Белок 2, связывающий регуляторный элемент стерола

СРЕБФ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1УКЛ
Идентификаторы
Псевдонимы	SREBF2 , SREBP-2, SREBP2, bHLHd2, стерол регуляторный элемент связывающий фактор транскрипции 2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 600481; МГИ : 107585; гомологен : 20966; GeneCards : SREBF2; OMA :SREBF2 — ортологи
Расположение гена ( человек )
Хр.	Хромосома 22 (человек)
Конец	41,907,307 п.н.
Расположение гена ( Мышь )
Хр.	Хромосома 15 (мышь)
Конец	82,089,580 п.н.
Паттерн экспрессии РНК
	Верх выражен в
	ганглионарное возвышение; ; желудочковая зона; ; правое полушарие мозжечка; ; кора правого надпочечника; ; кора левого надпочечника; ; правая лобная доля; ; большеберцовый нерв; ; префронтальная кора; ; поясная извилина; ; слизистая оболочка поперечно-ободочной кишки;
	Верх выражен в
	желудочковая зона; ; губа; ; верхняя лобная извилина; ; первичная зрительная кора; ; зубчатая извилина гиппокампа гранулярная клетка образования; ; нервная трубка; ; желточный мешок; ; гранулоцит; ; нервный слой сетчатки; ; хвост эмбриона;
	Больше данных по справочным выражениям
	н/д
Генная онтология
Молекулярная функция	Активность стеролизомеразы C-8; связывание ДНК; активность димеризации белка; Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; Связывание ДНК с цис-регуляторной областью РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности; ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфичная для РНК-полимеразы II; Привязка электронного ящика; связывание белка с С-концом; связывание белков; ДНК-связывающий фактор транскрипции активность, РНК-полимераза II-специфическая;
Клеточный компонент	цитоплазма; неотъемлемый компонент мембраны; цитозоль; Комплекс SREBP-SCAP-Insig; аппарат Гольджи; мембрана эндоплазматического ретикулума; мембрана; мембрана Гольджи; эндоплазматический ретикулум; Транспортная везикулярная мембрана от ЭР к аппарату Гольджи; цитоплазматический везикула; ядро; нуклеоплазма; митохондрия; внутриклеточная мембранно-связанная органелла;
Биологический процесс	процесс метаболизма стероидов; регуляция транскрипции, ДНК-шаблонная; позитивная регуляция таргетинга белка на митохондрии; липидный обмен веществ; позитивная регуляция накопления холестерина; клеточная реакция на напряжение сдвига ламинарной жидкости; клеточный ответ на голодание; процесс метаболизма холестерина; отрицательная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; транскрипция, ДНК-шаблон; регуляция аутофагии митохондрий; отрицательная регуляция оттока холестерина; положительная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II; регуляция процесса биосинтеза холестерина; клеточный ответ на стимулирование частицами липопротеинов низкой плотности;
	Источники:Amigo/QuickGO
Ортологи
	6721
	20788
	ENSG00000198911
	ENSMUSG00000022463
	Q12772
	Q3U1N2
	NM_004599
	NM_033218
	NP_004590
	NP_150087
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок 2, связывающий регуляторный элемент стерола ( SREBP-2 ), также известный как фактор транскрипции 2, связывающий регуляторный элемент стерола ( SREBF2 ), представляет собой белок , который у людей кодируется геном SREBF2 . [ ^5]

Функция

Этот ген кодирует повсеместно экспрессируемый фактор транскрипции , который контролирует гомеостаз холестерина , стимулируя транскрипцию генов, регулируемых стеролом. Кодируемый белок содержит базовый домен спираль-петля-спираль лейциновой молнии ( bHLH-Zip ). ^[6] Были идентифицированы различные однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) SREBF2, и некоторые из них, как было обнаружено, связаны с более высоким риском остеоартрита коленного сустава . ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что SREBF2 взаимодействует с INSIG1 ^[8]^[9] и белком, связывающим CREB . ^[10]

Смотрите также

Белок, связывающий регуляторный элемент стерола

Ссылки

^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000198911 – Ensembl , май 2017 г.
^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022463 – Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Hua X, Yokoyama C, Wu J, Briggs MR, Brown MS, Goldstein JL, Wang X (декабрь 1993 г.). "SREBP-2, второй белок-молния с основной спиралью-петлей-спиралью-лейцином, который стимулирует транскрипцию путем связывания с регуляторным элементом стерола". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (24): 11603– 7. Bibcode : 1993PNAS...9011603H. doi : 10.1073/pnas.90.24.11603 . PMC 48032. PMID 7903453 .
^ "Ген Энтреза: регуляторный элемент стерола SREBF2, связывающий фактор транскрипции 2".
^ Qiu XM, Jin CT, Wang W (апрель 2014 г.). «Связь между однонуклеотидными полиморфизмами гена связывающего белка-2 регуляторного элемента стерола и риском остеоартрита колена у китайской популяции хань». Журнал международных медицинских исследований . 42 (2): 320– 8. doi : 10.1177/0300060513507392 . PMID 24496149.
^ Добросоцкая И.Ю., Голдштейн Дж.Л., Браун М.С., Роусон Р.Б. (сентябрь 2003 г.). «Восстановление регулируемого стеролами транспорта SREBP-2 из эндоплазматического ретикулума в аппарат Гольджи в клетках насекомых путем совместной экспрессии млекопитающих SCAP и Insigs». Журнал биологической химии . 278 (37): 35837– 43. doi : 10.1074/jbc.M306476200 . PMID 12842885.
^ Yang T, Espenshade PJ, Wright ME, Yabe D, Gong Y, Aebersold R, Goldstein JL, Brown MS (август 2002 г.). «Решающий шаг в гомеостазе холестерина: стерины способствуют связыванию SCAP с INSIG-1, мембранным белком, который способствует удержанию SREBP в ER». Cell . 110 (4): 489– 500. doi : 10.1016/S0092-8674(02)00872-3 . PMID 12202038. S2CID 15052132.
^ Oliner JD, Andresen JM, Hansen SK, Zhou S, Tjian R (ноябрь 1996 г.). «Транскрипционная активность SREBP опосредуется через взаимодействие с CREB-связывающим белком». Genes & Development . 10 (22): 2903– 11. doi : 10.1101/gad.10.22.2903 . PMID 8918891.

Дальнейшее чтение

Osborne TF (август 2001 г.). «СОЗДАНИЕ печени без SCAP удерживает SREBP в мембране ЭР и предотвращает повышенный синтез липидов в ответ на низкий уровень холестерина и высокий уровень инсулина». Гены и развитие . 15 (15): 1873– 8. doi : 10.1101/gad.916601 . PMID 11485982.
Szolkiewicz M, Chmielewski M, Nogalska A, Stelmanska E, Swierczynski J, Rutkowski B (январь 2007 г.). «Потенциальная роль факторов транскрипции белка, связывающего регуляторный элемент стерола, при почечной травме». Journal of Renal Nutrition . 17 (1): 62– 5. doi :10.1053/j.jrn.2006.10.009. PMID 17198935.
Hua X, Wu J, Goldstein JL, Brown MS, Hobbs HH (февраль 1995 г.). «Структура человеческого гена, кодирующего белок-1, связывающий регуляторный элемент стерола (SREBF1), и локализация SREBF1 и SREBF2 на хромосомах 17p11.2 и 22q13». Геномика . 25 (3): 667–73 . doi :10.1016/0888-7543(95)80009-B. PMID 7759101.
Yokoyama C, Wang X, Briggs MR, Admon A, Wu J, Hua X, Goldstein JL, Brown MS (октябрь 1993 г.). "SREBP-1, белок-молния с основной спиралью-петлей-спиралью-лейцином, который контролирует транскрипцию гена рецептора липопротеинов низкой плотности". Cell . 75 (1): 187– 97. doi :10.1016/S0092-8674(05)80095-9. PMID 8402897. S2CID 2784016.
Wang X, Zelenski NG, Yang J, Sakai J, Brown MS, Goldstein JL (март 1996 г.). «Расщепление белков, связывающих регуляторные элементы стеролов (SREBP), с помощью CPP32 во время апоптоза». The EMBO Journal . 15 (5): 1012– 20. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00438.x. PMC 449996. PMID 8605870.
Hua X, Sakai J, Brown MS, Goldstein JL (апрель 1996 г.). «Регулируемое расщепление белков, связывающих регуляторные элементы стерола, требует последовательностей по обе стороны мембраны эндоплазматического ретикулума». Журнал биологической химии . 271 (17): 10379– 84. doi : 10.1074/jbc.271.17.10379 . PMID 8626610.
Pai JT, Brown MS, Goldstein JL (май 1996). «Очистка и клонирование кДНК второй цистеиновой протеазы, связанной с апоптозом, которая расщепляет и активирует белки, связывающие регуляторные элементы стерола». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (11): 5437– 42. Bibcode : 1996PNAS...93.5437P. doi : 10.1073/pnas.93.11.5437 . PMC 39264. PMID 8643593 .
Sato R, Inoue J, Kawabe Y, Kodama T, Takano T, Maeda M (октябрь 1996 г.). "Стерол-зависимая транскрипционная регуляция белка-2, связывающего регуляторный элемент стерола". Журнал биологической химии . 271 (43): 26461– 4. doi : 10.1074/jbc.271.43.26461 . PMID 8900111.
Олинер Дж. Д., Андресен Дж. М., Хансен СК., Чжоу С., Тянь Р. (ноябрь 1996 г.). «Транскрипционная активность SREBP опосредуется взаимодействием с белком, связывающим CREB». Гены и развитие . 10 (22): 2903– 11. doi : 10.1101/gad.10.22.2903 . PMID 8918891.
Miserez AR, Cao G, Probst LC, Hobbs HH (февраль 1997 г.). «Структура человеческого гена, кодирующего белок 2, связывающий регуляторный элемент стерола (SREBF2)». Genomics . 40 (1): 31– 40. doi :10.1006/geno.1996.4525. PMID 9070916.
Duncan EA, Brown MS, Goldstein JL, Sakai J (май 1997). "Сайт расщепления для протеазы, регулируемой стеролом, локализованный на связи лей-сер в люменальной петле белка-2, связывающего регуляторный элемент стерола". Журнал биологической химии . 272 (19): 12778– 85. doi : 10.1074/jbc.272.19.12778 . PMID 9139737.
Harris IR, Farrell AM, Holleran WM, Jackson S, Grunfeld C, Elias PM, Feingold KR (февраль 1998 г.). «Параллельная регуляция стеролового регуляторного элемента, связывающего белок-2, и ферментов синтеза холестерина и жирных кислот, но не синтеза церамида в культивируемых кератиноцитах человека и мышином эпидермисе». Journal of Lipid Research . 39 (2): 412– 22. doi : 10.1016/S0022-2275(20)33902-X . PMID 9508001.
Kan HY, Pissios P, Chambaz J, Zannis VI (февраль 1999 г.). «Специфичность связывания ДНК и трансактивационные свойства SREBP-2, связанного с несколькими сайтами на человеческом промоторе apoA-II». Nucleic Acids Research . 27 (4): 1104– 17. doi :10.1093/nar/27.4.1104. PMC 148292. PMID 9927745 .
Сейда Н.Г., Моула С.Дж., Хамелин Дж., Мамарбачи А.М., Бенжаннет С., Туре Б.Б., Басак А., Мунцер Дж.С., Марцинкевич Дж., Чжун М., Барале Дж.К., Лазур С., Мерфи Р.А., Кретьен М., Марцинкевич М. (февраль 1999 г.). «Изозим субтилизина/кексина млекопитающих SKI-1: широко экспрессируемая пропротеинконвертаза с уникальной специфичностью расщепления и клеточной локализацией». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (4): 1321–6 . Бибкод : 1999PNAS...96.1321S. дои : 10.1073/pnas.96.4.1321 . ПМК 15461 . PMID 9990022.
Nagoshi E, Imamoto N, Sato R, Yoneda Y (июль 1999 г.). "Ядерный импорт белка-2, связывающего регуляторный элемент стерола, основного фактора транскрипции, содержащего спираль-петлю-спираль-лейциновую молнию (bHLH-Zip), происходит посредством прямого взаимодействия импортина бета с HLH-Zip". Молекулярная биология клетки . 10 (7): 2221– 33. doi :10.1091/mbc.10.7.2221. PMC 25438. PMID 10397761 .
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN, Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (декабрь 1999 г.). "Последовательность ДНК человеческой хромосомы 22". Nature . 402 (6761): 489– 95. Bibcode :1999Natur.402..489D. doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208.
DeBose-Boyd RA, Brown MS, Li WP, Nohturfft A, Goldstein JL, Espenshade PJ (декабрь 1999 г.). "Транспортно-зависимый протеолиз SREBP: перемещение протеазы сайта 1 из Гольджи в ЭР устраняет необходимость транспортировки SREBP в Гольджи". Cell . 99 (7): 703– 12. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81668-2 . PMID 10619424.
Kotzka J, Müller-Wieland D, Roth G, Kremer L, Munck M, Schürmann S, Knebel B, Krone W (январь 2000 г.). "Стерол-регуляторные связывающие элементы белки (SREBP)-1a и SREBP-2 связаны с каскадом MAP-киназы". Journal of Lipid Research . 41 (1): 99– 108. doi : 10.1016/S0022-2275(20)32079-4 . PMID 10627507.
Yang T, Goldstein JL, Brown MS (сентябрь 2000 г.). «Сверхэкспрессия мембранного домена SCAP предотвращает ингибирование стеролов выходом SCAP.SREBP из эндоплазматического ретикулума». Журнал биологической химии . 275 (38): 29881– 6. doi : 10.1074/jbc.M005439200 . PMID 10896675.

Внешние ссылки

SREBF2+белок,+человек в рубриках медицинских предметов Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
ФакторBook SREBP2

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000198911 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000022463 – Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7903453-5] Hua X, Yokoyama C, Wu J, Briggs MR, Brown MS, Goldstein JL, Wang X (декабрь 1993 г.). "SREBP-2, второй белок-молния с основной спиралью-петлей-спиралью-лейцином, который стимулирует транскрипцию путем связывания с регуляторным элементом стерола". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (24): 11603– 7. Bibcode : 1993PNAS...9011603H. doi : 10.1073/pnas.90.24.11603 . PMC 48032. PMID 7903453 .

[entrez-6] "Ген Энтреза: регуляторный элемент стерола SREBF2, связывающий фактор транскрипции 2".

[pmid_=_24496149-7] Qiu XM, Jin CT, Wang W (апрель 2014 г.). «Связь между однонуклеотидными полиморфизмами гена связывающего белка-2 регуляторного элемента стерола и риском остеоартрита колена у китайской популяции хань». Журнал международных медицинских исследований . 42 (2): 320– 8. doi : 10.1177/0300060513507392 . PMID 24496149.

[pmid12842885-8] Добросоцкая И.Ю., Голдштейн Дж.Л., Браун М.С., Роусон Р.Б. (сентябрь 2003 г.). «Восстановление регулируемого стеролами транспорта SREBP-2 из эндоплазматического ретикулума в аппарат Гольджи в клетках насекомых путем совместной экспрессии млекопитающих SCAP и Insigs». Журнал биологической химии . 278 (37): 35837– 43. doi : 10.1074/jbc.M306476200 . PMID 12842885.

[pmid12202038-9] Yang T, Espenshade PJ, Wright ME, Yabe D, Gong Y, Aebersold R, Goldstein JL, Brown MS (август 2002 г.). «Решающий шаг в гомеостазе холестерина: стерины способствуют связыванию SCAP с INSIG-1, мембранным белком, который способствует удержанию SREBP в ER». Cell . 110 (4): 489– 500. doi : 10.1016/S0092-8674(02)00872-3 . PMID 12202038. S2CID 15052132.

[pmid8918891-10] Oliner JD, Andresen JM, Hansen SK, Zhou S, Tjian R (ноябрь 1996 г.). «Транскрипционная активность SREBP опосредуется через взаимодействие с CREB-связывающим белком». Genes & Development . 10 (22): 2903– 11. doi : 10.1101/gad.10.22.2903 . PMID 8918891.