PMID  11230166.
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Reports . 1 (3): 287– 92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC  1083732. PMID  11256614.
  • де Брёйн Д.Р., дос Сантос Н.Р., Катер-Баатс Е., Тийссен Дж., ван ден Берк Л., Стап Дж., Балеманс М., Шепенс М., Меркс Г., ван Кессель А.Г. (июль 2002 г.). «Связанный с раком белок SSX2 взаимодействует с человеческим гомологом Ras-подобного взаимодействия ГТФазы, RAB3IP, и новым ядерным белком SSX2IP». Гены, хромосомы и рак . 34 (3): 285–98 . doi :10.1002/gcc.10073. PMID  12007189. S2CID  11734893.
  • Asada M, Irie K, Morimoto K, Yamada A, Ikeda W, Takeuchi M, Takai Y (февраль 2003 г.). "ADIP, новый белок, связывающий афадин и альфа-актинин, локализованный в межклеточных адгезионных соединениях". Журнал биологической химии . 278 (6): 4103– 11. doi : 10.1074/jbc.M209832200 . PMID  12446711.
  • Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлегер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования . 14 (10Б): 2136– 44. doi :10.1101/gr.2576704. ПМК  528930 . ПМИД  15489336.
  • Guinn BA, Bland EA, Lodi U, Liggins AP, Tobal K, Petters S, Wells JW, Banham AH, Mufti GJ (октябрь 2005 г.). «Гуморальное обнаружение антигенов, ассоциированных с лейкемией, при остром миелоидном лейкозе». Biochemical and Biophysical Research Communications . 335 (4): 1293– 304. doi :10.1016/j.bbrc.2005.08.024. PMID  16112646.
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (январь 2006 г.). "База данных LIFEdb в 2006 г.". Nucleic Acids Research . 34 (выпуск базы данных): D415-8. doi :10.1093/nar/gkj139. PMC  1347501. PMID  16381901 .
  • Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (апрель 2006 г.). «Анализ фосфопротеома митотического веретена человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (14): 5391– 6. Bibcode : 2006PNAS..103.5391N. doi : 10.1073/pnas.0507066103 . PMC  1459365. PMID  16565220 .


Взято с "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=SSX2IP&oldid=1081657186"